ZP/112/2013 Dostawa odczynników diagnostycznych oraz sprzętu laboratoryjnego dla Instytutu CZMP

Opis przedmiotu przetargu: ZP/112/2013 Dostawa odczynników diagnostycznych oraz sprzętu laboratoryjnego dla Instytutu CZMP
Pakiet 1
1.Zestaw do izolacji DNA z próbek ludzkich tkanek z zastosowaniem szybkich metod z kolumienkami wirowniczymi lub systemem próżniowym. Metoda izolacji nie wymaga użycia mieszaniny fenol-chloroform. Procedura izolacji opiera się na adsorpcji izolowanego DNA do membran krzemionkowo-żelowych. Zestaw ma zapewnić oczyszczanie DNA z różnych tkanek ludzkich, w tym mięśni, wątroby, serca, mózgu, szpiku kostnego, oraz innych tkanek, wymazów (z jamy ustnej, oka, nosowych, gardła i innych), płynu mózgowo-rdzeniowego, krwi, płynów ustrojowych i komórek moczu. Zestaw musi zapewniać izolację DNA genomowego, bakteryjnego, pasożytniczego i wirusowego.DNA powinno być oczyszczane z tkanki o objętości do 25 mg lub płynów ustrojowych w objętości do 200 µl, w czasie 20 minut, i eluowane w 50-200 µl. W efekcie izolacji należy otrzymać 4-12 µg DNA. Zestaw przeznaczony do 50 izolacji, zawierający 50 kolumienek wirowniczych z membranami krzemionkowo-żelowymi, 150 probówek o pojemności 2 ml, 12 ml buforu do lizy (AL), bufory do przemywania AW1 (19 ml), AW2 (13 ml), 12 ml buforu elucyjnego AE, probówkę z proteazą i 1,2 ml rozpuszczalnika proteazy.(typu QIAamp DNA Blood Mini Kit 50) - 3zest.
Pakiet 2
1.Zestaw do szybkiej i wydajnej izolacji DNA genomowego o wysokiej czystości z krwi świeżej lub mrożonej (ludzkiej lub ssaczej). Procedura izolacji DNA musi składać się z 5 etapów i opierać się na wykorzystaniu minikolumn wirowniczych. W pierwszym etapie przeprowadzana jest liza erytrocytów, zaś w drugim etapie liza enzymatyczna białych krwinek z wykorzystaniem zoptymalizowanego buforu WBC Lysis Buffer i silnej proteazy (proteinazy K). Procedura izolacji ma zapewnić otrzymanie 3-10 µg DNA z ludzkiej krwi. Pojemność złoża używanego do izolacji wynosi ok. 27 µg DNA, czas izolacji wynosi ok. 25 minut. Zestaw przeznaczony do 150 izolacji, zawierający 150 minikolumn wirowniczych, 150 probówek o pojemności 2 ml, 150 ml buforu lizującego czerwone krwinki (RBC Lysis Buffer), 30 ml buforu lizującego białe krwinki (WBC Lysis Buffer), 3 opak. Liofilizowanej proteinazy K, 600 µl buforu dla proteinazy K, 60 ml buforu wiążącego (BB Buffer), 150 ml buforu do przemywania (BW Buffer) i 30 ml buforu elucyjnego (Elution Buffer: 10 mM Tris-HCl, pH 8,5). (typu Extractme DNA Blood Kit - zestaw do izolacji genomowego DNA ze świeżej i mrożonej krwi) - 1 zest.
Pakiet 3
1.Roztwór do nanoszenia próbek DNA na żele agarozowe i poliakrylamidowe, sześciokrotnie stężony, dostarczany w objętości 1 ml. Roztwór zawiera 20 mM Tris-HCl (pH 7.6), 60 mM EDTA, 0.15% orange G, 0.03% cyjanol ksylenu FF oraz 15% Ficoll 400. Zawarty w roztworze Ficoll 400 zapewnia obciążenie cząsteczek DNA, dzięki czemu próbka szybko dyfunduje na dno studzienki w żelu agarozowym lub poliakrylamidowym. EDTA wiąże dwuwartościowe jony metali, inaktywując nukleazy i inne enzymy wymagające tych jonów do działania (ochrona DNA). Barwnik orange G migruje na wysokości odpowiadającej ok. 50 pz, zaś cyjanol ksylenu FF migruje na wysokości ok. 4 kpz w 1% żelu agarozowym. (typu GREEN (6x) - roztwór do nanoszenia DNA, 1 ml) - 4 szt.
Pakiet 4
1.Mieszanina reakcyjna optymalizowana do ilościowego PCR z sondami hydrolizującymi. Dostarczana jako gotowa do użycia mieszanina, 2 x stężona. W składzie mieszaniny nie może być barwnika referencyjnego. Barwnik referencyjny CXR dostarczany w oddzielnej probówce. Mieszanina zapewnia oporność systemu na szerokie spektrum inhibitorów reakcji PCR. Mieszanina zawiera polimerazę typu hot-start, z miejscem aktywnym blokowanym przeciwciałem, umożliwiającą przygotowanie reakcji w temperaturze pokojowej. Mieszanina odpowiednia do zastosowania zarówno w szybkich jak i standardowych metodach PCR, zapewniająca czułą detekcję produktu w każdym typie aparatu. Użycie mieszaniny zapewnia otrzymanie wiarygodnych wyników i wysoką wydajność reakcji.(typu GoTaq Probe qPCR MasterMix, 200 reakcji) - 4 zest.
Pakiet 5
1.Zestaw zawierający uniwersalną mieszaninę reakcyjną do ilościowych reakcji real-time PCR i dwu-etapowego real-time PCR, do zastosowania w większości dostępnych aparatów real-time PCR. Mieszanina zawiera polimerazę typu Perpetual Taq DNA Polymerase, optymalizowany bufor reakcyjny, dNTPs (w tym dTTP częściowo zastąpione dUTP) oraz barwnik SYBR Green I. Polimeraza typu Perpetual Taq DNA Polymerase zawiera rekombinowaną polimerazę Taq DNA Polymerase związaną do przeciwciał monoklonalnych anti-Taq, blokujących aktywność polimerazy w umiarkowanych temperaturach. Aktywność polimerazy jest wzbudzana na etapie początkowej denaturacji, w temp. 95oC, przez co najmniej 2 minuty. Barwnik SYBR Green I wiąże się do dwuniciowego DNA, emitując sygnał fluorescencyjny. Maksimum wzbudzania barwnika zachodzi przy 494 nm, zaś emisji - przy 521 nm. Zestaw zawiera 10 probówek po 1,25 ml mieszaniny reakcyjnej; 270 µl UNG (uracil-N-glycosylase) o stężeniu 1 U/µl i 10 probówek po 1,25 ml wody wolnej od nukleaz. Zamawiany wariant zestawu nie zawiera barwnika referencyjnego ROX. (typu SG qPCR MasterMix (2x), real-time PCR kit) - 1 zest.
Pakiet 6
1.Enzym restrykcyjny Hsp92II, opakowanie 1000u, standardowy tj. nie szybko schnący, stężenie 10 U/µl - 1 op.
Pakiet 7
1.Zestaw do 100 izolacji DNA z różnych rodzajów materiałów, w tym krwi pełnej, hodowli komórkowych i tkanek. Procedura izolacji DNA opiera się na zastosowaniu kolumienek (high pure filter tubes) z filtrami wykonanymi z dwóch warstw włókna szklanego. Zestaw zawiera bufor lizujący tkanki - Tissue Lysis Buffer: 4 M mocznik (urea), 200 mM Tris, 20 mM NaCl, 200 mM EDTA, pH 7.4; bufor wiążący - Binding Buffer: 6 M guanidine-HCl, 10 mM mocznik, 10 mM Tris-HCl, 20% Triton X-100 (v/v), pH 4.4; liofilizowaną proteinazę K; bufor usuwający inhibitory - Inhibitor Removal Buffer: 5 M guanidine-HCl, 20 mM Tris-HCl, pH 6.6; bufor do przemywania - Wash Buffer: 20 mM NaCl, 2 mM Tris-HCl, pH 7.5 oraz bufor do elucji - Elution Buffer: 10 mM Tris-HCl, pH 8.5. Otrzymany DNA jest gotowy do użycia w reakcji PCR i reakcjach trawienia restrykcyjnego. (typu High Pure PCR Template Preparation Kit) - 1 op.
Pakiet 8
1.Kapilary szklane lub wykonane z optycznego poliwęglanu do zastosowania w aparacie LightCycler 2.0. Objętość 20 ul. Opakowanie zawierające 5 pudełek po 96 kapilar. (typu LightCycler Capillaries) - 3 op.
Pakiet 9
1.Oligonukleotydy DNA standardowe, oczyszczane standardowo, nie HPLC, skala syntezy 0,04 µM, Sekwencje nukleotydowe starterów:
TLR2.Met.For 5 -GAGGTCCAGAGTTCCCTCCG-3
TLR2.Met.Rev 5 -CCGGGACTAGGAAGTAAGCA-3
TLR4.Met.For 5 -AAAGGGGAAATGGGGAGTTA-3
TLR4.Met.Rev 5 -TTTTGCAGGACACAATTTGG-3
BAD.For 5 -CCCAGAGTTTGAGCCGAGTG-3
BAD.Rev 5 -CCCATCCCTTCGTCGTCCT-3
BAX.For 5 -CCCGAGAGGTCTTTTTCCGAG-3
BAX.Rev 5 -CCAGCCCATGATGGTTCTGAT-3
BCL2.For 5 -TTGGCCCCCGTTGCTTTTCCTC-3
BCL2.Rev 5 -TCCCACTCGTAGCCCCTCTGCGAC-3
CASP3.For 5 -CATGGAAGCGAATCAATGGACT-3
CASP3.Rev 5 -CTGTACCAGACCGAGATGTCA-3
CASP9.For 5 -CTTCGTTTCTGCGAACTAACAGG-3
CASP9.Rev 5 -GCACCACTGGGGTAAGGTTT-3
BID.For 5 -CTTCGTTTCTGCGAACTAACAGG-3
BID.Rev 5 -GCACCACTGGGGTAAGGTTT-3 336 szt.
Pakiet 10
1.AciI, 200 U. Enzym restrykcyjny, standardowy (tj. nie szybko tnący/trawiący) - 1 op.
Pakiet 11
1.Xagl, 1000 U. Enzym restrykcyjny, standardowy (tj. nie szybko tnący/trawiący) - 1 op.
Pakiet 12
1.Toxoplasma WB IgG/IgM - wysoce czuły (czułość >90%) i specyficzny ( specyficznosć 100 %) zestaw poprawiający w sposób znaczący jakosc neonatalnej diagnostyki serologicznej wrodzonej toksoplazmozy przyz uzyciu porównawczych profili immunologicznych (CIP):
podczas narodzin, pomiędzy krwią pępowinową i surowicą matki
-w postnatalnych badaniach kontrolnych, pomiędzy surowicą noworodka i krwią pępowinową.
Zasada Testu: Antygen Toxoplasma gondii są rozdzielane metodą elektroforezy na poszczególne prążki i przenoszone metodą elektro blottingu na membrany nitrocelulozowe. Paski są inkubowane ze znakowanym alkaliczną fosfatazą - przeciwciałami anty - ludzkimi klasy IgM i IgG. Specyficzne przeciwciała przeciwko T. gondii IgG i IgM, jeśli są obecne w próbkach surowic S1 i/lub S2 pojawiają sie w postaci fioletowych prążków. Porównanie matryc S1/S2 IgG i S1/S2 IgM WB pozwala na różnicowanie pomiędzy przeciwciałami pojawiającymi sie w sposób pasywny a aktywnie syntetyzowanymi neo - przeciwciałami (obecne dodatkowe prążki na pasku z próbką pobrana od noworodka).
Zestawi zawierający:
4x24 numerowanych pasków testowych z nitrocelulozy z naniesionymi rozdzielonymi elektroforetycznie antygenami T. gondii,
120 ml buforu do próbek,
240 ml koncentratu płynu płuczącego,
60 ml konjugatu anty - IgM i 60 ml konjugatu anty - IgG,
120 ml substratu (bufor+NBT+BCIP+stabilizatory) - 1 zest.
Pakiet 13
1.Zestaw elisa dp oznaczania ilościowego cystatyny C w surowicy i moczu, czułosc niższa lub równa: 0,23 ng/ml, zakres: < 3,3 do 100 ng/ml, współczynniki zmienności (CV%) pomiędzy zestawami (inter-assay), dla średnich stężeń mierzonych w surowicy musi nizszy niz 6%. (typu Human Cystatin C Quantikine Elisa Kit (DSCTO) - 2 zest.
Pakiet 14
1.Roztwór buforowy do kalibracji pH 4.0 - 1 op.
2.Roztwór buforowy do kalibracji pH 7.0 - 1 op.
Pakiet 15
1.Zestaw odczynnikowy do oznaczenia ludzkiego IFN-ganna typu HS (o wysokiej czułości) w materiale pochodzenia ludzkiego. Metoda Elisa hs (o wysokiej czułości). Zestaw zawiera wszystkie niezbedne odczynniki do nastawienia badania. Czułosć 0,06 pg/ml, zakres 0,16 - 10 pg/ml. Antygen rekombinowany ludzki IFN-gamma. Standaryzacja międzynarodowa - standard NIBSC 82/587. (typu Human IFN-gamma High Sensitivity ELISA Kit) - 1 zest.
2.Zestaw odczynnikowy do oznaczania ludzkiej IL-8 w materiale pochodzenia ludzkiego, czułosć 7,5 pg/ml, zakres 31,2 - 2000 pg/ml. Metoda Elisa. Odczyt testu przy 450 nm. Zestaw zawiera wszystkie niezbedne odczynniki do nastawienia badania. (typu Human CXCL8/IL-8 Quantikine ELISA Kit) - 1 zest.
3.Zestaw odczynnikowy do oznaczania ludzkiej IL-1beta w materiale pochodzenia ludzkiego, czułosć 1 pg/ml, zakres 3,9 - 250 pg/ml. Metoda Elisa. Odczyt testu przy 450 nm. Zestaw zawiera wszytskie niezbędne odczynniki do nastawienia badania. (typu Human IL-1 beta/IL-1F2 Quantikine ELISA Kit) - 1 zest.
Pakiet 16
1.Roztwór PBS - 3 op.
Pakiet 17
1.Ghrelin EIA Kit - 1 zest.
2.Obestatin EIA Kit - 1 zest.
Pakiet 18
1.Zestaw do przeprowadzania odwrotnej transkrypcji z inhibitorem RNAzy. Zestaw do przeprowadzania odwrotnej transkrypcji zawiera: wszytskie potrzebne komponenty do konwersji RNA w cDNA (random, primiery, zoptymalizowany bufor, dNTPy, MulitScribe MuLV reverse transcriptase), zawiera inhibitor RNas, objętość prowadzonej reakcji to 20µl,wystarczający do przeprowadzenia 1000 reakcji.Sugerowana wielkość opakowania to 1000 reakcji.(typu TF,HIGH CAP CDNA REV TRANS KIT) - 2 op.
2.Optyczne Mikropłytki reakcyjne 96-dołkowe. Mikropłytki reakcyjne MicroAmp 96-Well Reaction Plate lub równoważne:z 96 dołkami o pojemności 0,2 ml,optycznie (fluorescencyjnie) neutralne, konfekcjonowane fabrycznie, po 20 sztuk w opakowaniu, z kodem kreskowym. (typu MicroAmp Optical 96-Well Reaction Plate with Barcode) - 4 op.
3.Zestaw zawierający: 20 mikropłytek reakcyjnych 96-dołkowych kompatybilne rozmiarowo do optycznych 96-dołkowych mikropłytek reakcyjnych, wykonane z cienkiej, przezroczystej folii, zapewniającej optyczne i szczelne nakrycie mikropłytek reakcyjnych, aplikator pozwalajacy na równomierne i dopasowane umieszczenie płytki, oraz nakładkę uszczelnijącą. (typu MicroAmp Optical Adhesive Film Kit) - 6 op.
Pakiet 19
1.Ammonium persulfate (nadsiarczan amonu) - op. 100 g. Wymagania - odczynnik do elektroforezy/biologii molekularnej (co najmniej 98%; zawartość jonów chlorkowych - <10 ppm; żelaza - <10 ppm; metali ciężkich - <10 ppm) - 1 op.
2.Anti-MBL2 antibody produced in rabbit (królicze przeciwciała przeciwko ludzkiej lektynie wiążącej mannan) - 2 op. 100 ul. Wymagania - przeciwciała poliklonalne, izolowane za pomocą chromatografii powinowactwa, zawieszone w buforowanym roztworze glicerolu, skierowane przeciwko fragmentowi białka o sekwencji:DGDSSLAASERKALQTEMARIKKWLTFSLGKQVGNKFFLTNGEIMTFEKVKALCVKFQASVATPRNAAENGAIQNLIKEEAFLGITDEKTEGQFVDLTGNRLTYTNWNEGEPNNAGSDEDCVLLLKNGQWNDVPCSTSH - 2 op.
3.Anti-MASP2 antibody produced in rabbit (królicze przeciwciała przeciwko ludzkiej proteazie MASP-2) - 2 op. 100 ul. Wymagania - przeciwciała poliklonalne, izolowane za pomocą chromatografii powinowactwa, zawieszone w buforowanym roztworze glicerolu, skierowane przeciwko fragmentowi białka o sekwencji: GFPGEYANDQERRWTLTAPPGYRLRLYFTHFDLELSHLCEYDFVKLSSGAKVLATLCGQESTDTERAPGKDTFYSLGSSLDITFRSDYSNEKPFTGFEAFYAAEDIDECQVAPGEAPTCDHHCHNHLGGFYCSC - 2 op.