Dostawa pakietów oprogramowania statystycznego; Nr sprawy UM-ZP-262-57/11
Opis przedmiotu przetargu: 1. Przedmiotem zamówienia jest dostawa pakietów oprogramowania statystycznego tj. analityczne lub naukowe pakiety oprogramowania; matematyczne lub prognozujące pakiety oprogramowania. W w przedmiot zamówienia będzie realizowany w dwóch następujących zadaniach: Zadanie nr 1 - Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy aCGH - 1 szt. Zadanie nr 2 - Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy ekspresyjnej miRNA - 1 szt. 2. Zamawiający wymaga zaoferowania przedmiotu zamówienia nowego, kompletnego i gotowego do użycia ( tj. bez żadnych zbędnych i dodatkowych inwestycji). 3. Ilekroć w opisie przedmiotu zamówienia zawartym w SIWZ wskazane zostały normy , znaki towarowe, patenty lub pochodzenie, zamawiający dopuszcza rozwiązania równoważne. 4. Za ofertę równoważną Zamawiający uzna tę która spełnia wszystkie wymagania Zamawiającego określone w opisie przedmiotu zamówienia zawartym w rozdziale. IV SIWZ 5. Ewentualne wskazanie przez zamawiającego nazwy, producenci maja na celu określenie klasy produktu będącego przedmiotem zamówienia i służą ustaleniu standardu nie wskazują natomiast na konkretny wyrób lub konkretnego producenta. 6. Wykonawca który powoła się na rozwiązania równoważne jest zobowiązany wskazać że oferowany przez niego przedmiot zamówienia spełnia wymagania określone przez Zamawiającego. Szczegółowy opis przedmiotu zamówienia: Zadanie nr 1 Kryteria równoważności dla programu Nexus CopyNumber Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy aCGH Parametry wymagane 1. Oprogramowanie obsługujące wszystkie obecnie znane typy mikromacierzy aCGH: Affymetrix, Agilent, Roche Nimble Gene, Gene Pix, ImaGene, macierze samodzielnie nadrukowane i inne. 2. Oprogramowanie pozwalające na analizę wyników dla wszystkich organizmów. 3. Oprogramowanie pozwalające na stosowanie techniki dye-swap 4. Możliwość analizy tysięcy macierzy w pojedynczym projekcie. 5. Oprogramowanie obliczające QC próbki. 6. Możliwość integracji z zewnętrznymi, publicznymi bazami danych (NCBI, UCSC, Google, Ensemble, DECIPHER) i z bazami samodzielnie stworzonymi. 7. Oprogramowanie umożliwiające integrację danych fenotypowych z danymi klinicznymi. 8. Automatyczna identyfikacja regionów różniących się znacząco statystycznie pomiędzy populacjami próbek. 9.Analiza przeżywalności z wykreśleniem krzywych Kaplana- Meiera. 10.Grupowanie próbek w oparciu o zmiany w genomie. 11.Możliwość analizy i wizualizacji SNP (single nucleotide polymorphism), CNV (copy number variation), LOH (loss of heterozygosity) uzyskanych z macierzy SNP i aCGH. 12.Integracja wyników uzyskanych z wykorzystaniem technik mikromacierzowych aCGH, ekspresji genów, ekspresji miRNA oraz metylacji genomu. 13.Dostęp do publicznych baz danych udostępnianych przez grupy badawcze z różnych laboratoriów na całym świecie, zajmujących się podobną tematyką. Możliwość porównania własnych wyników z wynikami uzyskanymi przez inne laboratoria. 14.Roczna licencja, w trakcie trwania licencji wsparcie i pomoc merytoryczna producenta programu. 15.Możliwość wysyłania otrzymanych wyników do producenta oprogramowania i analiza wyników online. Pomoc w interpretacji wyników (ocena jakościowa przeprowadzonego eksperymentu, określenie statusu (obecność/brak zmian genomowych) w jednym, wielu genach regionach, miRNA we wszystkich analizowanych próbach, identyfikacja powszechnie występujących aberracji w genomie badanych prób, identyfikacja prób niosących podobne zmiany, identyfikacja genów i dróg przekazywania sygnału podlegających statystycznie częściej zmianom w grupie badanej, identyfikacja jednostek chorobowych, w których dochodzi do identycznych zmian jak w grupie analizowanej, identyfikacja zmian w genomie o cechach predykcyjnych, porównanie prób ze względu na cechy kliniczne, zmiany w obrębie regionów i czynniki wprowadzone bezpośrednio przez użytkownika, identyfikacja aberracji w obrębie regionów korelujących z DFS i czasem przeżycia). 16.Konieczność integracji z utworzonym formatem bazy danych (dane pacjentów, cechy kliniczne choroby) oraz z wynikami uzyskanymi we wcześniejszych badaniach z zastosowaniem macierzy aCGH (np. zidentyfikowane już aberracje o znaczeniu predykcyjnym, zmiany klasyfikujące próby na podgrupy itp). 17. Certyfikat potwierdzający zaawansowaną znajomość oprogramowania. 18.Udzielona będzie licencja na 1 rok użytkowania programu Zadanie nr 2 Kryteria równoważności dla programu ImaGene Nexus Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy ekspresyjnych miRNA 1.Oprogramowanie obsługujące miRCURY LNA TM microRNA Array. 2.Możliwość integracji z zewnętrznymi, publicznymi bazami danych dla miRNA w bazie miRBase and TargetScan. 3.Oprogramowanie pozwalające na analizę obrazów tif. pochodzących ze zeskanowanych macierzy miRCURY LNA TM MicroRNA. 4.Oprogramowanie pozwalające na ekstrakcję intensywności sygnału z mikromacierzy i równoczesną ich jakościową analizę statystyczną. 5.Oprogramowanie obliczające QC próbki. 6.Normalizacja i identyfikacja ulegających odmiennej ekspresji miRNA. 7.Oprogramowanie umożliwiające integrację danych fenotypowych z danymi klinicznymi. 8.Automatyczna identyfikacja regionów różniących się znacząco statystycznie pomiędzy populacjami próbek. 9.Analiza przeżywalności z wykreśleniem krzywych Kaplana- Meiera. 10.Analiza skupień - grupowanie próbek w oparciu o zmiany w ekspresji miRNA. 11.Identyfikacja zmian w genomie o cechach predykcyjnych, porównanie prób ze względu na cechy kliniczne analizowanej jednostki chorobowej, zmiany w ekspresji miRNA i czynniki wprowadzone bezpośrednio przez użytkownika, identyfikacja genów miRNA korelujących z DFS i czasem przeżycia. 12.Udzielona będzie licencja na 1 miesiąc użytkowania programu.
Lublin: Dostawa pakietów oprogramowania statystycznego; Nr sprawy UM-ZP-262-57/11
Numer ogłoszenia: 136752 - 2011; data zamieszczenia: 31.05.2011
OGŁOSZENIE O ZAMÓWIENIU - dostawy
Zamieszczanie ogłoszenia:
obowiązkowe.
Ogłoszenie dotyczy:
zamówienia publicznego.
SEKCJA I: ZAMAWIAJĄCY
I. 1) NAZWA I ADRES:
Uniwersytet Medyczny w Lublinie , Al. Racławickie 1, 20-059 Lublin, woj. lubelskie, tel. 81 528 88 88, faks 81 528 89 18.
Adres strony internetowej zamawiającego:
www.am.lublin.pl
I. 2) RODZAJ ZAMAWIAJĄCEGO:
Uczelnia publiczna.
SEKCJA II: PRZEDMIOT ZAMÓWIENIA
II.1) OKREŚLENIE PRZEDMIOTU ZAMÓWIENIA
II.1.1) Nazwa nadana zamówieniu przez zamawiającego:
Dostawa pakietów oprogramowania statystycznego; Nr sprawy UM-ZP-262-57/11.
II.1.2) Rodzaj zamówienia:
dostawy.
II.1.3) Określenie przedmiotu oraz wielkości lub zakresu zamówienia:
1. Przedmiotem zamówienia jest dostawa pakietów oprogramowania statystycznego tj. analityczne lub naukowe pakiety oprogramowania; matematyczne lub prognozujące pakiety oprogramowania. W w przedmiot zamówienia będzie realizowany w dwóch następujących zadaniach: Zadanie nr 1 - Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy aCGH - 1 szt. Zadanie nr 2 - Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy ekspresyjnej miRNA - 1 szt. 2. Zamawiający wymaga zaoferowania przedmiotu zamówienia nowego, kompletnego i gotowego do użycia ( tj. bez żadnych zbędnych i dodatkowych inwestycji). 3. Ilekroć w opisie przedmiotu zamówienia zawartym w SIWZ wskazane zostały normy , znaki towarowe, patenty lub pochodzenie, zamawiający dopuszcza rozwiązania równoważne. 4. Za ofertę równoważną Zamawiający uzna tę która spełnia wszystkie wymagania Zamawiającego określone w opisie przedmiotu zamówienia zawartym w rozdziale. IV SIWZ 5. Ewentualne wskazanie przez zamawiającego nazwy, producenci maja na celu określenie klasy produktu będącego przedmiotem zamówienia i służą ustaleniu standardu nie wskazują natomiast na konkretny wyrób lub konkretnego producenta. 6. Wykonawca który powoła się na rozwiązania równoważne jest zobowiązany wskazać że oferowany przez niego przedmiot zamówienia spełnia wymagania określone przez Zamawiającego. Szczegółowy opis przedmiotu zamówienia: Zadanie nr 1 Kryteria równoważności dla programu Nexus CopyNumber Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy aCGH Parametry wymagane 1. Oprogramowanie obsługujące wszystkie obecnie znane typy mikromacierzy aCGH: Affymetrix, Agilent, Roche Nimble Gene, Gene Pix, ImaGene, macierze samodzielnie nadrukowane i inne. 2. Oprogramowanie pozwalające na analizę wyników dla wszystkich organizmów. 3. Oprogramowanie pozwalające na stosowanie techniki dye-swap 4. Możliwość analizy tysięcy macierzy w pojedynczym projekcie. 5. Oprogramowanie obliczające QC próbki. 6. Możliwość integracji z zewnętrznymi, publicznymi bazami danych (NCBI, UCSC, Google, Ensemble, DECIPHER) i z bazami samodzielnie stworzonymi. 7. Oprogramowanie umożliwiające integrację danych fenotypowych z danymi klinicznymi. 8. Automatyczna identyfikacja regionów różniących się znacząco statystycznie pomiędzy populacjami próbek. 9.Analiza przeżywalności z wykreśleniem krzywych Kaplana- Meiera. 10.Grupowanie próbek w oparciu o zmiany w genomie. 11.Możliwość analizy i wizualizacji SNP (single nucleotide polymorphism), CNV (copy number variation), LOH (loss of heterozygosity) uzyskanych z macierzy SNP i aCGH. 12.Integracja wyników uzyskanych z wykorzystaniem technik mikromacierzowych aCGH, ekspresji genów, ekspresji miRNA oraz metylacji genomu. 13.Dostęp do publicznych baz danych udostępnianych przez grupy badawcze z różnych laboratoriów na całym świecie, zajmujących się podobną tematyką. Możliwość porównania własnych wyników z wynikami uzyskanymi przez inne laboratoria. 14.Roczna licencja, w trakcie trwania licencji wsparcie i pomoc merytoryczna producenta programu. 15.Możliwość wysyłania otrzymanych wyników do producenta oprogramowania i analiza wyników online. Pomoc w interpretacji wyników (ocena jakościowa przeprowadzonego eksperymentu, określenie statusu (obecność/brak zmian genomowych) w jednym, wielu genach regionach, miRNA we wszystkich analizowanych próbach, identyfikacja powszechnie występujących aberracji w genomie badanych prób, identyfikacja prób niosących podobne zmiany, identyfikacja genów i dróg przekazywania sygnału podlegających statystycznie częściej zmianom w grupie badanej, identyfikacja jednostek chorobowych, w których dochodzi do identycznych zmian jak w grupie analizowanej, identyfikacja zmian w genomie o cechach predykcyjnych, porównanie prób ze względu na cechy kliniczne, zmiany w obrębie regionów i czynniki wprowadzone bezpośrednio przez użytkownika, identyfikacja aberracji w obrębie regionów korelujących z DFS i czasem przeżycia). 16.Konieczność integracji z utworzonym formatem bazy danych (dane pacjentów, cechy kliniczne choroby) oraz z wynikami uzyskanymi we wcześniejszych badaniach z zastosowaniem macierzy aCGH (np. zidentyfikowane już aberracje o znaczeniu predykcyjnym, zmiany klasyfikujące próby na podgrupy itp). 17. Certyfikat potwierdzający zaawansowaną znajomość oprogramowania. 18.Udzielona będzie licencja na 1 rok użytkowania programu Zadanie nr 2 Kryteria równoważności dla programu ImaGene Nexus Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy ekspresyjnych miRNA 1.Oprogramowanie obsługujące miRCURY LNA TM microRNA Array. 2.Możliwość integracji z zewnętrznymi, publicznymi bazami danych dla miRNA w bazie miRBase and TargetScan. 3.Oprogramowanie pozwalające na analizę obrazów tif. pochodzących ze zeskanowanych macierzy miRCURY LNA TM MicroRNA. 4.Oprogramowanie pozwalające na ekstrakcję intensywności sygnału z mikromacierzy i równoczesną ich jakościową analizę statystyczną. 5.Oprogramowanie obliczające QC próbki. 6.Normalizacja i identyfikacja ulegających odmiennej ekspresji miRNA. 7.Oprogramowanie umożliwiające integrację danych fenotypowych z danymi klinicznymi. 8.Automatyczna identyfikacja regionów różniących się znacząco statystycznie pomiędzy populacjami próbek. 9.Analiza przeżywalności z wykreśleniem krzywych Kaplana- Meiera. 10.Analiza skupień - grupowanie próbek w oparciu o zmiany w ekspresji miRNA. 11.Identyfikacja zmian w genomie o cechach predykcyjnych, porównanie prób ze względu na cechy kliniczne analizowanej jednostki chorobowej, zmiany w ekspresji miRNA i czynniki wprowadzone bezpośrednio przez użytkownika, identyfikacja genów miRNA korelujących z DFS i czasem przeżycia. 12.Udzielona będzie licencja na 1 miesiąc użytkowania programu..
II.1.4) Czy przewiduje się udzielenie zamówień uzupełniających:
nie.
II.1.5) Wspólny Słownik Zamówień (CPV):
48.46.30.00-1, 48.46.40.00-7, 48.46.20.00-4.
II.1.6) Czy dopuszcza się złożenie oferty częściowej:
tak, liczba części: 2.
II.1.7) Czy dopuszcza się złożenie oferty wariantowej:
nie.
II.2) CZAS TRWANIA ZAMÓWIENIA LUB TERMIN WYKONANIA:
Okres w dniach: 7.
SEKCJA III: INFORMACJE O CHARAKTERZE PRAWNYM, EKONOMICZNYM, FINANSOWYM I TECHNICZNYM
III.1) WADIUM
Informacja na temat wadium:
Nie dotyczy
III.2) ZALICZKI
Czy przewiduje się udzielenie zaliczek na poczet wykonania zamówienia:
nie
III.3) WARUNKI UDZIAŁU W POSTĘPOWANIU ORAZ OPIS SPOSOBU DOKONYWANIA OCENY SPEŁNIANIA TYCH WARUNKÓW
III. 3.1) Uprawnienia do wykonywania określonej działalności lub czynności, jeżeli przepisy prawa nakładają obowiązek ich posiadania
Opis sposobu dokonywania oceny spełniania tego warunkuOswiadczenie Wykonawcy
III.3.2) Wiedza i doświadczenie
Opis sposobu dokonywania oceny spełniania tego warunkuOswiadczenie Wykonawcy
III.3.3) Potencjał techniczny
Opis sposobu dokonywania oceny spełniania tego warunkuOswiadczenie Wykonawcy
III.3.4) Osoby zdolne do wykonania zamówienia
Opis sposobu dokonywania oceny spełniania tego warunkuOswiadczenie Wykonawcy
III.3.5) Sytuacja ekonomiczna i finansowa
Opis sposobu dokonywania oceny spełniania tego warunkuOswiadczenie Wykonawcy
III.4) INFORMACJA O OŚWIADCZENIACH LUB DOKUMENTACH, JAKIE MAJĄ DOSTARCZYĆ WYKONAWCY W CELU POTWIERDZENIA SPEŁNIANIA WARUNKÓW UDZIAŁU W POSTĘPOWANIU ORAZ NIEPODLEGANIA WYKLUCZENIU NA PODSTAWIE ART. 24 UST. 1 USTAWY
-
III.4.1) W zakresie wykazania spełniania przez wykonawcę warunków, o których mowa w art. 22 ust. 1 ustawy, oprócz oświadczenia o spełnieniu warunków udziału w postępowaniu, należy przedłożyć:
III.4.2) W zakresie potwierdzenia niepodlegania wykluczeniu na podstawie art. 24 ust. 1 ustawy, należy przedłożyć:- oświadczenie o braku podstaw do wykluczenia
- aktualny odpis z właściwego rejestru, jeżeli odrębne przepisy wymagają wpisu do rejestru, w celu wykazania braku podstaw do wykluczenia w oparciu o art. 24 ust. 1 pkt 2 ustawy, wystawiony nie wcześniej niż 6 miesięcy przed upływem terminu składania wniosków o dopuszczenie do udziału w postępowaniu o udzielenie zamówienia albo składania ofert, a w stosunku do osób fizycznych oświadczenie w zakresie art. 24 ust. 1 pkt 2 ustawy
- wykonawca powołujący się przy wykazywaniu spełniania warunków udziału w postępowaniu na potencjał innych podmiotów, które będą brały udział w realizacji części zamówienia, przedkłada także dokumenty dotyczące tego podmiotu w zakresie wymaganym dla wykonawcy, określonym w pkt III.4.2.
-
III.4.3) Dokumenty podmiotów zagranicznych
Jeżeli wykonawca ma siedzibę lub miejsce zamieszkania poza terytorium Rzeczypospolitej Polskiej, przedkłada:
III.4.3.1) dokument wystawiony w kraju, w którym ma siedzibę lub miejsce zamieszkania potwierdzający, że:
- nie otwarto jego likwidacji ani nie ogłoszono upadłości - wystawiony nie wcześniej niż 6 miesięcy przed upływem terminu składania wniosków o dopuszczenie do udziału w postępowaniu o udzielenie zamówienia albo składania ofert
III.5) INFORMACJA O DOKUMENTACH POTWIERDZAJĄCYCH, ŻE OFEROWANE DOSTAWY , USŁUGI LUB ROBOTY BUDOWLANE ODPOWIADAJĄ OKREŚLONYM WYMAGANIOM
W zakresie potwierdzenia, że oferowane dostawy, usługi lub roboty budowlane odpowiadają określonym wymaganiom należy przedłożyć:
inne dokumenty
1.Zamawiający wymaga, aby oferowany przedmiot zamówienia odpowiadał ( odpowiednio dla zadań na które składana jest oferta): 1.1Wymaganiom określonym przez Zamawiającego w SIWZ 2.W celu potwierdzenia, że oferowane produkty odpowiadają wymaganiom określonym przez Zamawiającego w pkt. 1 w ofercie należy złożyć, odpowiednio dla zadań na które składana jest oferta: 2.1. Dokumenty ( certyfikaty) potwierdzające zaawansowaną znajomość oprogramowania. - w zakresie zadania nr 1 i 2 Zaleca się aby dokumenty były opisane z podaniem którego zadania dotyczą.
III.6) INNE DOKUMENTY
Inne dokumenty niewymienione w pkt III.4) albo w pkt III.5)
1. Jeżeli Wykonawca ma siedzibę lub miejsce zamieszkania poza terytorium Rzeczypospolitej Polskiej, stosownie do treści § 4 ust. 1 rozporządzenia, zamiast dokumentów, o których mowa w punkcie III 4.2 - Wykonawca składa dokument lub dokumenty, wystawione w kraju, w którym ma siedzibę lub miejsce zamieszkania, potwierdzające odpowiednio, że nie otwarto jego likwidacji ani nie ogłoszono upadłości; 2. Dokumenty, o których mowa w pkt. 1 powinny być wystawione nie wcześniej niż 6 miesięcy przed upływem terminu składania ofert. 3. Jeżeli w miejscu zamieszkania osoby lub w kraju, w którym Wykonawca ma siedzibę lub miejsce zamieszkania, nie wydaje się dokumentów, o których mowa w pkt. 1, zastępuje się je dokumentem zawierającym oświadczenie złożone przed notariuszem, właściwym organem sądowym, administracyjnym albo organem samorządu zawodowego lub gospodarczego odpowiednio miejsca zamieszkania osoby lub kraju, w którym Wykonawca ma siedzibę lub miejsce zamieszkania. Zapis pkt. 2. stosuje się odpowiednio. Dokument ten winien być wystawiony nie wcześniej niż 6 miesięcy przed upływem terminu składania ofert. 4. W przypadku wątpliwości, co do treści dokumentu złożonego przez Wykonawcę mającego siedzibę lub miejsce zamieszkania poza terytorium Rzeczypospolitej Polskiej, Zamawiający może zwrócić się do właściwych organów odpowiednio miejsca zamieszkania osoby lub kraju, w którym Wykonawca ma siedzibę lub miejsce zamieszkania z wnioskiem o udzielenie niezbędnych informacji dotyczących przedłożonego dokumentu. 5.Jeżeli Wykonawca, polega na wiedzy i doświadczeniu, potencjale technicznym, osobach zdolnych do wykonania zamówienia lub zdolnościach finansowych innych podmiotów, to zobowiązany jest również przedłożyć: 5.1. Pisemne zobowiązanie tych podmiotów do oddania mu do dyspozycji niezbędnych zasobów na okres korzystania z nich przy wykonywaniu zamówienia; 5.2 Oświadczenie i dokumenty dotyczące tych podmiotów, wymienione w punkcie III 4.2.
III.7) Czy ogranicza się możliwość ubiegania się o zamówienie publiczne tylko dla wykonawców, u których ponad 50 % pracowników stanowią osoby niepełnosprawne:
nie
SEKCJA IV: PROCEDURA
IV.1) TRYB UDZIELENIA ZAMÓWIENIA
IV.1.1) Tryb udzielenia zamówienia:
przetarg nieograniczony.
IV.2) KRYTERIA OCENY OFERT
IV.2.1) Kryteria oceny ofert:
najniższa cena.
IV.2.2) Czy przeprowadzona będzie aukcja elektroniczna:
nie.
IV.3) ZMIANA UMOWY
Czy przewiduje się istotne zmiany postanowień zawartej umowy w stosunku do treści oferty, na podstawie której dokonano wyboru wykonawcy:
tak
Dopuszczalne zmiany postanowień umowy oraz określenie warunków zmian
1. Zmiana postanowień niniejszej umowy może nastąpić w formie pisemnego aneksu pod rygorem nieważności w następujących przypadkach: 1.1. aktualizacji rozwiązań ze względu na postęp technologiczny ( np. wycofanie z obrotu) zmiana nie może powodować zmiany ceny wynikającej oferty na podstawie której był dokonany wybór wykonawcy 1.2. zmiany obowiązujących przepisów, jeżeli konieczne będzie dostosowanie treści umowy do aktualnego stanu prawnego; 1.3. zmiany stawki podatku VAT. Cena brutto ulegnie zmniejszeniu w przypadku obniżenia stawki podatku od towarów i usług lub powiększeniu w przypadku podwyższenia stawki podatku od towarów i usług. 1.4. konieczności zmiany terminu realizacji przedmiotu umowy z przyczyn niezawinionych przez strony, zmiana nie może spowodować zmiany ceny wynikającej z oferty Wykonawcy; 1.5. konieczności zmiany osób przewidzianych do wzajemnego współdziałania, lub wykonania przedmiotu umowy; 1.6. wystąpienia zdarzeń siły wyższej jako zdarzenia zewnętrznego, niemożliwego do przewidzenia i niemożliwego do zapobieżenia; 1.7. wprowadzenia nowej technologii, lub innych okoliczności pozwalających na obniżenie ceny przedmiotu umowy, Wykonawca powinien ją odpowiednio obniżyć; 1.8. konieczności zastąpienia przedmiotem równoważnym lub o wyższych parametrach jakościowych 2. Inicjatorem zmian może być Zamawiający lub Wykonawca poprzez pisemne wystąpienie w okresie obowiązywania umowy zawierające uzasadnienie proponowanych zmian.
IV.4) INFORMACJE ADMINISTRACYJNE
IV.4.1)
Adres strony internetowej, na której jest dostępna specyfikacja istotnych warunków zamówienia:
www.umlub.pl
Specyfikację istotnych warunków zamówienia można uzyskać pod adresem:
1) strona interentowa j.w..
IV.4.4) Termin składania wniosków o dopuszczenie do udziału w postępowaniu lub ofert:
08.06.2011 godzina 10:30, miejsce: siedziba zamawiającego Al. Racłwickie 1 20 -059 Lublin pok 22. ( Kancelaria Ogólna).
IV.4.5) Termin związania ofertą:
okres w dniach: 30 (od ostatecznego terminu składania ofert).
IV.4.16) Informacje dodatkowe, w tym dotyczące finansowania projektu/programu ze środków Unii Europejskiej:
Nie dotyczy.
IV.4.17) Czy przewiduje się unieważnienie postępowania o udzielenie zamówienia, w przypadku nieprzyznania środków pochodzących z budżetu Unii Europejskiej oraz niepodlegających zwrotowi środków z pomocy udzielonej przez państwa członkowskie Europejskiego Porozumienia o Wolnym Handlu (EFTA), które miały być przeznaczone na sfinansowanie całości lub części zamówienia:
nie
ZAŁĄCZNIK I - INFORMACJE DOTYCZĄCE OFERT CZĘŚCIOWYCH
CZĘŚĆ Nr:
1
NAZWA:
Zadanie nr 1.
1) Krótki opis ze wskazaniem wielkości lub zakresu zamówienia:
1.Przedmiotem zamówienia jest dostawa pakietów oprogramowania statystycznego tj. analityczne lub naukowe pakiety oprogramowania; matematyczne lub prognozujące pakiety oprogramowania. W/w przedmiot zamówienia będzie realizowany w dwóch następujących zadaniach: Zadanie nr 1 - Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy aCGH - 1 szt. Zadanie nr 2 - Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy ekspresyjnej miRNA - 1 szt. 2.Zamawiający wymaga zaoferowania przedmiotu zamówienia nowego, kompletnego i gotowego do użycia ( tj. bez żadnych zbędnych i dodatkowych inwestycji). 3.Ilekroć w opisie przedmiotu zamówienia zawartym w SIWZ wskazane zostały normy , znaki towarowe, patenty lub pochodzenie, zamawiający dopuszcza rozwiązania równoważne. 4.Za ofertę równoważną Zamawiający uzna tę która spełnia wszystkie wymagania Zamawiającego określone w opisie przedmiotu zamówienia zawartym w rozdziale. IV SIWZ 5.Ewentualne wskazanie przez zamawiającego nazwy, producenci maja na celu określenie klasy produktu będącego przedmiotem zamówienia i służą ustaleniu standardu nie wskazują natomiast na konkretny wyrób lub konkretnego producenta. 6.Wykonawca który powoła się na rozwiązania równoważne jest zobowiązany wskazać że oferowany przez niego przedmiot zamówienia spełnia wymagania określone przez Zamawiającego. Szczegółowy opis przedmiotu zamówienia: Zadanie nr 1 Kryteria równoważności dla programu Nexus CopyNumber Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy aCGH Parametry wymagane 1.Oprogramowanie obsługujące wszystkie obecnie znane typy mikromacierzy aCGH: Affymetrix, Agilent, Roche Nimble Gene, Gene Pix, ImaGene, macierze samodzielnie nadrukowane i inne. 2.Oprogramowanie pozwalające na analizę wyników dla wszystkich organizmów. 3.Oprogramowanie pozwalające na stosowanie techniki dye-swap 4.Możliwość analizy tysięcy macierzy w pojedynczym projekcie. 5.Oprogramowanie obliczające QC próbki. 6.Możliwość integracji z zewnętrznymi, publicznymi bazami danych (NCBI, UCSC, Google, Ensemble, DECIPHER) i z bazami samodzielnie stworzonymi. 7.Oprogramowanie umożliwiające integrację danych fenotypowych z danymi klinicznymi. 8.Automatyczna identyfikacja regionów różniących się znacząco statystycznie pomiędzy populacjami próbek. 9.Analiza przeżywalności z wykreśleniem krzywych Kaplana- Meiera. 10.Grupowanie próbek w oparciu o zmiany w genomie. 11.Możliwość analizy i wizualizacji SNP (single nucleotide polymorphism), CNV (copy number variation), LOH (loss of heterozygosity) uzyskanych z macierzy SNP i aCGH. 12.Integracja wyników uzyskanych z wykorzystaniem technik mikromacierzowych aCGH, ekspresji genów, ekspresji miRNA oraz metylacji genomu. 13.Dostęp do publicznych baz danych udostępnianych przez grupy badawcze z różnych laboratoriów na całym świecie, zajmujących się podobną tematyką. Możliwość porównania własnych wyników z wynikami uzyskanymi przez inne laboratoria. 14.Roczna licencja, w trakcie trwania licencji wsparcie i pomoc merytoryczna producenta programu. 15.Możliwość wysyłania otrzymanych wyników do producenta oprogramowania i analiza wyników online. Pomoc w interpretacji wyników (ocena jakościowa przeprowadzonego eksperymentu, określenie statusu (obecność/brak zmian genomowych) w jednym, wielu genach/regionach, miRNA we wszystkich analizowanych próbach, identyfikacja powszechnie występujących aberracji w genomie badanych prób, identyfikacja prób niosących podobne zmiany, identyfikacja genów i dróg przekazywania sygnału podlegających statystycznie częściej zmianom w grupie badanej, identyfikacja jednostek chorobowych, w których dochodzi do identycznych zmian jak w grupie analizowanej, identyfikacja zmian w genomie o cechach predykcyjnych, porównanie prób ze względu na cechy kliniczne, zmiany w obrębie regionów i czynniki wprowadzone bezpośrednio przez użytkownika, identyfikacja aberracji w obrębie regionów korelujących z DFS i czasem przeżycia). 16. Konieczność integracji z utworzonym formatem bazy danych (dane pacjentów, cechy kliniczne choroby) oraz z wynikami uzyskanymi we wcześniejszych badaniach z zastosowaniem macierzy aCGH (np. zidentyfikowane już aberracje o znaczeniu predykcyjnym, zmiany klasyfikujące próby na podgrupy itp). 17.Certyfikat potwierdzający zaawansowaną znajomość oprogramowania. 18.Udzielona będzie licencja na 1 rok użytkowania programu.
2) Wspólny Słownik Zamówień (CPV):
48.46.30.00-1, 48.46.40.00-7, 48.46.20.00-4.
3) Czas trwania lub termin wykonania:
Okres w dniach: 7.
4) Kryteria oceny ofert:
najniższa cena.
CZĘŚĆ Nr:
2
NAZWA:
Zadanie nr 2.
1) Krótki opis ze wskazaniem wielkości lub zakresu zamówienia:
1.Przedmiotem zamówienia jest dostawa pakietów oprogramowania statystycznego tj. analityczne lub naukowe pakiety oprogramowania; matematyczne lub prognozujące pakiety oprogramowania. W/w przedmiot zamówienia będzie realizowany w dwóch następujących zadaniach: Zadanie nr 1 - Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy aCGH - 1 szt. Zadanie nr 2 - Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy ekspresyjnej miRNA - 1 szt. 2.Zamawiający wymaga zaoferowania przedmiotu zamówienia nowego, kompletnego i gotowego do użycia ( tj. bez żadnych zbędnych i dodatkowych inwestycji). 3.Ilekroć w opisie przedmiotu zamówienia zawartym w SIWZ wskazane zostały normy , znaki towarowe, patenty lub pochodzenie, zamawiający dopuszcza rozwiązania równoważne. 4.Za ofertę równoważną Zamawiający uzna tę która spełnia wszystkie wymagania Zamawiającego określone w opisie przedmiotu zamówienia zawartym w rozdziale. IV SIWZ 5.Ewentualne wskazanie przez zamawiającego nazwy, producenci maja na celu określenie klasy produktu będącego przedmiotem zamówienia i służą ustaleniu standardu nie wskazują natomiast na konkretny wyrób lub konkretnego producenta. 6.Wykonawca który powoła się na rozwiązania równoważne jest zobowiązany wskazać że oferowany przez niego przedmiot zamówienia spełnia wymagania określone przez Zamawiającego. Zadanie nr 2 Kryteria równoważności dla programu ImaGene Nexus Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy ekspresyjnych miRNA 1.Oprogramowanie obsługujące miRCURY LNA TM microRNA Array. 2.Możliwość integracji z zewnętrznymi, publicznymi bazami danych dla miRNA w bazie miRBase and TargetScan. 3.Oprogramowanie pozwalające na analizę obrazów tif. pochodzących ze zeskanowanych macierzy miRCURY LNA TM MicroRNA. 4.Oprogramowanie pozwalające na ekstrakcję intensywności sygnału z mikromacierzy i równoczesną ich jakościową analizę statystyczną. 5.Oprogramowanie obliczające QC próbki. 6.Normalizacja i identyfikacja ulegających odmiennej ekspresji miRNA. 7.Oprogramowanie umożliwiające integrację danych fenotypowych z danymi klinicznymi. 8.Automatyczna identyfikacja regionów różniących się znacząco statystycznie pomiędzy populacjami próbek. 9.Analiza przeżywalności z wykreśleniem krzywych Kaplana- Meiera. 10.Analiza skupień - grupowanie próbek w oparciu o zmiany w ekspresji miRNA. 11.Identyfikacja zmian w genomie o cechach predykcyjnych, porównanie prób ze względu na cechy kliniczne analizowanej jednostki chorobowej, zmiany w ekspresji miRNA i czynniki wprowadzone bezpośrednio przez użytkownika, identyfikacja genów miRNA korelujących z DFS i czasem przeżycia. 12.Udzielona będzie licencja na 1 miesiąc użytkowania programu..
2) Wspólny Słownik Zamówień (CPV):
48.46.30.00-1, 48.46.40.00-7, 48.46.20.00-4.
3) Czas trwania lub termin wykonania:
Okres w dniach: 7.
4) Kryteria oceny ofert:
najniższa cena.
Numer ogłoszenia: 145572 - 2011; data zamieszczenia: 06.06.2011
OGŁOSZENIE O ZMIANIE OGŁOSZENIA
Ogłoszenie dotyczy:
Ogłoszenia o zamówieniu.
Informacje o zmienianym ogłoszeniu:
136752 - 2011 data 31.05.2011 r.
SEKCJA I: ZAMAWIAJĄCY
Uniwersytet Medyczny w Lublinie, Al. Racławickie 1, 20-059 Lublin, woj. lubelskie, tel. 81 528 88 88, fax. 81 528 89 18.
SEKCJA II: ZMIANY W OGŁOSZENIU
II.1) Tekst, który należy zmienić:
Miejsce, w którym znajduje się zmieniany tekst:
cz.1pkt.3).
W ogłoszeniu jest:
Czas trwania lub termin wykonania: Okres w dniach: 7..
W ogłoszeniu powinno być:
Czas trwania lub termin wykonania: Okres w dniach: 21..
Miejsce, w którym znajduje się zmieniany tekst:
IV.4.4..
W ogłoszeniu jest:
Termin składania wniosków o dopuszczenie do udziału w postępowaniu lub ofert: 08.06.2011 godzina 10:30, miejsce: siedziba zamawiającego Al. Racłwickie 1 20 -059 Lublin pok 22. ( Kancelaria Ogólna)..
W ogłoszeniu powinno być:
Termin składania wniosków o dopuszczenie do udziału w postępowaniu lub ofert: 09.06.2011 godzina 10:30, miejsce: siedziba zamawiającego Al. Racłwickie 1 20 -059 Lublin pok 22. ( Kancelaria Ogólna)..
Dane postępowania
ID postępowania BZP/TED: | 13675220110 |
---|---|
ID postępowania Zamawiającego: | |
Data publikacji zamówienia: | 2011-05-30 |
Rodzaj zamówienia: | dostawy |
Tryb& postępowania [PN]: | Przetarg nieograniczony |
Czas na realizację: | 7 dni |
Wadium: | - |
Oferty uzupełniające: | NIE |
Oferty częściowe: | TAK |
Oferty wariantowe: | NIE |
Przewidywana licyctacja: | NIE |
Ilość części: | 2 |
Kryterium ceny: | 0% |
WWW ogłoszenia: | www.am.lublin.pl |
Informacja dostępna pod: | 1) strona interentowa j.w. |
Okres związania ofertą: | 30 dni |
Kody CPV
48462000-4 | Matematyczne lub prognozujące pakiety oprogramowania | |
48463000-1 | Pakiety oprogramowania statystycznego |