Dostawa zautomatyzowanego zdigitalizowanego systemu do amplifikacji kwasów nukleinowych przy użyciu emulsyjnego PCR w czasie rzeczywistym (ddPCR).

nie

Uniwersytet Gdański, Krajowy numer identyfikacyjny , ul. ul. Bażyńskiego  8, 80309   Gdańsk, woj. pomorskie, państwo Polska, tel. 58 523 23 20, e-mail sekretariatdzp@ug.edu.pl, faks 58 523 31 10.
Adres strony internetowej (url): www.ug.edu.pl

Dostawa zautomatyzowanego zdigitalizowanego systemu do amplifikacji kwasów nukleinowych przy użyciu emulsyjnego PCR w czasie rzeczywistym (ddPCR).

A120-211-129/18/SK

1.Kod CPV: 38000000-5. 2.Przedmiotem zamówienia jest dostawa zautomatyzowanego zdigitalizowanego systemu do amplifikacji kwasów nukleinowych przy użyciu emulsyjnego PCR w czasie rzeczywistym (ddPCR)dla Kolekcji Plazmidów i Drobnoustrojów Wydziału Biologii Uniwersytetu Gdańskiego. 3.Termin realizacji zamówienia: do 8 tygodni. 1)Szczegółowy opis przedmiotu zamówienia zawiera załącznik nr 4. 2)Integralną częścią zaproszenia do negocjacji jest projekt proponowanej umowy, stanowiący załącznik nr 2. 3)Rozliczenia prowadzone będą w złotych polskich. 4)Zamawiający dopuszcza możliwość korzystania z usług podwykonawców, Zamawiający żąda wskazania przez Wykonawcę części zamówienia, których wykonanie zamierza powierzyć Podwykonawcom i podania przez Wykonawcę firm Podwykonawców – w jednolitym dokumencie – załącznik nr 3

II.5) Główny Kod CPV:
38000000-5

Postępowanie prowadzone jest w trybie  z wolnej ręki  na podstawie art. 67 ust.1 pkt 1 lit.a  ustawy Pzp.

Należy podać uzasadnienie faktyczne i prawne wyboru trybu oraz wyjaśnić, dlaczego udzielenie zamówienia jest zgodne z przepisami.
Podstawa prawna: Zamówienie z wolnej ręki na podstawie art. 67 ust.1 pkt 1 lit. a ustawy z dnia 29 stycznia 2004 r. Prawo zamówień publicznych (tekst jednolity Dz. U. z 2017r. poz. 1579 z późn. zm.). Uzasadnienie wyboru trybu: Zautomatyzowany cyfrowy system do emulsyjnego PCR będzie wykorzystywany przez Kolekcję Plazmidów i Drobnoustrojów (KPD) do potwierdzania autentyczności zdeponowanego materiału biologicznego, jakościowej i ilościowej analizy udziału różnych grup drobnoustrojów w konsorcjach oraz do testowania możliwości zastosowania nowo odkrytych białek oddziaływujących z DNA (np. termostabilnych rekombinaz, polimeraz) w najnowocześniejszej technologii amplifikacji DNA. Technologia digital droplet PCR (ddPCR) służy do amplifikacji kwasów nukleinowych w układzie emulsyjnym z jednoczesną oceną ilościową uzyskanego produktu. Dzięki temu podejściu możliwa jest analiza wielu reakcji przebiegających niezależnie w oddzielnych mikrokroplach. W metodzie tej badana próbka zawierająca materiał genetyczny podlega frakcjonowaniu na 20 tysięcy mikrokropel (RioRad QX200). W każdej z nich możliwa jest detekcja cząsteczki kwasu nukleinowego przy pomocy odpowiednich barwników fluorescencyjnych. Po przeprowadzeniu reakcji emulsyjnego PCR w termocyklerze, przy pomocy czytnika fluorescencji i specjalistycznego oprogramowania – w czasie rzeczywistym – określa się liczbę mikrokropel, w których zaszła reakcja amplifikacji materiału genetycznego. W oparciu o uzyskane wyniki określa się bezwzględną liczbę cząsteczek docelowych w analizowanej próbce. Technika ddPCR charakteryzuje się znaczną tolerancją na czynniki hamujące reakcję PCR. Choć technologia ddPCR dopiero co wkracza do laboratoriów, znalazła już szerokie zastosowanie m.in. do wykrywania genetycznych determinant wirulencji u bakterii, określania miana wirusa, detekcji rzadkich mutacji bądź rzadkich wariantów genów; absolutnej analizy ilościowej ekspresji genów; określenia liczby kopii plazmidu w komórce. Jej ogromną zaletą jest wysoka czułość, a przede wszystkim – w porównaniu do techniki Real-time PCR – brak konieczności odniesienia do krzywych standardowych czy genu referencyjnego oraz możliwość analizy złożonych układów amplikonów. Firma BioRad Laboratories Inc. z siedzibą w USA, 1000 Alfred Nober Drive jest wyłącznym producentem na świecie automatycznego systemu do cyfrowej amplifikacji DNA w emulsji. Firma BioRad Polska Sp. z o.o. z siedzibą w Warszawie przy ul. Przyokopowej 33 jest jedynym przedstawicielem Bio-Rad na terenie Polski, i częścią koncernu Bio-Rad Laboratories Inc. z siedzibą w USA, 1000 Alfred Nober Drive.