sekwencjonowanie genomowe small/total RNA z ekosomów pochodzących od psów (Canis lupus)
Opis przedmiotu przetargu: Przedmiotem zamówienia jest usługa sekwencjonowania small/total RNA z eksosomów pochodzących od psów (Canis lupus) 1. Przygotowanie bibliotek z powierzonego RNA pochodzącego z eksosomów (8 próbek): - 4 próbki small RNA (smRNA, kit: SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina, Takara), - 4 próbki total RNA (kit: SMARTer Universal Low Input RNA kit + TruSeq library construction) 2. Sekwencjonowanie 4 prób smRNA na platformie Illumina HiSeq2500, 1 ścieżka w konfiguracji 2x100 nt w trybie High Throughput Mode. 3. Po przeanalizowaniu wyników (pkt 2) decyzja zamawiającego o dalszym postępowaniu: 3.1 Sekwencjonowanie 4 prób total RNA na platformie Illumina HiSeq2500, 1 ścieżka w konfiguracji 2x100 nt w trybie High Throughput Mode lub 3.2 Sekwencjonowanie dodatkowe 4 prób smRNA na platformie Illumina HiSeq2500, 1 ścieżka w konfiguracji 2x100 nt w trybie High Throughput Mode, biblioteki total RNA odesłane do zamawiającego 4. Koszty transportu próbek transportem lotniczym ponosi wykonawca. 1. Wykonawca dopuszcza do wysyłki próbek w suchym lodzie (do 10kg) 2. Akceptowalnym materiałem wejściowym jest RNA całkowite w ilości nie mniejszej niż 50 ng 3. Wykonawca dokona sprawdzenia i weryfikacji wymaganych parametrów wejściowego materiału przy użyciu Bioanalyzera 2100 lub TapeStation. 4. W przypadku negatywnej weryfikacji jakości próbki/próbek, wykonawca zezwala na jednokrotne dostarczenie dodatkowego materiału na swój koszt. W przypadku powtórnej negatywnej weryfikacji jakości próbek obie strony odstępują od umowy bez obciążania kosztami zamawiającego. 5. Wynikom eksperymentu towarzyszyć będzie raport podsumowujący zawierający m.in.: a. Informacje na temat metody i procedury eksperymentalnej b. Informacje odnośnie analizy danych c. Zbiorcze podsumowanie eksperymentu (informacje dotyczące próbek, samego przebiegu oraz opracowanie statystyczne pozwalające na ocenę jakości sekwencjonowania i pokrycia próbek). 6. Otrzymane dane surowe poddane będą wstępnej obróbce bioinformatycznej (demultipleksingowi) przez wykonawcę. 7. Po zakończeniu eksperymentu, dane surowe w formacie FASTQ będą udostępnione zamawiającemu poprzez dedykowany serwer FTP lub poprzez jakikolwiek inny protokół umożliwiający bezpieczny tryb dostępu. 8. Na żądanie, wykonawca dostarczy dane na nośniku (SSD, HDD, pamięć USB) dostarczonym przez zamawiającego. Koszty transportu pokrywa zamawiający 9. Czas trwania usługi nie powinien przekroczyć 8 tygodni licząc od momentu pozytywnej weryfikacji próbek pod względem jakościowym i ilościowym. 10. Usługodawca gwarantuje, że wszystkie wygenerowane dane będą nieodwracalnie usunięte po maksymalnie 6 miesiącach. Dane nie będą przechowywane i absolutnie nie będą użyte na potrzeby własnych analiz. 11. W ramach usługi, usługodawca zapewnia spersonalizowany dostęp do systemu zarządzania celem weryfikacji aktualnego statusu eksperymentu. 12. W ramach usługi, zleceniodawca informowany jest na bieżąco o postępach i etapach pracy nad zleconymi próbkami poprzez regularną komunikację z laboratorium. 13. Usługa obejmuje wsparcie techniczne i opiekę techniczną nad użytkownikiem.
Gość Zamawiający | Ogłoszenie nr 510095957-N-2019 z dnia 16-05-2019 r. Państwowy Instytut Weterynaryjny - Państwowy Instytut Badawczy: sekwencjonowanie genomowe small/total RNA z ekosomów pochodzących od psów (Canis lupus) OGŁOSZENIE O UDZIELENIU ZAMÓWIENIA - Usługi Zamieszczanie ogłoszenia: obowiązkowe Ogłoszenie dotyczy: zamówienia publicznego Zamówienie dotyczy projektu lub programu współfinansowanego ze środków Unii Europejskiej nie Zamówienie było przedmiotem ogłoszenia w Biuletynie Zamówień Publicznych: tak Numer ogłoszenia: 539998-N-2019 Ogłoszenie o zmianie ogłoszenia zostało zamieszczone w Biuletynie Zamówień Publicznych: nie SEKCJA I: ZAMAWIAJĄCY I. 1) NAZWA I ADRES: Państwowy Instytut Weterynaryjny - Państwowy Instytut Badawczy, Krajowy numer identyfikacyjny 80252000000000, ul. Al. Partyzantów 57, 24-100 Puławy, woj. lubelskie, państwo Polska, tel. 818 893 000, e-mail agata.wawer@piwet.pulawy.pl, faks 818 862 595. Adres strony internetowej (url): www.piwet.pulawy.pl Adres profilu nabywcy: www.piwet.pulawy.pl I.2) RODZAJ ZAMAWIAJĄCEGO: Inny: Instytut badawczy SEKCJA II: PRZEDMIOT ZAMÓWIENIA II.1) Nazwa nadana zamówieniu przez zamawiającego: sekwencjonowanie genomowe small/total RNA z ekosomów pochodzących od psów (Canis lupus) Numer referencyjny (jeżeli dotyczy): DZ-2501/97/19 II.2) Rodzaj zamówienia: Usługi II.3) Krótki opis przedmiotu zamówienia (wielkość, zakres, rodzaj i ilość dostaw, usług lub robót budowlanych lub określenie zapotrzebowania i wymagań ) a w przypadku partnerstwa innowacyjnego - określenie zapotrzebowania na innowacyjny produkt, usługę lub roboty budowlane: Przedmiotem zamówienia jest usługa sekwencjonowania small/total RNA z eksosomów pochodzących od psów (Canis lupus) 1. Przygotowanie bibliotek z powierzonego RNA pochodzącego z eksosomów (8 próbek): - 4 próbki small RNA (smRNA, kit: SMARTer smRNA-Seq Kit for Illumina, Takara), - 4 próbki total RNA (kit: SMARTer Universal Low Input RNA kit + TruSeq library construction) 2. Sekwencjonowanie 4 prób smRNA na platformie Illumina HiSeq2500, 1 ścieżka w konfiguracji 2x100 nt w trybie High Throughput Mode. 3. Po przeanalizowaniu wyników (pkt 2) decyzja zamawiającego o dalszym postępowaniu: 3.1 Sekwencjonowanie 4 prób total RNA na platformie Illumina HiSeq2500, 1 ścieżka w konfiguracji 2x100 nt w trybie High Throughput Mode lub 3.2 Sekwencjonowanie dodatkowe 4 prób smRNA na platformie Illumina HiSeq2500, 1 ścieżka w konfiguracji 2x100 nt w trybie High Throughput Mode, biblioteki total RNA odesłane do zamawiającego 4. Koszty transportu próbek transportem lotniczym ponosi wykonawca. 1. Wykonawca dopuszcza do wysyłki próbek w suchym lodzie (do 10kg) 2. Akceptowalnym materiałem wejściowym jest RNA całkowite w ilości nie mniejszej niż 50 ng 3. Wykonawca dokona sprawdzenia i weryfikacji wymaganych parametrów wejściowego materiału przy użyciu Bioanalyzera 2100 lub TapeStation. 4. Wprzypadku negatywnej weryfikacji jakości próbki/próbek, wykonawca zezwala na jednokrotne dostarczenie dodatkowego materiału na swój koszt. W przypadku powtórnej negatywnej weryfikacji jakości próbek obie strony odstępują od umowy bez obciążania kosztami zamawiającego. 5. Wynikom eksperymentu towarzyszyć będzie raport podsumowujący zawierający m.in.: a. Informacje na temat metody i procedury eksperymentalnej b. Informacje odnośnie analizy danych c. Zbiorcze podsumowanie eksperymentu (informacje dotyczące próbek, samego przebiegu oraz opracowanie statystyczne pozwalające na ocenę jakości sekwencjonowania i pokrycia próbek). 6. Otrzymane dane surowe poddane będą wstępnej obróbce bioinformatycznej (demultipleksingowi) przez wykonawcę. 7. Po zakończeniu eksperymentu, dane surowe w formacie FASTQ będą udostępnione zamawiającemu poprzez dedykowany serwer FTP lub poprzez jakikolwiek inny protokół umożliwiający bezpieczny tryb dostępu. 8. Na żądanie, wykonawca dostarczy dane na nośniku (SSD, HDD, pamięć USB) dostarczonym przez zamawiającego. Koszty transportu pokrywa zamawiający 9. Czas trwania usługi nie powinien przekroczyć 8 tygodni licząc od momentu pozytywnej weryfikacji próbek pod względem jakościowym i ilościowym. 10. Usługodawca gwarantuje, że wszystkie wygenerowane dane będą nieodwracalnie usunięte po maksymalnie 6 miesiącach. Dane nie będą przechowywane i absolutnie nie będą użyte na potrzeby własnych analiz. 11. W ramach usługi, usługodawca zapewnia spersonalizowany dostęp do systemu zarządzania celem weryfikacji aktualnego statusu eksperymentu. 12. W ramach usługi, zleceniodawca informowany jest na bieżąco o postępach i etapach pracy nad zleconymi próbkami poprzez regularną komunikację z laboratorium. 13. Usługa obejmuje wsparcie techniczne i opiekę techniczną nad użytkownikiem. II.4) Informacja o częściach zamówienia: Zamówienie było podzielone na części: nie II.5) Główny Kod CPV: 73111000-3 SEKCJA III: PROCEDURA III.1) TRYB UDZIELENIA ZAMÓWIENIA Przetarg nieograniczony III.2) Ogłoszenie dotyczy zakończenia dynamicznego systemu zakupów nie III.3) Informacje dodatkowe: SEKCJA IV: UDZIELENIE ZAMÓWIENIA
IV.9) UZASADNIENIE UDZIELENIA ZAMÓWIENIA W TRYBIE NEGOCJACJI BEZ OGŁOSZENIA, ZAMÓWIENIA Z WOLNEJ RĘKI ALBO ZAPYTANIA O CENĘ IV.9.1) Podstawa prawna Postępowanie prowadzone jest w trybie na podstawie art. ustawy Pzp. IV.9.2) Uzasadnienie wyboru trybu Należy podać uzasadnienie faktyczne i prawne wyboru trybu oraz wyjaśnić, dlaczego udzielenie zamówienia jest zgodne z przepisami. | ||||
Copyright © 2010 Urząd Zamówień Publicznych |
Dane postępowania
ID postępowania BZP/TED: | 539998-N-2019 |
---|---|
ID postępowania Zamawiającego: | DZ-2501/97/19 |
Data publikacji zamówienia: | 2019-04-19 |
Rodzaj zamówienia: | usługi |
Tryb& postępowania [PN]: | Przetarg nieograniczony |
Czas na realizację: | 56 dni |
Wadium: | - |
Oferty uzupełniające: | NIE |
Oferty częściowe: | NIE |
Oferty wariantowe: | NIE |
Przewidywana licyctacja: | NIE |
Ilość części: | 1 |
Kryterium ceny: | 90% |
WWW ogłoszenia: | www.piwet.pulawy.pl |
Informacja dostępna pod: | www.piwet.pulawy.pl |
Okres związania ofertą: | 30 dni |
Kody CPV
73111000-3 | Laboratoryjne usługi badawcze |
Wyniki
Nazwa części | Wykonawca | Data udzielenia | Wartość |
---|---|---|---|
sekwencjonowanie genomowe small/total RNA z ekosomów pochodzących od psów (Canis lupus) | Marcogen Inc. Seoul | 2019-05-15 | 38 700,00 |
Barometr Ryzyka NadużyćRaport końcowy na temat potencjalnego ryzyka nadużyć dla wskazanej części wyniku postępowania przetargowego. Data udzielenia: 2019-05-15 Dotyczy cześci nr: 0 Kody CPV: 73111000-3 Ilość podmiotów składających się na wykonawcę: 1 Kwota oferty w PLN: 38 701,00 zł Minimalna złożona oferta: 38 701,00 zł Ilość złożonych ofert: 1 Ilość ofert odrzuconych przez zamawiającego: 0 Minimalna złożona oferta: 38 701,00 zł Maksymalna złożona oferta: 38 701,00 zł |