Zakup aparatury badawczej - automatycznego sprzętu do elektroforezy i western blot dla Laboratorium Nanoonkologii Doświadczalnej i Klinicznej Wydziału Medycyny Weterynaryjnej.

nie

Szkoła Główna Gospodarstwa Wiejskiego - SZP, Krajowy numer identyfikacyjny 17845000000000, ul. ul. Nowoursynowska  166, 02-787  Warszawa, woj. mazowieckie, państwo Polska, tel. 225 931 390, e-mail wladyslaw_sadowski@sggw.pl, faks 225 931 391.
Adres strony internetowej (url): www.sggw.pl

Zakup aparatury badawczej - automatycznego sprzętu do elektroforezy i western blot dla Laboratorium Nanoonkologii Doświadczalnej i Klinicznej Wydziału Medycyny Weterynaryjnej.

SZP.250.7.2019

Przedmiotem zamówienia jest zakup aparatury badawczej - automatycznego sprzętu do elektroforezy i western blot dla Laboratorium Nanoonkologii Doświadczalnej i Klinicznej Wydziału Medycyny Weterynaryjnej.

II.5) Główny Kod CPV:
33100000-1

Postępowanie prowadzone jest w trybie  Zamówienie z wolnej ręki  na podstawie art. 67 ust.1 pkt.1  ustawy Pzp.

Należy podać uzasadnienie faktyczne i prawne wyboru trybu oraz wyjaśnić, dlaczego udzielenie zamówienia jest zgodne z przepisami.
W celu zapewnienia kontynuacji badań naukowych, prowadzonych w Pracowni Nanoonkologii Klinicznej i Doświadczalnej Zakładu Chorób Wewnętrznych Małych Zwierząt z Kliniką, Wydziału Medycyny Weterynaryjnej, Szkoły Głównej Gospodarstwa Wiejskiego w Warszawie, oraz terminowego i kompletnego wykonania realizowanych obecnie grantów: Sonata (nr UMO-2015/17/D/NZ5?04241, data zakończenia grantu: 23.02.2019 r.) oraz grantu ESR Krajowego Naukowego Ośrodka Wiodącego (nr 2018/CB/ESR5/1, data zakończenia: 30/09.2019 r.) niezbędny jest natychmiastowy zakup w pełni zautomatyzowanego sprzętu do izolacji, identyfikacji, ilościowego oznaczenia i immunodetekcji białek wykorzystującego nanoskopową ilość materiału biologicznego (automatyczny western blot). Ponadto, w związku z przeprowadzaną od października 2018 roku restrukturyzacją Pracowni, zgodnie z zaakceptowanym przez Ministerstwo Nauki i Szkolnictwa Wyższego harmonogramem restrukturyzacji na lata 2018-2019, źródłem materiału do badań będą pacjenci (psy, koty). Z dotychczasowych badań wstępnych wiemy, że materiał od nich uzyskiwany jest w nanoobjętościach i niejednokrotnie nie wystarcza do przeprowadzenia wszystkich badań z użyciem klasycznych aparatów do western blot oraz elektroforezy. W prowadzonych obecnie badaniach dysponujemy niewielką ilością materiału biologicznego (komórki nowotworowe włókniakomięsaków kotów, mikroguzy – włókniakomięsaki kotów wyhodowane na zarodkach kurzych), z których, zgodnie z założeniami projektów, ma zostać wyizolowanych i zidentyfikowanych kilkanaście białek odpowiadających za zjawisko oporności wielolekowej (m.in. PgP, ANXA3, ANXA5, MNS-1) oraz ma zostać przeprowadzona ilościowa analiza ich ekspresji w liniach komórkowych oraz guzach nowotworowych wrażliwych i opornych na doksorubicynę. Otrzymane wyniki powinny być wysoce powtarzalne oraz obarczone jak najmniejszym błędem, a dokonana przez zintegrowany system komputerowy analiza (z wykorzystaniem technik chemiluminescencji, fluorescencji, podczerwieni) precyzyjna i jak najbardziej dokładna, eliminującej czynnik ludzki jako źródło błędów w trakcie zasadniczej procedury badawczej. Standardowy sprzęt do western blot wymaga działań manualnych laboranta, co jest źródłem błędów laboratoryjnych. Standardowy czas wykonania badań western blot trwa 2 dni, co w przypadku wielu próbek powoduje ich degradację. Wykorzystanie tak nowoczesnej i unikatowej aparatury, umożliwi publikację uzyskanych wyników w czasopismach naukowych z wysokim współczynnikiem Impact Factor. W związku z powyższym niezbędny jest zakup sprzętu, który będzie spełniał łącznie następujące warunki: 1. Pełna automatyzacja tzw. „hands-free” 2. Nanoskopowa ilość materiału potrzebna do wykonania analizy – 40 nL / próbkę 3. Krótki czas wykonania analizy - przeprowadzenie kompletnej analizy 25 próbek w ciągu 3 godzin 4. Wbudowana normalizacja białek 5. Wielokanałowość – połączenie metod chemiluminescencji z fluorescencją i podczerwienią Ad. 1 Pełna automatyzacja badań – „hands-free” - eliminuje czynnik ludzki jako źródło błędu laboratoryjnego oraz zapewnia wysoką powtarzalność wyników Ad. 2 Nanoskopowa ilość materiału do analizy umożliwia wykorzystanie niewielkiej ilości cennego materiału biologicznego do wykonania wielu analiz równocześnie oraz jego pełnego wykorzystania Ad 3 Standardowa manualna analiza western blot trwa 2 dni – 3-godzinna automatyczna analiza umożliwi przeprowadzenie badań dużej ilości białek, w wielu powtórzeniach w bardzo krótkim czasie, co umożliwi terminową realizację grantów, szczególnie, że badania wykonywane na materiale pochodzącym od zwierząt wymagają optymalizacji warunków wykonywania analiz, co wymaga wykonania kilkunastu, a często kilkudziesięciu powtórzeń, w celu uzyskania wiarygodnych wyników dla analizy jednego białka Ad 4 Automatyzacja procesu jest niezbędna do uzyskania porównywalnych w procesie analitycznym próbek, a tym samym wiarygodnych wyników Ad 5 Identyfikację względnej ekspresji białka między próbkami w trakcie jednej analizy, przez co możliwe jest różnicowanie białek o zbliżonej masie molekularnej, a co w standardowej metodzie wymaga wykonania dodatkowego badania i wydłuża proces analityczny Jedynym dostępnym na rynku sprzętem, spełniającym łącznie wszystkie wskazane kryteria, jest sprzęt Jess Protein Simple , co związane jest z ochroną praw wyłącznych ze względu na posiadane patenty międzynarodowe: patenty USA nr: 8,021,611; 7,935,489; 7,935,479; 7,935,308; 7,846,676 oraz dodatkowo wydane i oczekujące patenty w USA i innych krajach. Na rynku nie istnieją rozwiązania alternatywne czy rozwiązania zastępcze o podobnej technologii, który spełniałyby wszystkie wymienione kryteria, niezbędne do terminowej i kompleksowej realizacji zaplanowanych badań. Western blot i aparaty do elektroforezy oferowane przez inne, konkurencyjne firmy (m.in. BioRad, ThermoFisher Scientific, Biocompare, VWR, Sigma Aldrich) nie posiadają następujących niezbędnych dla naszych badań właściwości: - nanoskopowa ilość materiału – 40 nL/próbkę, w przypadku sprzętu konkurencji wymagane jest średnio 15 ul, co jest 375 razy więcej. Materiał pobierany od pacjentów w wielu przypadkach nie wystarcza na wykonanie analiz z wykorzystaniem dotychczas posiadanego sprzętu. - pełna automatyzacja eliminująca błędy laboratoryjne – w przypadku wykorzystania sprzętów oferowanych przez konkurencję wszystkie czynności laboratoryjne wykonywane są przez laboranta – źródło błędów - czas wykonywania pojedynczego badania – w przypadku proponowanego sprzętu badanie wykonane jest w 3 godziny, w przypadku sprzętu oferowanego przez konkurencję najwięcej wykonane jest w ciągu 2 dni Rozszerzenie spectrum badań w szczególności o część kliniczną wymaga sprzętu o powyższych właściwościach, co dotychczas przy zastosowaniu klasycznego western blota i aparatu do elektroforezy w wielu przypadkach było niemożliwe. Należy podkreślić również, że będzie to unikatowy sprzęt w Polsce. Poprzednią wersję zaproponowanego sprzętu, która nie uwzględniała normalizacji białek oraz badań z wykorzystaniem technik fluorescencyjnych i podczerwieni, posiada jedynie Wydział Biologii Uniwersytetu Gdańskiego. Dla potwierdzenia wysokiej jakości wyników badań naukowych uzyskanych z wykorzystaniem tego sprzętu przedstawiam wybrane światowe publikacje naukowe: 1. Development of an automated capillary nano-immunoassay—Simple Western assay—to quantify total TDP43 protein in human platelet samples Anthony Fourier, Jean Escal, Emilien Bernard, Ingolf Lachman, Armand Perret-Liaudet, Pascal Leblanc, Isabelle Quadrio Analytical and Bioanalytical Chemistry, Nov 2018; 10.1007/s00216-018-1437-4 2. Vitamin-B12-conjugated sericin micelles for targeting CD320-overexpressed gastric cancer and reversing drug resistance Weihong Guo, Lizhi Deng, Zhaoyu Chen, Zhian Chen, Jiang Yu, Hao Liu, Tuanjie Li, Tian Lin, Hao Chen, Mingli Zhao, Liming Zhang, Guoxin Li, Yanfeng Hu Nanomedicine, Oct 2018; 10.2217/nnm-2018-0321 3. Translational control of tumor immune escape via the eIF4F–STAT1–PD-L1 axis in melanoma Michaël Cerezo, Ramdane Guemiri, Sabine Druillennec, Isabelle Girault, Hélène Malka-Mahieu, Shensi Shen, Delphine Allard, Sylvain Martineau, Caroline Welsch, Sandrine Agoussi, Charlène Estrada, Julien Adam, Cristina Libenciuc, Emilie Routier, et. al Nature Medicine, Oct 2018; 10.1038/s41591-018-0217-1 4. The contribution of hormone sensitive lipase to adipose tissue lipolysis and its regulation by insulin in periparturient dairy cows Jenne De Koster, Rahul K. Nelli, Clarissa Strieder-Barboza, Jonas de Souza, Adam L. Lock, G. Andres Contreras Scientific Reports, Sep 2018; 10.1038/s41598-018-31582-4 5. Alterations of 63 hub genes during lingual carcinogenesis in C57BL/6J mice Hua Liu, Jianjiao Li, Ying Yang, Liu Liu, Lifu Yu, Minsong Tu, Ruihong Yuan, Wanyuan Yue, Qi Luo, Yonghua Ruan, Xiaoming Dai Scientific Reports, Aug 2018; 10.1038/s41598-018-31103-3 6. Detection of the Cell Cycle-Regulated Negative Feedback Phosphorylation of Mitogen-Activated Protein Kinases in Breast Carcinoma using Nanofluidic Proteomics Yasuyo Urasaki, Ronald R. Fiscus, Thuc T. Le Scientific Reports, Jul 2018; 8(1):9991. doi: 10.1038/s41598-018-28335-8 7. FAK auto-phosphorylation site tyrosine 397 is required for development but dispensable for normal skin homeostasis Joel B. Heim , Cera A. McDonald , Saranya P. Wyles, Sindhuja Sominidi-Damodaran, Edwin J. Squirewell, Ming Li, Catherine Motsonelidze, Ralph T. Böttcher, Jan van Deursen, Alexander Meves PLoS One, Jul 2018; 13(7):e0200558. doi: 10.1371/journal.pone.0200558 Podsumowując, natychmiastowy zakup wyżej wymienionego sprzętu jest konieczny: - w celu kontynuacji rozpoczętych w ramach grantów badań naukowych i ich terminowej realizacji oraz rozszerzenia badań o część kliniczną zgodnie z harmonogramem restrukturyzacji Pracowni Nanoonkologi Klinicznej i Doświadczalnej w latach 2018-2019 - ze względu na pełną automatykę eliminującą czynnik ludzki i błąd laboratoryjny w uzyskanych wynikach, - nanoskopową ilość materiału potrzebną do badań, co jest konieczne w przypadku materiału w nanoobjętościach pochodzącego od pacjentów (psy, koty) pobranego przyżyciowo metodą biopsji cienkoigłowej - automatyczną normalizację białek oraz krótki czas wykonania badań umożliwiający kompleksowe zrealizowanie zaplanowanych badań do końca trwania aktualnie realizowanych projektów badawczych W związku z zaistnieniem ww. okoliczności: udzielenie zamówienia z wolnej ręki na podstawie art. 67 ust. 1 pkt 1 ustawy Prawo Zamówień Publicznych.