SEKWENCJONOWANIE GENOMÓW DWÓCH LINII KUKURYDZY ZWYCZAJNEJ (Pacbio RS version II)

Poznań: SEKWENCJONOWANIE GENOMÓW DWÓCH LINII KUKURYDZY ZWYCZAJNEJ (Pacbio RS version II)


Numer ogłoszenia: 54873 - 2014; data zamieszczenia: 14.03.2014

OGŁOSZENIE O UDZIELENIU ZAMÓWIENIA - Usługi

Zamieszczanie ogłoszenia:
obowiązkowe.

Ogłoszenie dotyczy:
zamówienia publicznego.

Czy zamówienie było przedmiotem ogłoszenia w Biuletynie Zamówień Publicznych:
tak, numer ogłoszenia w BZP: 12651 - 2014r.

Czy w Biuletynie Zamówień Publicznych zostało zamieszczone ogłoszenie o zmianie ogłoszenia:
nie.

SEKCJA I: ZAMAWIAJĄCY

I. 1) NAZWA I ADRES:
Instytut Chemii Bioorganicznej Polskiej Akademii Nauk, ul. Noskowskiego 12/14, 61-704 Poznań, woj. wielkopolskie, tel. 061 8582091, faks 061 8525954.

I. 2) RODZAJ ZAMAWIAJĄCEGO:
Inny: Instytut Polskiej Akademii Nauk.

SEKCJA II: PRZEDMIOT ZAMÓWIENIA

II.1) Nazwa nadana zamówieniu przez zamawiającego:
SEKWENCJONOWANIE GENOMÓW DWÓCH LINII KUKURYDZY ZWYCZAJNEJ (Pacbio RS version II).

II.2) Rodzaj zamówienia:
Usługi.

II.3) Określenie przedmiotu zamówienia:
Przedmiotem negocjacji jest sekwencjonowanie genomów dwóch linii kukurydzy zwyczajnej (Pacbio RS version II) w niżej podanym asortymencie i ilości: 1. Izolacja DNA z dwóch linii kukurydzy zwyczajnej - rozbicie komórek (liza (jeśli potrzebne) - izolacja DNA - analiza jakościowa i ilościowa (żel agarozowy) 2. Utworzenie (przygotowanie) bibliotek PacBio RS - fragmentacja DNA - wybór fragmentów o odpowiedniej długości (8-12 kb) - naprawa końców i ligacja adapterów - wydłużanie primerów - wydłużanie polimerazy 3. Sekwencjonowanie na PacBio RS: 200 Mb surowych danych - specyfikacja na jednostkę (60 jednostek na linię kukurydzy, 120 jednostek w sumie) - surowych danych większa niż 200 Mb (12 Gb wyprodukowanych dla jednej linii) - średnia typowa długość odczytów większa niż 4000 bp Dostarczenie: - surowych danych (fastq, bas. h5, metadata.xml).

II.4) Wspólny Słownik Zamówień (CPV):
73.11.00.00-6.

SEKCJA III: PROCEDURA

III.1) TRYB UDZIELENIA ZAMÓWIENIA:
Zamówienie z wolnej ręki

III.2) INFORMACJE ADMINISTRACYJNE

• 
  Zamówienie dotyczy projektu/programu finansowanego ze środków Unii Europejskiej:
  nie

SEKCJA IV: UDZIELENIE ZAMÓWIENIA

IV.1) DATA UDZIELENIA ZAMÓWIENIA:
04.02.2014.

IV.2) LICZBA OTRZYMANYCH OFERT:
1.

IV.3) LICZBA ODRZUCONYCH OFERT:
0.

IV.4) NAZWA I ADRES WYKONAWCY, KTÓREMU UDZIELONO ZAMÓWIENIA:

• GATC Biotech European Genome and Diagnostics Centre, {Dane ukryte}, Konstanz, kraj/woj. Niemcy.

IV.5) Szacunkowa wartość zamówienia
(bez VAT): 215020,00 PLN.

IV.6) INFORMACJA O CENIE WYBRANEJ OFERTY ORAZ O OFERTACH Z NAJNIŻSZĄ I NAJWYŻSZĄ CENĄ

• 
  Cena wybranej oferty:
  56480,00

• 
  Oferta z najniższą ceną:
  56480,00
  / Oferta z najwyższą ceną:
  56480,00

• 
  Waluta:
  EUR.

ZAŁĄCZNIK I

Uzasadnienie udzielenia zamówienia w trybie negocjacji bez ogłoszenia, zamówienia z wolnej ręki albo zapytania o cenę

• 
  1. Podstawa prawna
  

  Postępowanie prowadzone jest w trybie zamówienie z wolnej ręki na podstawie art. 67 ust. 1 pkt 1 lit. a ustawy z dnia 29 stycznia 2004r. - Prawo zamówień publicznych.

• 
  2. Uzasadnienia wyboru trybu
  

  Należy podać uzasadnienie faktyczne i prawne wyboru trybu oraz wyjaśnić, dlaczego udzielenie zamówienia jest zgodne z przepisami.

  uzasadnienie prawne: Działając zgodnie z art. 67 ust.1 pkt.1a Pzp, Zamawiający może udzielić zamówienia z wolnej ręki, jeżeli dostawy, usługi lub roboty budowlane mogą być świadczone tylko przez jednego wykonawcę z przyczyn technicznych o obiektywnym charakterze. Podstawą zastosowania tej przesłanki wyboru trybu udzielenia zamówienia jest szczególny charakter zamówienia powodujący, że może ono być zrealizowane tylko przez jednego wykonawcę. Zamówienia zamierza udzielić się wykonawcy, który posiada wyłączne prawo do wykonywania sekwencjonowania w technologii PacBio SMRT II uzasadnienie faktyczne: Zamawiana w firmie GATC usługa sekwencjonowania wysokoprzepustowego wykonywana będzie w technologii PacBio SMRT II. Technologia ta zapewnia unikatowe możliwości otrzymania odczytów o długości kilkunastu tysięcy par zasad. Takie odczyty są niezbędne do poprawnego złożenia genomów kukurydzy zawierających znaczne ilości sekwencji powtórzonych. Firma GATC jest jedynym komercyjnym wykonawcą sekwencjonowania w technologii PacBio SMRT II w Europie.

Poznań: SEKWENCJONOWANIE GENOMÓW DWÓCH LINII KUKURYDZY ZWYCZAJNEJ (Pacbio RS version II)


Numer ogłoszenia: 54873 - 2014; data zamieszczenia: 14.03.2014

OGŁOSZENIE O UDZIELENIU ZAMÓWIENIA - Usługi

Zamieszczanie ogłoszenia:
obowiązkowe.

Ogłoszenie dotyczy:
zamówienia publicznego.

Czy zamówienie było przedmiotem ogłoszenia w Biuletynie Zamówień Publicznych:
tak, numer ogłoszenia w BZP: 12651 - 2014r.

Czy w Biuletynie Zamówień Publicznych zostało zamieszczone ogłoszenie o zmianie ogłoszenia:
nie.

SEKCJA I: ZAMAWIAJĄCY

I. 1) NAZWA I ADRES:
Instytut Chemii Bioorganicznej Polskiej Akademii Nauk, ul. Noskowskiego 12/14, 61-704 Poznań, woj. wielkopolskie, tel. 061 8582091, faks 061 8525954.

I. 2) RODZAJ ZAMAWIAJĄCEGO:
Inny: Instytut Polskiej Akademii Nauk.

SEKCJA II: PRZEDMIOT ZAMÓWIENIA

II.1) Nazwa nadana zamówieniu przez zamawiającego:
SEKWENCJONOWANIE GENOMÓW DWÓCH LINII KUKURYDZY ZWYCZAJNEJ (Pacbio RS version II).

II.2) Rodzaj zamówienia:
Usługi.

II.3) Określenie przedmiotu zamówienia:
Przedmiotem negocjacji jest sekwencjonowanie genomów dwóch linii kukurydzy zwyczajnej (Pacbio RS version II) w niżej podanym asortymencie i ilości: 1. Izolacja DNA z dwóch linii kukurydzy zwyczajnej - rozbicie komórek (liza (jeśli potrzebne) - izolacja DNA - analiza jakościowa i ilościowa (żel agarozowy) 2. Utworzenie (przygotowanie) bibliotek PacBio RS - fragmentacja DNA - wybór fragmentów o odpowiedniej długości (8-12 kb) - naprawa końców i ligacja adapterów - wydłużanie primerów - wydłużanie polimerazy 3. Sekwencjonowanie na PacBio RS: 200 Mb surowych danych - specyfikacja na jednostkę (60 jednostek na linię kukurydzy, 120 jednostek w sumie) - surowych danych większa niż 200 Mb (12 Gb wyprodukowanych dla jednej linii) - średnia typowa długość odczytów większa niż 4000 bp Dostarczenie: - surowych danych (fastq, bas. h5, metadata.xml).

II.4) Wspólny Słownik Zamówień (CPV):
73.11.00.00-6.

SEKCJA III: PROCEDURA

III.1) TRYB UDZIELENIA ZAMÓWIENIA:
Zamówienie z wolnej ręki

III.2) INFORMACJE ADMINISTRACYJNE

• 
  Zamówienie dotyczy projektu/programu finansowanego ze środków Unii Europejskiej:
  nie

SEKCJA IV: UDZIELENIE ZAMÓWIENIA

IV.1) DATA UDZIELENIA ZAMÓWIENIA:
04.02.2014.

IV.2) LICZBA OTRZYMANYCH OFERT:
1.

IV.3) LICZBA ODRZUCONYCH OFERT:
0.

IV.4) NAZWA I ADRES WYKONAWCY, KTÓREMU UDZIELONO ZAMÓWIENIA:

• GATC Biotech European Genome and Diagnostics Centre, {Dane ukryte}, Konstanz, kraj/woj. Niemcy.

IV.5) Szacunkowa wartość zamówienia
(bez VAT): 215020,00 PLN.

IV.6) INFORMACJA O CENIE WYBRANEJ OFERTY ORAZ O OFERTACH Z NAJNIŻSZĄ I NAJWYŻSZĄ CENĄ

• 
  Cena wybranej oferty:
  56480,00

• 
  Oferta z najniższą ceną:
  56480,00
  / Oferta z najwyższą ceną:
  56480,00

• 
  Waluta:
  EUR.

ZAŁĄCZNIK I

Uzasadnienie udzielenia zamówienia w trybie negocjacji bez ogłoszenia, zamówienia z wolnej ręki albo zapytania o cenę

• 
  1. Podstawa prawna
  

  Postępowanie prowadzone jest w trybie zamówienie z wolnej ręki na podstawie art. 67 ust. 1 pkt 1 lit. a ustawy z dnia 29 stycznia 2004r. - Prawo zamówień publicznych.

• 
  2. Uzasadnienia wyboru trybu
  

  Należy podać uzasadnienie faktyczne i prawne wyboru trybu oraz wyjaśnić, dlaczego udzielenie zamówienia jest zgodne z przepisami.

  uzasadnienie prawne: Działając zgodnie z art. 67 ust.1 pkt.1a Pzp, Zamawiający może udzielić zamówienia z wolnej ręki, jeżeli dostawy, usługi lub roboty budowlane mogą być świadczone tylko przez jednego wykonawcę z przyczyn technicznych o obiektywnym charakterze. Podstawą zastosowania tej przesłanki wyboru trybu udzielenia zamówienia jest szczególny charakter zamówienia powodujący, że może ono być zrealizowane tylko przez jednego wykonawcę. Zamówienia zamierza udzielić się wykonawcy, który posiada wyłączne prawo do wykonywania sekwencjonowania w technologii PacBio SMRT II uzasadnienie faktyczne: Zamawiana w firmie GATC usługa sekwencjonowania wysokoprzepustowego wykonywana będzie w technologii PacBio SMRT II. Technologia ta zapewnia unikatowe możliwości otrzymania odczytów o długości kilkunastu tysięcy par zasad. Takie odczyty są niezbędne do poprawnego złożenia genomów kukurydzy zawierających znaczne ilości sekwencji powtórzonych. Firma GATC jest jedynym komercyjnym wykonawcą sekwencjonowania w technologii PacBio SMRT II w Europie.