Usługa sekwencjonowania genomowego mRNA z 10 próbek tkanki płucnej kur i 10 próbek tkanki płucnej kaczek

Opis przedmiotu przetargu: Przedmiotem usługi jest otrzymanie sekwencji mRNA z 10 próbek tkanki płucnej kur i 10 próbek tkanki płucnej kaczek Usługa składa się z dwóch integralnych części: przygotowania bibliotek z powierzonego RNA całkowitego oraz sekwencjonowania na platformie Illumina NovaSeq6000 Biblioteki kierunkowe mRNA przygotowane będą przez dostawcę z RNA całkowitego dostarczonego przez zamawiającego przy użyciu oryginalnego kitu firmy Illumina TruSeq mRNA stranded. Wykonawca pokrywa koszty transportu próbek, w tym równiez transport droga lotniczą o ile taki okaże się niezbędny. Wykonawca dopuszcza do wysyłki próbek w suchym lodzie (do 10kg) Akceptowalnym materiałem wejściowym jest RNA całkowite w ilości nie mniejszej niż 1 µg wartości RIN równej lub większej 7.0. Wykonawca dokona sprawdzenia i weryfikacji wymaganych parametrów wejściowego materiału przy użyciu Bioanalyzera 2100 lub TapeStation W przypadku negatywnej weryfikacji jakości próbki/próbek, wykonawca zezwala na jednokrotne dostarczenie dodatkowego materiału na swój koszt. Sekwencjonowanie przeprowadzone zostanie na platformie Illuminy NovaSeq, w trybie odczytów sparowanych (pair-end) z minimalną długością odczytów wynoszącą 150 par zasad. Sekwencjonowanie obejmuje odczyt sekwencji 20 próbek z ilością danych >30 mln odczytów na próbkę. `