Dostawa oprogramowania specjalistycznego; UM-ZP-262-83/11

Lublin: Dostawa oprogramowania specjalistycznego; UM-ZP-262-83/11


Numer ogłoszenia: 244255 - 2011; data zamieszczenia: 13.09.2011

OGŁOSZENIE O ZAMÓWIENIU - dostawy

Zamieszczanie ogłoszenia:
obowiązkowe.

Ogłoszenie dotyczy:
zamówienia publicznego.

SEKCJA I: ZAMAWIAJĄCY

I. 1) NAZWA I ADRES:
Uniwersytet Medyczny w Lublinie , Al. Racławickie 1, 20-059 Lublin, woj. lubelskie, tel. 81 528 88 88, faks 81 528 89 18.

• 
  Adres strony internetowej zamawiającego:
  www.am.lublin.pl

I. 2) RODZAJ ZAMAWIAJĄCEGO:
Uczelnia publiczna.

SEKCJA II: PRZEDMIOT ZAMÓWIENIA

II.1) OKREŚLENIE PRZEDMIOTU ZAMÓWIENIA

II.1.1) Nazwa nadana zamówieniu przez zamawiającego:
Dostawa oprogramowania specjalistycznego; UM-ZP-262-83/11.

II.1.2) Rodzaj zamówienia:
dostawy.

II.1.3) Określenie przedmiotu oraz wielkości lub zakresu zamówienia:
1. Przedmiotem zamówienia jest: dostawa oprogramowania specjalistycznego ujętego w Projekcie pn. Wyposażenie innowacyjnych laboratoriów prowadzących badania nad nowymi lekami stosowanymi w terapii chorób cywilizacyjnych i nowotworowych. W/w przedmiot zamówienia będzie realizowany w czterech następujących zadaniach:: Zadanie nr 1 - Oprogramowanie ( Hybot-Plus lub równoważny) do obliczania lipofilowości - 1 szt. Zadanie nr 2 - Program do modelowania struktur biłakowych i ich analizy (Fujitsu) lub równoważny - 1 szt. Zadanie nr 3 - Sieciowy program do modelowania struktur (Scigress) lub równoważny - 10 szt. Zadanie nr 4 - Program do modelowania małych cząsteczek i analizy konformacyjnej ( Spartan lub Tytan) lub równoważny - 1 szt. 2. Oferowany przez Wykonawcę przedmiot zamówienia ( oprogramowania ) musi spełniać parametry techniczne i użytkowe, możliwości zastosowania i funkcjonalności - zawarte w niniejszej SIWZ. 3. Zamawiający wymaga zaoferowania przedmiotu zamówienia nowego, kompletnego i gotowego do użycia ( tj. bez żadnych zbędnych i dodatkowych inwestycji). 4. Ilekroć w opisie przedmiotu zamówienia zawartym w SIWZ wskazane zostały normy , znaki towarowe, patenty lub pochodzenie, zamawiający dopuszcza rozwiązania równoważne. 5. Za ofertę równoważną Zamawiający uzna tę która spełnia wszystkie wymagania Zamawiającego (m.in. pod względem funkcjonalność, zawartość, możliwości) określone w opisie przedmiotu zamówienia zawartym w rozdziale IV SIWZ 6. W przypadku zaoferowania oprogramowania równoważnego przez Wykonawcę, Zamawiający wymaga dostarczenia próbek w postaci płyt CD/DVD zawierającej wersję demonstarcyjną oprogramowania zapewniającą pełny dostęp do wszystkich funkcji oprogramowania. 7. Ewentualne wskazanie przez Zamawiającego nazwy produktu lub nazwy producenta ma na celu, określenie klasy produktu będącego przedmiotem zamówienia i służy ustaleniu standardu; nie wskazują natomiast na konkretny wyrób lub konkretnego producenta. 8. Wykonawca który powoła się na rozwiązania równoważne jest zobowiązany wskazać że oferowany przez niego przedmiot zamówienia spełnia wymagania określone przez Zamawiającego.

II.1.4) Czy przewiduje się udzielenie zamówień uzupełniających:
nie.

II.1.5) Wspólny Słownik Zamówień (CPV):
48.46.10.00-7.

II.1.6) Czy dopuszcza się złożenie oferty częściowej:
tak, liczba części: 4.

II.1.7) Czy dopuszcza się złożenie oferty wariantowej:
nie.

II.2) CZAS TRWANIA ZAMÓWIENIA LUB TERMIN WYKONANIA:
Okres w dniach: 56.

SEKCJA III: INFORMACJE O CHARAKTERZE PRAWNYM, EKONOMICZNYM, FINANSOWYM I TECHNICZNYM

III.1) WADIUM

Informacja na temat wadium:
nie dotyczy

III.2) ZALICZKI

• 
  Czy przewiduje się udzielenie zaliczek na poczet wykonania zamówienia:
  nie

III.3) WARUNKI UDZIAŁU W POSTĘPOWANIU ORAZ OPIS SPOSOBU DOKONYWANIA OCENY SPEŁNIANIA TYCH WARUNKÓW

• 
  III. 3.1) Uprawnienia do wykonywania określonej działalności lub czynności, jeżeli przepisy prawa nakładają obowiązek ich posiadania
  

  
  Opis sposobu dokonywania oceny spełniania tego warunku
  

  • Oświadczenie Wykonawcy

• 
  III.3.2) Wiedza i doświadczenie
  

  
  Opis sposobu dokonywania oceny spełniania tego warunku
  

  • Oświadczenie Wykonawcy

• 
  III.3.3) Potencjał techniczny
  

  
  Opis sposobu dokonywania oceny spełniania tego warunku
  

  • Oświadczenie Wykonawcy

• 
  III.3.4) Osoby zdolne do wykonania zamówienia
  

  
  Opis sposobu dokonywania oceny spełniania tego warunku
  

  • Oświadczenie Wykonawcy

• 
  III.3.5) Sytuacja ekonomiczna i finansowa
  

  
  Opis sposobu dokonywania oceny spełniania tego warunku
  

  • Oświadczenie Wykonawcy

III.4) INFORMACJA O OŚWIADCZENIACH LUB DOKUMENTACH, JAKIE MAJĄ DOSTARCZYĆ WYKONAWCY W CELU POTWIERDZENIA SPEŁNIANIA WARUNKÓW UDZIAŁU W POSTĘPOWANIU ORAZ NIEPODLEGANIA WYKLUCZENIU NA PODSTAWIE ART. 24 UST. 1 USTAWY

• 
  III.4.1) W zakresie wykazania spełniania przez wykonawcę warunków, o których mowa w art. 22 ust. 1 ustawy, oprócz oświadczenia o spełnieniu warunków udziału w postępowaniu, należy przedłożyć:
  

• 
  III.4.2) W zakresie potwierdzenia niepodlegania wykluczeniu na podstawie art. 24 ust. 1 ustawy, należy przedłożyć:
  

  • oświadczenie o braku podstaw do wykluczenia
  • aktualny odpis z właściwego rejestru, jeżeli odrębne przepisy wymagają wpisu do rejestru, w celu wykazania braku podstaw do wykluczenia w oparciu o art. 24 ust. 1 pkt 2 ustawy, wystawiony nie wcześniej niż 6 miesięcy przed upływem terminu składania wniosków o dopuszczenie do udziału w postępowaniu o udzielenie zamówienia albo składania ofert, a w stosunku do osób fizycznych oświadczenie w zakresie art. 24 ust. 1 pkt 2 ustawy
  • wykonawca powołujący się przy wykazywaniu spełniania warunków udziału w postępowaniu na potencjał innych podmiotów, które będą brały udział w realizacji części zamówienia, przedkłada także dokumenty dotyczące tego podmiotu w zakresie wymaganym dla wykonawcy, określonym w pkt III.4.2.

• III.4.3) Dokumenty podmiotów zagranicznych

  Jeżeli wykonawca ma siedzibę lub miejsce zamieszkania poza terytorium Rzeczypospolitej Polskiej, przedkłada:

  III.4.3.1) dokument wystawiony w kraju, w którym ma siedzibę lub miejsce zamieszkania potwierdzający, że:

  • nie otwarto jego likwidacji ani nie ogłoszono upadłości - wystawiony nie wcześniej niż 6 miesięcy przed upływem terminu składania wniosków o dopuszczenie do udziału w postępowaniu o udzielenie zamówienia albo składania ofert

III.5) INFORMACJA O DOKUMENTACH POTWIERDZAJĄCYCH, ŻE OFEROWANE DOSTAWY , USŁUGI LUB ROBOTY BUDOWLANE ODPOWIADAJĄ OKREŚLONYM WYMAGANIOM

W zakresie potwierdzenia, że oferowane dostawy, usługi lub roboty budowlane odpowiadają określonym wymaganiom należy przedłożyć:

• próbki, opisy lub fotografie

III.6) INNE DOKUMENTY

Inne dokumenty niewymienione w pkt III.4) albo w pkt III.5)

1. Jeżeli w miejscu zamieszkania osoby lub w kraju, którym Wykonawca ma siedzibę lub miejsce zamieszkania, nie wydaje się dokumentów, o których mowa w pkt. III.4.3.1, zastępuje się je dokumentem zawierającym oświadczenie złożone przed notariuszem, właściwym organem sądowym, administracyjnym albo organem samorządu zawodowego lub gospodarczego odpowiednio miejsca zamieszkania osoby lub kraju, w którym Wykonawca ma siedzibę lub miejsce zamieszkania. Zapis pkt. III.4.3.1. stosuje się odpowiednio. Dokument ten winien być wystawiony nie wcześniej niż 6 miesięcy przed upływem terminu składania ofert. 2. Jeżeli Wykonawca, polega na wiedzy i doświadczeniu, potencjale technicznym, osobach zdolnych do wykonania zamówienia lub zdolnościach finansowych innych podmiotów, to zobowiązany jest również przedłożyć: 2.1. Pisemne zobowiązanie tych podmiotów do oddania mu do dyspozycji niezbędnych zasobów na okres korzystania z nich przy wykonywaniu zamówienia; 2.2. Oświadczenie i dokumenty dotyczące tych podmiotów, wymienione w punkcie III.4.2.

III.7) Czy ogranicza się możliwość ubiegania się o zamówienie publiczne tylko dla wykonawców, u których ponad 50 % pracowników stanowią osoby niepełnosprawne:
nie

SEKCJA IV: PROCEDURA

IV.1) TRYB UDZIELENIA ZAMÓWIENIA

IV.1.1) Tryb udzielenia zamówienia:
przetarg nieograniczony.

IV.2) KRYTERIA OCENY OFERT

IV.2.1) Kryteria oceny ofert:
najniższa cena.

IV.2.2) Czy przeprowadzona będzie aukcja elektroniczna:
nie.

IV.3) ZMIANA UMOWY

Czy przewiduje się istotne zmiany postanowień zawartej umowy w stosunku do treści oferty, na podstawie której dokonano wyboru wykonawcy:
tak

Dopuszczalne zmiany postanowień umowy oraz określenie warunków zmian

1. Zmiana postanowień niniejszej Umowy może nastąpić w formie pisemnego aneksu pod rygorem nieważności, w następujących sytuacjach: 1.1. aktualizacji rozwiązań ze względu na postęp techniczny lub technologiczny (np. wycofanie z obrotu urządzeń lub materiałów), zmiana nie może spowodować zmiany ceny oraz obniżenia parametrów technicznych, jakościowych i innych wynikających z oferty, na podstawie których był dokonany wybór Wykonawcy; 1.2. konieczności zmiany terminu realizacji przedmiotu umowy z przyczyn niezawinionych przez Strony, zmiana nie może spowodować zmiany ceny wynikającej z oferty Wykonawcy; 1.3. zmiany obowiązujących przepisów, jeżeli konieczne będzie dostosowanie treści umowy do aktualnego stanu prawnego; 1.4. zmiany stawki podatku od towarów i usług; wartość umowy określona w §5 ust. 1 umowy ulegnie zmniejszeniu w przypadku obniżenia stawki podatku od towarów i usług lub powiększeniu w przypadku podwyższenia stawki podatku od towarów i usług; 1.5. konieczności zmiany osób wskazanych w § 3 ust. 7; 1.6. zaistnienia okoliczności (technicznych, gospodarczych itp.) których nie można było przewidzieć w chwili zawarcia umowy; 1.7. wystąpienia zdarzeń siły wyższej jako zdarzenia zewnętrznego, niemożliwego do przewidzenia i niemożliwego do zapobieżenia; 1.8. wprowadzenia nowej technologii, lub innych okoliczności pozwalających na obniżenie ceny przedmiotu umowy, Wykonawca może ją odpowiednio obniżyć; 1.9. wprowadzenia nowej technologii produktu objętego przedmiotową umową, wówczas Zamawiający dopuszcza jego zastąpienie jedynie produktem równoważnym lub o wyższych parametrach jakościowych, o cenie nie wyższej niż w umowie. Inicjatorem zmian może być Zamawiający lub Wykonawca poprzez pisemne wystąpienie w okresie obowiązywania umowy zawierające uzasadnienie proponowanych zmian.

IV.4) INFORMACJE ADMINISTRACYJNE

IV.4.1)
 
Adres strony internetowej, na której jest dostępna specyfikacja istotnych warunków zamówienia:
www.umlub.pl

Specyfikację istotnych warunków zamówienia można uzyskać pod adresem:
1) Uniwersytet Medyczny w Lublinie; Al. Racławickie 1, kod 20-059 2) Łukasz Rymarz, e mail: l.rymarz@umlub.pl, tel. (81) 528-89-67, fax. (81) 528-89-54;..

IV.4.4) Termin składania wniosków o dopuszczenie do udziału w postępowaniu lub ofert:
22.09.2011 godzina 10:30, miejsce: 20 - 059 Lublin; Al. Racławickie 1, pokój nr 22 (Kancelaria Ogólna).

IV.4.5) Termin związania ofertą:
okres w dniach: 30 (od ostatecznego terminu składania ofert).

IV.4.16) Informacje dodatkowe, w tym dotyczące finansowania projektu/programu ze środków Unii Europejskiej:
Umowa nr POPW.01.03.00-06-013/09-00 Tytuł projektu: Wyposażenie innowacyjnych laboratoriów prowadzących badania nad nowymi lekami stosowanymi w terapii chorób cywilizacyjnych i nowotworowych Program Operacyjny: Rozwój Polski Wschodniej 2007-2013 Priorytet I, Działanie I.3.

IV.4.17) Czy przewiduje się unieważnienie postępowania o udzielenie zamówienia, w przypadku nieprzyznania środków pochodzących z budżetu Unii Europejskiej oraz niepodlegających zwrotowi środków z pomocy udzielonej przez państwa członkowskie Europejskiego Porozumienia o Wolnym Handlu (EFTA), które miały być przeznaczone na sfinansowanie całości lub części zamówienia:
nie

ZAŁĄCZNIK I - INFORMACJE DOTYCZĄCE OFERT CZĘŚCIOWYCH

CZĘŚĆ Nr:
1
NAZWA:
Zadanie nr 1.

• 
  1) Krótki opis ze wskazaniem wielkości lub zakresu zamówienia:
  Zadanie nr 1 - Oprogramowanie ( Hybot-Plus) do obliczania lipofilowości lub równoważny - 1 szt. Kryteria równoważności dla programu Hybot-Plus Oprogramowanie do obliczania lipofilowości 1. Krótkie omówienie przedmiotu zamówienia: Zamówienie obejmuje zakup programu Hybot Plus, lub równoważnego, do obliczania i analizy termodynamicznej wiązań wodorowych tworzonych przez cząsteczki małych ligandów dla celów białkowych. Oprogramowanie powinno współpracować z komputerem o minimalnej konfiguracji: Intel Pentium III lub wyższe/AMD Athlon; 2 GB RAM; 60 GB wolnego miejsca na dysku HD; Internet Explorer 6 lub późniejszy; 1024x768 rozdzielczości ekranu monitora, oraz systemami - Win XP, Vista lub Win 7. 2. Oprogramowanie powinno zawierać: 2.1. Program komputerowy do analizy wiązań wodorowych cząsteczek związków chemicznych w oparciu o strukturę trójwymiarową; 2.2. Bazę danych eksperymentalnych pomiarów termodynamicznych wiązań wodorowych (musi zawierać nie mniej niż 13 500 kompleksów wiązań wodorowych); 2.3. Bazę danych parametrów wiązania wodorowe (musi zawierać nie mnie niż 60 000 parametrów); 3. Oprogramowanie powinno umożliwiać: 3.1. Tworzenie i optymalizację struktur trójwymiarowych związków chemicznych; 3.2. Przeszukiwanie wewnętrznych baz danych pod względem struktur lub podstruktur; 3.3. Tworzenie własnych baz danych; 3.4. Dodawanie nowych struktur do istniejących baz danych; 3.5. Import struktur z innych baz danych (format *.sdf); 3.6. Eksport struktur do innych baz danych (format *.sdf); 3.7. Obliczanie parametrów termodynamicznych (co najmniej swobodna energia i entalpia) dla różnych kompleksów wiązań wodorowych w różnych rozpuszczalnikach; 3.8. Obliczanie parametrów wiązań wodorowych w oparciu o bazę danych lub estymację struktury; 3.9. Obliczanie polaryzowalności oraz rozkładów cząstkowych ładunków atomowych; 3.10. Tworzenie korelacji z parametrami wiązań wodorowych w oparciu o istniejące zestawy testowe; 3.11. Druk wszelkich danych dotyczących związków lub danych zawartych w wewnętrznych bazach danych;.

• 
  2) Wspólny Słownik Zamówień (CPV):
  48.46.10.00-7.

• 
  3) Czas trwania lub termin wykonania:
  Okres w dniach: 56.

• 
  4) Kryteria oceny ofert:
  najniższa cena.

CZĘŚĆ Nr:
2
NAZWA:
Zadanie nr 2.

• 
  1) Krótki opis ze wskazaniem wielkości lub zakresu zamówienia:
  Zadanie nr 2 - Program do modelowania struktur białkowych i ich analizy (Fujitsu) lub równoważny - 1 szt. Kryteria równoważności dla programu Fujitsu Program do modelowania struktur białkowych i ich analizy 1. Krótkie omówienie przedmiotu zamówienia: Zamówienie obejmuje zakup programu Fujitsu - Scigress, lub równoważnego, do modelowania struktur białkowych i ich analizy. Program powinien umożliwiać także modelowanie małych cząsteczek oraz analizę oddziaływań pomiędzy ligandami i białkami. Oprogramowanie powinno współpracować z komputerem o minimalnej konfiguracji: Intel Pentium III lub wyższe/AMD Athlon; 2 GB RAM; 60 GB wolnego miejsca na dysku HD; Internet Explorer 6 lub późniejszy; 1024x768 rozdzielczości ekranu monitora, oraz systemami - Win XP, Vista lub Win 7. 2. Oprogramowanie powinno zawierać: 2.1. Moduł podstawowy - obejmujący główny interfejs, moduł mechaniki i dynamiki molekularnej, moduł dokowania (FastDock), moduł obliczeniowy (DGauss), moduł obliczeń półempirycznych (ZINDO i Extended Huckel); 2.2. Moduł do analizy zależności struktura-aktywność (SpreadSheet - obejmujący interfejs obliczeniowy oraz moduł QSAR i QSPR); 2.3. Moduł do analizy konformacyjnej (ConFlex3, ConFlex6); 2.4. Moduł do obliczeń półempirycznych orbitali molekularnych (MO-G i MOPAC 2009); 2.5. Moduł do obliczeń dynamiką molekularną (MD i ME pozwalający na obliczenia dla cząsteczek zawierających fragmenty organiczne i nieorganiczne); 2.6. Moduł do obliczeń ab initio z wykorzystaniem funkcjonałów gęstości (ADF i PHASE). 2.7. Moduły do obliczeń w środowisku Windows. 3. Oprogramowanie powinno umożliwiać: 3.1. Generowanie struktur trójwymiarowych związków organicznych, nieorganicznych i mieszanych,; 3.2. Generowanie struktur makrocząsteczek (do 20000 atomów); 3.3. Optymalizację struktur małych cząsteczek i makromolekuł; 3.4. Dokowanie struktur związków aktywnych do makromolekuł. 3.5. Ilościową analizę zależności struktura-aktywność; 3.6. Obsługa formatów - MDL Mol, SDF, PDB, Materials Explorer (bdl, inp, sim), MO-G output, MOPAC output, SCIGRESS Crystal Structure (xsf), CIF, XMol XYZ (xyz), Gaussian Checkpoint (fchk), CambridgeSoft (cdx, cdxmk, c3xml), Tripos Mol2, ShelX; 3.7. Obsługę metod modelowania z poziomu - mechaniki molekularnej (podstawowe pola siłowe MM2 i MM3, oraz dodatkowe: AMBER, CC, Dreiding, KKY, Klein-McDonald, Organic, MM2, MOMEC, OPLS, SPC, TIP (dla związków organicznych); Born-Mayer-Huggins, Erkoc, Johnson, Kawamura, Lennard-Jones, Morse, Justo, Marks, Stillinger-Weber, Tersoff, Ackland, Finnis-Sinclair, Grujicic-Zhou, long range Finnis-Sinclair, Oh-Johnson, Rosato-Guillop-Legrand, tight binding, Voter-Chen, Yang-Johnson (dla związków nieorganicznych), CFF, UFF (dla innych); metod półempirycznych (PDDG/NDDO, MNDO, MNDO/3, MNDO-d, Extended Huckel, ZINDO, INDO/S, CNDO/S, CNDO/S2, CNDO/S3, CNDO/2, AM1, PM3,PM5, RM1); metod ab initio w przybliżeniu HF lub funkcjonałami gęstości (ADF, PHASE); 3.8. Obliczanie - energii całkowitej, ciepła tworzenia, energii minimum lokalnego i globalnego; geometrii stanu przejściowego i rzeczywistych koordynat reakcji; parametrów widm IR, UV-VIS; profili energetycznych dla specyficznych koordynat geometrycznych; ładunków atomowych (Mulikena, z rozkładu naturalnego, elektrostatycznych z rozkładu potencjału); parametrów termodynamicznych (entalpia, entropia, energia swobodna; parametrów elektronowych (dipol, polaryzowalność); energie solwatacji; 3.9. Analizę rozkładu konformerów, tworzenie bibliotek konformerów;.

• 
  2) Wspólny Słownik Zamówień (CPV):
  48.46.10.00-7.

• 
  3) Czas trwania lub termin wykonania:
  Okres w dniach: 56.

• 
  4) Kryteria oceny ofert:
  najniższa cena.

CZĘŚĆ Nr:
3
NAZWA:
Zadanie nr 3.

• 
  1) Krótki opis ze wskazaniem wielkości lub zakresu zamówienia:
  Zadanie nr 3 - Sieciowy program do modelowania struktur (Scigress) lub równoważny - 10 szt. Kryteria równoważności dla programu Scigress Sieciowy program do modelowania struktur 1. Krótkie omówienie przedmiotu zamówienia: Zamówienie obejmuje zakup 10 stanowiskowej licencji programu Scigress, lub równoważnego, do modelowania małych cząsteczek i ich analizy. Oprogramowanie powinno współpracować z komputerem o minimalnej konfiguracji: Intel Pentium III lub wyższe/AMD Athlon; 2 GB RAM; 60 GB wolnego miejsca na dysku HD; Internet Explorer 6 lub późniejszy; 1024x768 rozdzielczości ekranu monitora, oraz systemami - Win XP, Vista lub Win 7. 2. Oprogramowanie powinno zawierać: 2.1. Moduł podstawowy - obejmujący główny interfejs, moduł mechaniki i dynamiki molekularnej, moduł dokowania (FastDock), moduł obliczeniowy (DGauss), moduł obliczeń półempirycznych (ZINDO i Extended Huckel); 2.2. Moduł do analizy zależności struktura-aktywność (SpreadSheet - obejmujący interfejs obliczeniowy oraz moduł QSAR i QSPR); 2.3. Moduł do obliczeń półempirycznych orbitali molekularnych (MO-G i MOPAC 2009); 3. Oprogramowanie powinno umożliwiać: 3.1. Generowanie struktur trójwymiarowych związków organicznych, nieorganicznych i mieszanych,; 3.2. Generowanie struktur makrocząsteczek (do 20000 atomów); 3.3. Optymalizację struktur małych cząsteczek i makromolekuł; 3.4. Dokowanie struktur związków aktywnych do makromolekuł. 3.5. Ilościową analizę zależności struktura-aktywność; 3.6. Obsługa formatów - MDL Mol, Mol2, SDF, PDB, MO-G output, MOPAC output, CIF, XMol XYZ (xyz), Gaussian Checkpoint (fchk), CambridgeSoft (cdx, cdxmk, c3xml), ShelX; 3.7. Obsługę metod modelowania z poziomu - mechaniki molekularnej (pola siłowe MM2 i MM3); metod półempirycznych (MNDO, MNDO/3, MNDO-d, Extended Huckel, AM1, PM3, MO-G); 3.8. Obliczanie - energii całkowitej, ciepła tworzenia, energii minimum lokalnego i globalnego; geometrii stanu przejściowego i rzeczywistych koordynat reakcji; parametrów widm IR, UV-VIS; profili energetycznych dla specyficznych koordynat geometrycznych; ładunków atomowych (Mulikena, z rozkładu naturalnego, elektrostatycznych z rozkładu potencjału); parametrów termodynamicznych (entalpia, entropia, energia swobodna; parametrów elektronowych (dipol, polaryzowalność); energie solwatacji;.

• 
  2) Wspólny Słownik Zamówień (CPV):
  48.46.10.00-7.

• 
  3) Czas trwania lub termin wykonania:
  Okres w dniach: 56.

• 
  4) Kryteria oceny ofert:
  najniższa cena.

CZĘŚĆ Nr:
4
NAZWA:
Zadanie nr 4.

• 
  1) Krótki opis ze wskazaniem wielkości lub zakresu zamówienia:
  Zadanie nr 4 - Program do modelowania małych cząsteczek i analizy konformacyjnej ( Spartan lub Tytan) lub równoważny - 1 szt. Kryteria równoważności dla programu Spartan lub Tytan Program do modelowania małych cząsteczek i analizy konformacyjnej 1. Krótkie omówienie przedmiotu zamówienia: Zamówienie obejmuje zakup programu SPARTAN 10, lub równoważnego, do modelowania struktury trójwymiarowej związków chemicznych oraz analizy konformacyjnej tych związków. Oprogramowanie powinno współpracować z komputerem o minimalnej konfiguracji: Intel Pentium III lub wyższe/AMD Athlon; 2 GB RAM; 60 GB wolnego miejsca na dysku HD; Internet Explorer 6 lub późniejszy; 1024x768 rozdzielczości ekranu monitora, oraz systemami - Win XP, Vista lub Win 7. 2. Oprogramowanie powinno zawierać: 2.1. Moduł umożliwiający generowanie struktur trójwymiarowych związków chemicznych w oparciu o metodykę de novo lub metodę fragmentów; 2.2. Moduł umożliwiający optymalizację geometrii i energii modelowanych struktur w różnych rozpuszczalnikach i różnych formach zdysocjowanych; 2.3. Moduł do obliczania właściwości strukturalnych i elektronowych modelowanych struktur; 2.4. Moduł do analizy konformacyjnej umożliwiający równoczesną analizę zmian parametrów strukturalnych i elektronowych; 2.5. Moduł do generowania graficznych map rozkładu parametrów; 2.6. Moduł do komunikacji z bazami zewnętrznymi (SMD, SSPD, SRD, CSD, PDB) oraz programami (ChemDraw). 2.7. Interface graficzny do generowania struktur, obsługi modułów; 2.8. Monitor do obserwacji postępów obliczeń i analiz. 3. Oprogramowanie powinno umożliwiać: 3.1. Generowanie struktur trójwymiarowych związków organicznych, nieorganicznych i mieszanych, wykorzystując metodę fragmentów; 3.2. Generowanie struktur peptydów z predefiniowanych aminokwasów w różnych strukturach drugorzędowych (alfa-helisa, beta-kartka, konformacje definiowane przez użytkownika); 3.3. Generowanie struktur kwasów nukleinowych (pojedyncza lub podwójna nić, w formie alfa- , beta-helisy lub konformacji definiowanej przez użytkownika); 3.4. Generowanie grup podstawionych cząsteczek; 3.5. Dostęp do struktur dwuwymiarowych generowanych przez ChemDraw. 3.6. Dostęp i rozszerzanie bibliotek grup funkcyjnych, pierścieni i ligandów; 3.7. Dostęp do każdej cząsteczki lub jej fragmentu, które zostały wcześniej wygenerowane; 3.8. Import formatów - Spartan, Sybyl MOL i MOL2, PDB, MacroModel, Smiles, XYZ, SDF, TGF, SKC, CIF, CDX, JCAMP; 3.9. Eksport w formatach - Spartan, Sybyl MOL i MOL2, PDB, MacroModel, smile, XYZ (struktury); JPG, PNG, BMP (grafika i animacje); JCAMP (widma); 3.10. Obsługę formatów - Word, Excel, PDF, JCAMP, i In.); 3.11. Obsługę metod modelowania z poziomu - mechaniki molekularnej (pole siłowe SYBYL, MMFF94, MMFFaq bez limitu atomów do obliczeń); metod półempirycznych (MNDO, MNDO/d, AM1, RM1, PM3, PM6); metod ab initio z przybliżeniem HF (STO-3G, 3-21G, 6-31G*, 6-311G*, cc-pVDZ, cc-PVTZ, cc-PVQZ z rozszerzeniami obejmującymi mieszanie orbitali (d), (d,p), (2d), 2d,2p), 2df,2dp), (3d,3p), (3df,3dp), funkcjonały gęstości, funkcje polaryzacyjne i teorię zaburzeń); 3.12. Obliczanie - energii całkowitej, ciepła tworzenia, energii minimum lokalnego i globalnego; geometrii stanu przejściowego i rzeczywistych koordynat reakcji; parametrów widm IR i Raman, UV-VIS, NMR; profili energetycznych dla specyficznych koordynat geometrycznych; ładunków atomowych (Mulikena, z rozkładu naturalnego, elektrostatycznych z rozkładu potencjału); parametrów termodynamicznych (entalpia, entropia, energia swobodna, efekt izotopowy); parametrów elektronowych (dipol, kwadrupol, wyższe momenty, polaryzowalność); energie solwatacji; 3.13. Analizę rozkładu konformerów, tworzenie bibliotek konformerów; 3.14. Analizę podobieństw;.

• 
  2) Wspólny Słownik Zamówień (CPV):
  48.46.10.00-7.

• 
  3) Czas trwania lub termin wykonania:
  Okres w dniach: 56.

• 
  4) Kryteria oceny ofert:
  najniższa cena.