Dostawa mikromacierzy na potrzeby I Katedry Pediatrii i Kliniki Pediatrii, Alergologii i Kardiologii Uniwersytetu Medycznego we Wrocławiu

Opis przedmiotu przetargu: 1. Dostawa mikromacierzy do oceny metylacji całogenowej WG-317-1003 Infinium MethylationEPIC BeadChp Kit (96 oznaczeń) lub równoważnej (tj. zgodnej z opisem podanym w pkt. 2), do wykorzystania na aparacie Illumina z systemem HiScan, iScan na potrzeby I Katedry Pediatrii i Kliniki Pediatrii, Alergologii i Kardiologii Uniwersytetu Medycznego we Wrocławiu. 2. Mikromacierz ma umożliwić analizę metylacji DNA na platformach Illumina iScan i HiScan. Mikromacierz musi zawierać dane z projektów ENCODE i FANTOM5 i pokrywać >90% oryginalnych miejsc CpG z macierzy HumanMethylation450 BeadChip oraz dodatkowe 350 000 w regionach typu „enhancer”. W mikromacierzy zgodnie z zaleceniami ekspertów należy zawrzeć następujące kategorie: 1) Miejsca CpG poza wyspami CpG. 2) Miejsca nie-CpG miejsca zidentyfikowane w ludzkich komórkach macierzystych (CHH sites). 3) Miejsca zidentyfikowane, jako różnie metylowane regiony w komórkach nowotworowych w porównaniu do komórek zdrowych oraz różnie metylowane w różnych tkankach. 4) FANTOM5 enhancers. 5) ENCODE “open chromatin” oraz “enhancers”. 6) Region hiperwrażliwości dla DNazy. 7) Regiony promotorowe miRNA. 8) >90% regionów zawartych w Illumina HumanMethylation450 BeadChip. Wymagany input: 250ng DNA (w zestawie muszą znajdować się wszystkie wymagane odczynniki, poza konwersją DNA z wykorzystaniem bisulfitu). 3. Dostawa do Instytutu Zootechniki Państwowego Instytutu Badawczego, Balice k. Krakowa. 4. Termin ważności oznaczeń, wchodzących w skład mikromacierzy: co najmniej 3 miesiące od daty dostawy (termin ten stanowi kryterium oceny ofert).