DOSTAWA KOMPUTEROWYCH PAKIETÓW OPROGRAMOWANIA SPECJALISTYCZNEGO cz. IV ; Nr sprawy: UM-ZP-262-77/11 w 4 zadaniach
Opis przedmiotu przetargu: 1.Przedmiotem zamówienia jest dostawa komputerowych pakietów oprogramowania specjalistycznego w czterech następujących zadaniach: Zadanie nr 1 -Dieta 4.0. wersja rozszerzona - producent: Zakład Żywności i Żywienia w Warszawie Zakład Epidemiologii i Żywienia - wieczysta licencja lub równoważny - 1 szt. Zadanie nr 2 - ACD Structure Design Siute - producent: Advenced Chemistry Development, INC., (ACD/Labs) - wieczysta licencja lub równoważny - 1 szt. Zadanie nr 3 - ImaGene Nexus do analizy statystycznej - producent BioDiscovery- licencja miesięczna lub równoważny - 1 szt. Zadanie nr 4 - Nexus 5 Copy Number 1 - producent BioDiscovery - roczna pełna licencja lub równoważny - 1 szt. 2.Oferowany przez Wykonawcę przedmiot zamówienia ( oprogramowania ) musi spełniać parametry techniczne i użytkowe, możliwości zastosowania i funkcjonalności - zawarte w niniejszej SIWZ. 3.Zamawiający wymaga zaoferowania przedmiotu zamówienia nowego, kompletnego i gotowego do użycia ( tj. bez żadnych zbędnych i dodatkowych inwestycji). 4.Ilekroć w opisie przedmiotu zamówienia zawartym w SIWZ wskazane zostały normy , znaki towarowe, patenty lub pochodzenie, zamawiający dopuszcza rozwiązania równoważne. 5.Za ofertę równoważną Zamawiający uzna tę która spełnia wszystkie wymagania Zamawiającego określone w opisie przedmiotu zamówienia zawartym w rozdziale IV SIWZ 6.Ewentualne wskazanie przez Zamawiającego nazwy produktu lub nazwy producenta ma na celu, określenie klasy produktu będącego przedmiotem zamówienia i służy ustaleniu standardu; nie wskazują natomiast na konkretny wyrób lub konkretnego producenta. 7.Wykonawca który powoła się na rozwiązania równoważne jest zobowiązany wskazać że oferowany przez niego przedmiot zamówienia spełnia wymagania określone przez Zamawiającego. Zadanie nr 1 - DIETA 4.0 wersja rozszerzona - producent: Zakład Żywności i Żywienia w Warszawie Zakład Epidemiologii i Żywienia lub równoważny 1.Program komputerowy z 2009, z 2010 r lub 2011 r. - Dieta 4.0 opracowany w Zakładzie Epidemiologii i Norm Żywienia, Instytutu Żywności i Żywienia lub równoważny. 2.Wymagania dotyczące programu: Program komputerowy DIETA 4.0 ma służyć do wyliczania wartości odżywczej i składu spożywanej diety oraz do planowania diety. 3.Baza programu winna zawierać aktualne informacje pochodzące m. in. z : 3.1. Tabel składu i wartości odżywczych żywności: Kunachowicz H., Nadolna I., Przygoda B., Iwanow K, PZWL, 2005. 3.2. Dieta bezglutenowa - co wybrać? Wartość odżywcza produktów i potraw. Kunachowicz H. PZWL, 2001 3.3. Znowelizowanych Norm Żywienia Człowieka: Jarosz M., Bułhak-Jachymczyk B., PZWL, 2008, w których uwzględniono nowe poziomy zapotrzebowania uwzględniające poziom aktywności fizycznej oraz EAR, RDA, AI, UL . 4. Baza programu winna zawierać również: +ponad 1300 suplementów diet aktualnie zarejestrowanych preparatów +ponad 1700 potraw i produktów, w tym: - produkty wzbogacane - produkty bezglutenowe - wody mineralne - potrawy typu fast-food - odżywki dla dzieci - napoje energetyzujące i izotoniczne oraz +nowe receptury potraw 5.Program winien posiadać możliwość wielu obliczeń statystycznych z uwzględnieniem nowych sposobów wyliczenia realizacji norm (metodą prawdopodobieństwa i punktów odcięcia) - wersja rozszerzona. 6.Program winien posiadać możliwość eksportowania danych indywidualnego spożycia. 7.Program winien umożliwiać pracę również w najnowszych systemach operacyjnych, VISTA i WINDOWS 7. 8.Program co najmniej jednostanowiskowy (jeden program na jeden komputer). 9.Minimalne warunki konieczne dla oprogramowania aby mogło być wykorzystywane do prac dydaktyki oraz naukowych to: 9.1.Duża baza suplementów diety z możliwością aplikacyjną wykorzystania do oceny żywienia. 9.2. Aktualna krajowa baza danych produktów, potraw i produktów specjalnego przeznaczenia. 9.3. Możliwość eksportu danych np. do Excela, dBase itp. 9.4.Obliczenia z uwzględnieniem najnowszych norm (EAR, AI, RDA, UL) 9.5. Analiza danych metodą prawdopodobieństwa i punktów odcięcia. 10.Ponadto program winien umożliwiać obliczenie ilości składników odżywczych pochodzących : 10.1. tylko z produktów i potraw nie wzbogacanych, 10.2. tylko z produktów i potraw wzbogacanych 10.3. ze wszystkich produktów i potraw 10.4. z farmakologicznych preparatów witaminowych, mineralnych i mieszanych - witaminowo -mineralnych, 10.5. z produktów i potraw wzbogacanych oraz farmakologicznych preparatów witaminowych , mineralnych i mieszanych - witaminowo-mineralnych 10.6. pochodzących ze wszystkich źródeł łącznie. 11.Program komputerowy jest unikatowym programem komputerowym, winien służyć do oceny żywienia indywidualnego i grupowego, a także do planowania i bieżących analiz spożycia badanych grup ludności na tle norm żywienia. 12.Program winien umożliwiać obliczenia wartości energetycznej i odżywczej diet, a także wielkości spożycia produktów i potraw, porównanie obliczonej wartości odżywczej do norm z uwzględnieniem nowego podejścia do oceny dostateczności spożycia składników metodami prawdopodobieństwa i punktu odcięcia (6.1-6.5). 13.Program winien również do obliczania wartości odżywczej jadłospisów w żywieniu zbiorowym, projektowania i oceny stopnia realizacji modelowych diet, szacowania wartości odżywczej potraw bez uwzględniania, lub z uwzględnianiem wielkości strat technologicznych. 14.Dodatkowo program winien zapewnić: 14.1. standaryzację sposobu wprowadzanych danych o spożywanych produktach i potrawach (kolejność i dokładność określania rodzaju i składu potraw); 14.2. standaryzację receptur potraw; 14.3. standaryzację określania wielkości porcji (wybór wielkości porcji z zaproponowanych w programie); 14.4. Standaryzację sposobu obliczania (jednakowe wielkości redukcji) i uzyskiwanych wyników (liczba składników, porównanie z normami). 15. Programu winien w sposób wystandaryzowany przeprowadzić badanie sposobu żywienia w trakcie rozmowy z respondentem (osobą badaną), można również w wystandaryzowany sposób wprowadzić dane o spożyciu zebrane wcześniej metodą wywiadu lub zapisu spożycia oraz za pomocą innych metod, po dokonaniu odpowiednich transformacji. Program Dieta 4.0 umożliwia wprowadzenie nieograniczonej liczby wywiadów lub zapisów spożycia dla jednej osoby, nie limituje również liczebności badanych grup. 16. Program winien zawierać: 16.1. przeznaczenie i możliwości 16.2. początek pracy, użytkownicy i hasła dostępu 16.3. Tworzenie baz danych 16.4. Organizacja pracy z wieloma badaniami 16.5. Wprowadzanie wywiadów 16.6. Sposób wprowadzania danych o spożyciu i receptury potraw 16.7. Postępowanie w przypadku braku produktów lub potraw w bazie danych 16.8. Obliczanie ilości spożytych składników odżywczych w ciągu doby dla jednej osoby 16.9. Operacje na wynikach wywiadów zgromadzonych w bazach 16.10 Filtrowanie i tworzenie podzbioru 16.11.Analiza w grupach produktów 16.12.Eksport do EXCELA i dBase IV 16.13.Statystyka i wydruki 16.14.Analiza norm EAR, RDA, AI, UL 16.15.Analiza realizacji norm żywieniowych EAR, RDA, AI, UL w grupie 16.16.Bazy systemowe programu Dieta 4.0 16.17.rozwiązania przyjęte w bazach systemowych 16.18.Baza fotografii produktów i potraw 16.19.Baza wartości odżywczej produktów, potraw i farmakologicznych preparatów witaminowo-mineralnych 16.20. Baza norm żywienia Zadanie nr 2 -ACD/Structure Design Suite - producent: Advenced Chemistry Development, INC., (ACD/Labs) lub równoważny 1.Program winien umożliwiać projektowanie struktury chemicznej związku pod kątem uzyskania pożądanych właściwości fizykochemicznych. 2.ACD/Structure Design Suite (SDS) będzie służyć jako narzędzie pozwalające na optymalizację właściwości fizykochemicznych substancji. 3.Program winien doradzać jakie podstawniki powinny być umieszczone w cząsteczce aby uzyskać pożądane właściwości fizykochemiczne. 4.SDS winien umożliwiać - badać wpływ poszczególnych podstawników i dopasować odpowiednio do potrzeb pKa, logP, logD rozpuszczalność w wodzie. Wszystkie sugerowane produkty są zapisywane i numerowane co ułatwia analizę uzyskanych wyników, na tak stworzonej bazie danych można przeprowadzać dodatkowe obliczenia. Funkcje +Zaawansowany kreator prowadzący użytkownika przez program SDS +Możliwość testowania wielu struktur z wykorzystaniem bazy podstawników (30 000 grup funkcyjnych) +Import do 1000 struktur +Przeprowadzenie obliczeń właściwości fizykochemicznych (LogP, LogD, pKa, rozpuszczalność) zaimportowanych struktur (z wykorzystaniem algorytmów ACD/Labs) +Przeprowadzenie obliczeń właściwości cząsteczkowych (m.in. gęstość, objętość molowa, naruszenie reguł Lipińskiego) zaimportowanych struktur +Graficzna analiza wyników +Możliwość trenowania algorytmów wykorzystywanych do przewidywania właściwości fizykochemicznych w celu poprawy trafności przewidywań +Integracja z programem ACD/ChemSketch +Automatyczne nazywanie uzyskanych za pośrednictwem programu cząsteczek Lista obsługiwanych formatów Dostawca Format pliku ACD/Labs *.sk2 Adobe Acrobat (tylko zapis) *.pdf Symyx *.mol, *.sdf, *.rxn ChemDraw *.chm, *.cdx ISIS Sketch *.skc InChI SMILES Chemical Markup Language (tylko zapis) *.cml GIF image format *.gif PNG image format *.png JPG image format (tylko odczyt) *.jpg Windows Bitmap *.bmp, *.dib Paintbrush (tylko zapis) *.pcx TIFF Bitmap (tylko zapis) *.tif HTML (tylko zapis) *.html Windows Metafile *.wmf ChemSketch 1.0 (tylko odczyt) *.mst, *.rtp Zadanie nr 3 - ImaGene Nexus do analizy statystycznej - producent BioDiscovery lub równoważny Kryteria równoważności dla programu ImaGene Nexus Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy ekspresyjnych miRNA 1.Oprogramowanie obsługujące miRCURY LNA microRNA Array. 2.Możliwość integracji z zewnętrznymi, publicznymi bazami danych dla miRNA w bazie miRBase and TargetScan. 3.Oprogramowanie pozwalające na analizę obrazów tif. pochodzących ze zeskanowanych macierzy miRCURY LNA MicroRNA. 4.Oprogramowanie pozwalające na ekstrakcję intensywności sygnału z mikromacierzy i równoczesną ich jakościową analizę statystyczną. 5.Oprogramowanie obliczające QC próbki. 6.Normalizacja i identyfikacja ulegających odmiennej ekspresji miRNA. 7.Oprogramowanie umożliwiające integrację danych fenotypowych z danymi klinicznymi. 8.Automatyczna identyfikacja regionów różniących się znacząco statystycznie pomiędzy populacjami próbek. 9.Analiza przeżywalności z wykreśleniem krzywych Kaplana- Meiera. 10.Analiza skupień - grupowanie próbek w oparciu o zmiany w ekspresji miRNA. 11.Identyfikacja zmian w genomie o cechach predykcyjnych, porównanie prób ze względu na cechy kliniczne analizowanej jednostki chorobowej, zmiany w ekspresji miRNA i czynniki wprowadzone bezpośrednio przez użytkownika, identyfikacja genów miRNA korelujących z DFS i czasem przeżycia. 12.Udzielona będzie licencja na 1 miesiąc użytkowania programu. Zadanie nr 4 - Nexus 5 Copy Number 1 - producent BioDiscovery - lub równoważny - 1 szt. Kryteria równoważności dla programu Nexus CopyNumber Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy aCGH Parametry wymagane 1.Oprogramowanie obsługujące wszystkie obecnie znane typy mikromacierzy aCGH: Affymetrix, Agilent, Roche Nimble Gene, Gene Pix, ImaGene, macierze samodzielnie nadrukowane i inne. 2.Oprogramowanie pozwalające na analizę wyników dla wszystkich organizmów. 3.Oprogramowanie pozwalające na stosowanie techniki dye-swap 4.Możliwość analizy tysięcy macierzy w pojedynczym projekcie. 5.Oprogramowanie obliczające QC próbki. 6.Możliwość integracji z zewnętrznymi, publicznymi bazami danych (NCBI, UCSC, Google, Ensemble, DECIPHER) i z bazami samodzielnie stworzonymi. 7.Oprogramowanie umożliwiające integrację danych fenotypowych z danymi klinicznymi. 8.Automatyczna identyfikacja regionów różniących się znacząco statystycznie pomiędzy populacjami próbek. 9.Analiza przeżywalności z wykreśleniem krzywych Kaplana- Meiera. 10.Grupowanie próbek w oparciu o zmiany w genomie. 11.Możliwość analizy i wizualizacji SNP (single nucleotide polymorphism), CNV (copy number variation), LOH (loss of heterozygosity) uzyskanych z macierzy SNP i aCGH. 12.Integracja wyników uzyskanych z wykorzystaniem technik mikromacierzowych aCGH, ekspresji genów, ekspresji miRNA oraz metylacji genomu. 13.Dostęp do publicznych baz danych udostępnianych przez grupy badawcze z różnych laboratoriów na całym świecie, zajmujących się podobną tematyką. Możliwość porównania własnych wyników z wynikami uzyskanymi przez inne laboratoria. 14.Roczna licencja, w trakcie trwania licencji wsparcie i pomoc merytoryczna producenta programu. 15.Możliwość wysyłania otrzymanych wyników do producenta oprogramowania i analiza wyników online. Pomoc w interpretacji wyników (ocena jakościowa przeprowadzonego eksperymentu, określenie statusu (obecność/brak zmian genomowych) w jednym, wielu genach/regionach, miRNA we wszystkich analizowanych próbach, identyfikacja powszechnie występujących aberracji w genomie badanych prób, identyfikacja prób niosących podobne zmiany, identyfikacja genów i dróg przekazywania sygnału podlegających statystycznie częściej zmianom w grupie badanej, identyfikacja jednostek chorobowych, w których dochodzi do identycznych zmian jak w grupie analizowanej, identyfikacja zmian w genomie o cechach predykcyjnych, porównanie prób ze względu na cechy kliniczne, zmiany w obrębie regionów i czynniki wprowadzone bezpośrednio przez użytkownika, identyfikacja aberracji w obrębie regionów korelujących z DFS i czasem przeżycia). 16. Konieczność integracji z utworzonym formatem bazy danych (dane pacjentów, cechy kliniczne choroby) oraz z wynikami uzyskanymi we wcześniejszych badaniach z zastosowaniem macierzy aCGH (np. zidentyfikowane już aberracje o znaczeniu predykcyjnym, zmiany klasyfikujące próby na podgrupy itp). 17.Udzielona będzie licencja na 1 rok użytkowania programu
Lublin: DOSTAWA KOMPUTEROWYCH PAKIETÓW OPROGRAMOWANIA SPECJALISTYCZNEGO cz. IV ; Nr sprawy: UM-ZP-262-77/11 w 4 zadaniach
Numer ogłoszenia: 189748 - 2011; data zamieszczenia: 07.07.2011
OGŁOSZENIE O ZAMÓWIENIU - dostawy
Zamieszczanie ogłoszenia:
obowiązkowe.
Ogłoszenie dotyczy:
zamówienia publicznego.
SEKCJA I: ZAMAWIAJĄCY
I. 1) NAZWA I ADRES:
Uniwersytet Medyczny w Lublinie , Al. Racławickie 1, 20-059 Lublin, woj. lubelskie, tel. 81 528 88 88, faks 81 528 89 18.
Adres strony internetowej zamawiającego:
www.am.lublin.pl
I. 2) RODZAJ ZAMAWIAJĄCEGO:
Uczelnia publiczna.
SEKCJA II: PRZEDMIOT ZAMÓWIENIA
II.1) OKREŚLENIE PRZEDMIOTU ZAMÓWIENIA
II.1.1) Nazwa nadana zamówieniu przez zamawiającego:
DOSTAWA KOMPUTEROWYCH PAKIETÓW OPROGRAMOWANIA SPECJALISTYCZNEGO cz. IV ; Nr sprawy: UM-ZP-262-77/11 w 4 zadaniach.
II.1.2) Rodzaj zamówienia:
dostawy.
II.1.3) Określenie przedmiotu oraz wielkości lub zakresu zamówienia:
1.Przedmiotem zamówienia jest dostawa komputerowych pakietów oprogramowania specjalistycznego w czterech następujących zadaniach: Zadanie nr 1 -Dieta 4.0. wersja rozszerzona - producent: Zakład Żywności i Żywienia w Warszawie Zakład Epidemiologii i Żywienia - wieczysta licencja lub równoważny - 1 szt. Zadanie nr 2 - ACD Structure Design Siute - producent: Advenced Chemistry Development, INC., (ACD/Labs) - wieczysta licencja lub równoważny - 1 szt. Zadanie nr 3 - ImaGene Nexus do analizy statystycznej - producent BioDiscovery- licencja miesięczna lub równoważny - 1 szt. Zadanie nr 4 - Nexus 5 Copy Number 1 - producent BioDiscovery - roczna pełna licencja lub równoważny - 1 szt. 2.Oferowany przez Wykonawcę przedmiot zamówienia ( oprogramowania ) musi spełniać parametry techniczne i użytkowe, możliwości zastosowania i funkcjonalności - zawarte w niniejszej SIWZ. 3.Zamawiający wymaga zaoferowania przedmiotu zamówienia nowego, kompletnego i gotowego do użycia ( tj. bez żadnych zbędnych i dodatkowych inwestycji). 4.Ilekroć w opisie przedmiotu zamówienia zawartym w SIWZ wskazane zostały normy , znaki towarowe, patenty lub pochodzenie, zamawiający dopuszcza rozwiązania równoważne. 5.Za ofertę równoważną Zamawiający uzna tę która spełnia wszystkie wymagania Zamawiającego określone w opisie przedmiotu zamówienia zawartym w rozdziale IV SIWZ 6.Ewentualne wskazanie przez Zamawiającego nazwy produktu lub nazwy producenta ma na celu, określenie klasy produktu będącego przedmiotem zamówienia i służy ustaleniu standardu; nie wskazują natomiast na konkretny wyrób lub konkretnego producenta. 7.Wykonawca który powoła się na rozwiązania równoważne jest zobowiązany wskazać że oferowany przez niego przedmiot zamówienia spełnia wymagania określone przez Zamawiającego. Zadanie nr 1 - DIETA 4.0 wersja rozszerzona - producent: Zakład Żywności i Żywienia w Warszawie Zakład Epidemiologii i Żywienia lub równoważny 1.Program komputerowy z 2009, z 2010 r lub 2011 r. - Dieta 4.0 opracowany w Zakładzie Epidemiologii i Norm Żywienia, Instytutu Żywności i Żywienia lub równoważny. 2.Wymagania dotyczące programu: Program komputerowy DIETA 4.0 ma służyć do wyliczania wartości odżywczej i składu spożywanej diety oraz do planowania diety. 3.Baza programu winna zawierać aktualne informacje pochodzące m. in. z : 3.1. Tabel składu i wartości odżywczych żywności: Kunachowicz H., Nadolna I., Przygoda B., Iwanow K, PZWL, 2005. 3.2. Dieta bezglutenowa - co wybrać? Wartość odżywcza produktów i potraw. Kunachowicz H. PZWL, 2001 3.3. Znowelizowanych Norm Żywienia Człowieka: Jarosz M., Bułhak-Jachymczyk B., PZWL, 2008, w których uwzględniono nowe poziomy zapotrzebowania uwzględniające poziom aktywności fizycznej oraz EAR, RDA, AI, UL . 4. Baza programu winna zawierać również: +ponad 1300 suplementów diet aktualnie zarejestrowanych preparatów +ponad 1700 potraw i produktów, w tym: - produkty wzbogacane - produkty bezglutenowe - wody mineralne - potrawy typu fast-food - odżywki dla dzieci - napoje energetyzujące i izotoniczne oraz +nowe receptury potraw 5.Program winien posiadać możliwość wielu obliczeń statystycznych z uwzględnieniem nowych sposobów wyliczenia realizacji norm (metodą prawdopodobieństwa i punktów odcięcia) - wersja rozszerzona. 6.Program winien posiadać możliwość eksportowania danych indywidualnego spożycia. 7.Program winien umożliwiać pracę również w najnowszych systemach operacyjnych, VISTA i WINDOWS 7. 8.Program co najmniej jednostanowiskowy (jeden program na jeden komputer). 9.Minimalne warunki konieczne dla oprogramowania aby mogło być wykorzystywane do prac dydaktyki oraz naukowych to: 9.1.Duża baza suplementów diety z możliwością aplikacyjną wykorzystania do oceny żywienia. 9.2. Aktualna krajowa baza danych produktów, potraw i produktów specjalnego przeznaczenia. 9.3. Możliwość eksportu danych np. do Excela, dBase itp. 9.4.Obliczenia z uwzględnieniem najnowszych norm (EAR, AI, RDA, UL) 9.5. Analiza danych metodą prawdopodobieństwa i punktów odcięcia. 10.Ponadto program winien umożliwiać obliczenie ilości składników odżywczych pochodzących : 10.1. tylko z produktów i potraw nie wzbogacanych, 10.2. tylko z produktów i potraw wzbogacanych 10.3. ze wszystkich produktów i potraw 10.4. z farmakologicznych preparatów witaminowych, mineralnych i mieszanych - witaminowo -mineralnych, 10.5. z produktów i potraw wzbogacanych oraz farmakologicznych preparatów witaminowych , mineralnych i mieszanych - witaminowo-mineralnych 10.6. pochodzących ze wszystkich źródeł łącznie. 11.Program komputerowy jest unikatowym programem komputerowym, winien służyć do oceny żywienia indywidualnego i grupowego, a także do planowania i bieżących analiz spożycia badanych grup ludności na tle norm żywienia. 12.Program winien umożliwiać obliczenia wartości energetycznej i odżywczej diet, a także wielkości spożycia produktów i potraw, porównanie obliczonej wartości odżywczej do norm z uwzględnieniem nowego podejścia do oceny dostateczności spożycia składników metodami prawdopodobieństwa i punktu odcięcia (6.1-6.5). 13.Program winien również do obliczania wartości odżywczej jadłospisów w żywieniu zbiorowym, projektowania i oceny stopnia realizacji modelowych diet, szacowania wartości odżywczej potraw bez uwzględniania, lub z uwzględnianiem wielkości strat technologicznych. 14.Dodatkowo program winien zapewnić: 14.1. standaryzację sposobu wprowadzanych danych o spożywanych produktach i potrawach (kolejność i dokładność określania rodzaju i składu potraw); 14.2. standaryzację receptur potraw; 14.3. standaryzację określania wielkości porcji (wybór wielkości porcji z zaproponowanych w programie); 14.4. Standaryzację sposobu obliczania (jednakowe wielkości redukcji) i uzyskiwanych wyników (liczba składników, porównanie z normami). 15. Programu winien w sposób wystandaryzowany przeprowadzić badanie sposobu żywienia w trakcie rozmowy z respondentem (osobą badaną), można również w wystandaryzowany sposób wprowadzić dane o spożyciu zebrane wcześniej metodą wywiadu lub zapisu spożycia oraz za pomocą innych metod, po dokonaniu odpowiednich transformacji. Program Dieta 4.0 umożliwia wprowadzenie nieograniczonej liczby wywiadów lub zapisów spożycia dla jednej osoby, nie limituje również liczebności badanych grup. 16. Program winien zawierać: 16.1. przeznaczenie i możliwości 16.2. początek pracy, użytkownicy i hasła dostępu 16.3. Tworzenie baz danych 16.4. Organizacja pracy z wieloma badaniami 16.5. Wprowadzanie wywiadów 16.6. Sposób wprowadzania danych o spożyciu i receptury potraw 16.7. Postępowanie w przypadku braku produktów lub potraw w bazie danych 16.8. Obliczanie ilości spożytych składników odżywczych w ciągu doby dla jednej osoby 16.9. Operacje na wynikach wywiadów zgromadzonych w bazach 16.10 Filtrowanie i tworzenie podzbioru 16.11.Analiza w grupach produktów 16.12.Eksport do EXCELA i dBase IV 16.13.Statystyka i wydruki 16.14.Analiza norm EAR, RDA, AI, UL 16.15.Analiza realizacji norm żywieniowych EAR, RDA, AI, UL w grupie 16.16.Bazy systemowe programu Dieta 4.0 16.17.rozwiązania przyjęte w bazach systemowych 16.18.Baza fotografii produktów i potraw 16.19.Baza wartości odżywczej produktów, potraw i farmakologicznych preparatów witaminowo-mineralnych 16.20. Baza norm żywienia Zadanie nr 2 -ACD/Structure Design Suite - producent: Advenced Chemistry Development, INC., (ACD/Labs) lub równoważny 1.Program winien umożliwiać projektowanie struktury chemicznej związku pod kątem uzyskania pożądanych właściwości fizykochemicznych. 2.ACD/Structure Design Suite (SDS) będzie służyć jako narzędzie pozwalające na optymalizację właściwości fizykochemicznych substancji. 3.Program winien doradzać jakie podstawniki powinny być umieszczone w cząsteczce aby uzyskać pożądane właściwości fizykochemiczne. 4.SDS winien umożliwiać - badać wpływ poszczególnych podstawników i dopasować odpowiednio do potrzeb pKa, logP, logD rozpuszczalność w wodzie. Wszystkie sugerowane produkty są zapisywane i numerowane co ułatwia analizę uzyskanych wyników, na tak stworzonej bazie danych można przeprowadzać dodatkowe obliczenia. Funkcje +Zaawansowany kreator prowadzący użytkownika przez program SDS +Możliwość testowania wielu struktur z wykorzystaniem bazy podstawników (30 000 grup funkcyjnych) +Import do 1000 struktur +Przeprowadzenie obliczeń właściwości fizykochemicznych (LogP, LogD, pKa, rozpuszczalność) zaimportowanych struktur (z wykorzystaniem algorytmów ACD/Labs) +Przeprowadzenie obliczeń właściwości cząsteczkowych (m.in. gęstość, objętość molowa, naruszenie reguł Lipińskiego) zaimportowanych struktur +Graficzna analiza wyników +Możliwość trenowania algorytmów wykorzystywanych do przewidywania właściwości fizykochemicznych w celu poprawy trafności przewidywań +Integracja z programem ACD/ChemSketch +Automatyczne nazywanie uzyskanych za pośrednictwem programu cząsteczek Lista obsługiwanych formatów Dostawca Format pliku ACD/Labs *.sk2 Adobe Acrobat (tylko zapis) *.pdf Symyx *.mol, *.sdf, *.rxn ChemDraw *.chm, *.cdx ISIS Sketch *.skc InChI SMILES Chemical Markup Language (tylko zapis) *.cml GIF image format *.gif PNG image format *.png JPG image format (tylko odczyt) *.jpg Windows Bitmap *.bmp, *.dib Paintbrush (tylko zapis) *.pcx TIFF Bitmap (tylko zapis) *.tif HTML (tylko zapis) *.html Windows Metafile *.wmf ChemSketch 1.0 (tylko odczyt) *.mst, *.rtp Zadanie nr 3 - ImaGene Nexus do analizy statystycznej - producent BioDiscovery lub równoważny Kryteria równoważności dla programu ImaGene Nexus Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy ekspresyjnych miRNA 1.Oprogramowanie obsługujące miRCURY LNA microRNA Array. 2.Możliwość integracji z zewnętrznymi, publicznymi bazami danych dla miRNA w bazie miRBase and TargetScan. 3.Oprogramowanie pozwalające na analizę obrazów tif. pochodzących ze zeskanowanych macierzy miRCURY LNA MicroRNA. 4.Oprogramowanie pozwalające na ekstrakcję intensywności sygnału z mikromacierzy i równoczesną ich jakościową analizę statystyczną. 5.Oprogramowanie obliczające QC próbki. 6.Normalizacja i identyfikacja ulegających odmiennej ekspresji miRNA. 7.Oprogramowanie umożliwiające integrację danych fenotypowych z danymi klinicznymi. 8.Automatyczna identyfikacja regionów różniących się znacząco statystycznie pomiędzy populacjami próbek. 9.Analiza przeżywalności z wykreśleniem krzywych Kaplana- Meiera. 10.Analiza skupień - grupowanie próbek w oparciu o zmiany w ekspresji miRNA. 11.Identyfikacja zmian w genomie o cechach predykcyjnych, porównanie prób ze względu na cechy kliniczne analizowanej jednostki chorobowej, zmiany w ekspresji miRNA i czynniki wprowadzone bezpośrednio przez użytkownika, identyfikacja genów miRNA korelujących z DFS i czasem przeżycia. 12.Udzielona będzie licencja na 1 miesiąc użytkowania programu. Zadanie nr 4 - Nexus 5 Copy Number 1 - producent BioDiscovery - lub równoważny - 1 szt. Kryteria równoważności dla programu Nexus CopyNumber Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy aCGH Parametry wymagane 1.Oprogramowanie obsługujące wszystkie obecnie znane typy mikromacierzy aCGH: Affymetrix, Agilent, Roche Nimble Gene, Gene Pix, ImaGene, macierze samodzielnie nadrukowane i inne. 2.Oprogramowanie pozwalające na analizę wyników dla wszystkich organizmów. 3.Oprogramowanie pozwalające na stosowanie techniki dye-swap 4.Możliwość analizy tysięcy macierzy w pojedynczym projekcie. 5.Oprogramowanie obliczające QC próbki. 6.Możliwość integracji z zewnętrznymi, publicznymi bazami danych (NCBI, UCSC, Google, Ensemble, DECIPHER) i z bazami samodzielnie stworzonymi. 7.Oprogramowanie umożliwiające integrację danych fenotypowych z danymi klinicznymi. 8.Automatyczna identyfikacja regionów różniących się znacząco statystycznie pomiędzy populacjami próbek. 9.Analiza przeżywalności z wykreśleniem krzywych Kaplana- Meiera. 10.Grupowanie próbek w oparciu o zmiany w genomie. 11.Możliwość analizy i wizualizacji SNP (single nucleotide polymorphism), CNV (copy number variation), LOH (loss of heterozygosity) uzyskanych z macierzy SNP i aCGH. 12.Integracja wyników uzyskanych z wykorzystaniem technik mikromacierzowych aCGH, ekspresji genów, ekspresji miRNA oraz metylacji genomu. 13.Dostęp do publicznych baz danych udostępnianych przez grupy badawcze z różnych laboratoriów na całym świecie, zajmujących się podobną tematyką. Możliwość porównania własnych wyników z wynikami uzyskanymi przez inne laboratoria. 14.Roczna licencja, w trakcie trwania licencji wsparcie i pomoc merytoryczna producenta programu. 15.Możliwość wysyłania otrzymanych wyników do producenta oprogramowania i analiza wyników online. Pomoc w interpretacji wyników (ocena jakościowa przeprowadzonego eksperymentu, określenie statusu (obecność/brak zmian genomowych) w jednym, wielu genach/regionach, miRNA we wszystkich analizowanych próbach, identyfikacja powszechnie występujących aberracji w genomie badanych prób, identyfikacja prób niosących podobne zmiany, identyfikacja genów i dróg przekazywania sygnału podlegających statystycznie częściej zmianom w grupie badanej, identyfikacja jednostek chorobowych, w których dochodzi do identycznych zmian jak w grupie analizowanej, identyfikacja zmian w genomie o cechach predykcyjnych, porównanie prób ze względu na cechy kliniczne, zmiany w obrębie regionów i czynniki wprowadzone bezpośrednio przez użytkownika, identyfikacja aberracji w obrębie regionów korelujących z DFS i czasem przeżycia). 16. Konieczność integracji z utworzonym formatem bazy danych (dane pacjentów, cechy kliniczne choroby) oraz z wynikami uzyskanymi we wcześniejszych badaniach z zastosowaniem macierzy aCGH (np. zidentyfikowane już aberracje o znaczeniu predykcyjnym, zmiany klasyfikujące próby na podgrupy itp). 17.Udzielona będzie licencja na 1 rok użytkowania programu.
II.1.4) Czy przewiduje się udzielenie zamówień uzupełniających:
nie.
II.1.5) Wspólny Słownik Zamówień (CPV):
48.46.30.00-1, 48.46.40.00-7, 48.46.20.00-4.
II.1.6) Czy dopuszcza się złożenie oferty częściowej:
tak, liczba części: 4.
II.1.7) Czy dopuszcza się złożenie oferty wariantowej:
nie.
II.2) CZAS TRWANIA ZAMÓWIENIA LUB TERMIN WYKONANIA:
Okres w dniach: 7.
SEKCJA III: INFORMACJE O CHARAKTERZE PRAWNYM, EKONOMICZNYM, FINANSOWYM I TECHNICZNYM
III.1) WADIUM
Informacja na temat wadium:
Zamawiający nie wymaga wniesienia wadium.
III.2) ZALICZKI
Czy przewiduje się udzielenie zaliczek na poczet wykonania zamówienia:
nie
III.3) WARUNKI UDZIAŁU W POSTĘPOWANIU ORAZ OPIS SPOSOBU DOKONYWANIA OCENY SPEŁNIANIA TYCH WARUNKÓW
III. 3.1) Uprawnienia do wykonywania określonej działalności lub czynności, jeżeli przepisy prawa nakładają obowiązek ich posiadania
Opis sposobu dokonywania oceny spełniania tego warunkuOświadczenie Wykonawcy
III.3.2) Wiedza i doświadczenie
Opis sposobu dokonywania oceny spełniania tego warunkuOświadczenie Wykonawcy
III.3.3) Potencjał techniczny
Opis sposobu dokonywania oceny spełniania tego warunkuOświadczenie Wykonawcy
III.3.4) Osoby zdolne do wykonania zamówienia
Opis sposobu dokonywania oceny spełniania tego warunkuOświadczenie Wykonawcy
III.3.5) Sytuacja ekonomiczna i finansowa
Opis sposobu dokonywania oceny spełniania tego warunkuOświadczenie Wykonawcy
III.4) INFORMACJA O OŚWIADCZENIACH LUB DOKUMENTACH, JAKIE MAJĄ DOSTARCZYĆ WYKONAWCY W CELU POTWIERDZENIA SPEŁNIANIA WARUNKÓW UDZIAŁU W POSTĘPOWANIU ORAZ NIEPODLEGANIA WYKLUCZENIU NA PODSTAWIE ART. 24 UST. 1 USTAWY
-
III.4.1) W zakresie wykazania spełniania przez wykonawcę warunków, o których mowa w art. 22 ust. 1 ustawy, oprócz oświadczenia o spełnieniu warunków udziału w postępowaniu, należy przedłożyć:
III.4.2) W zakresie potwierdzenia niepodlegania wykluczeniu na podstawie art. 24 ust. 1 ustawy, należy przedłożyć:- oświadczenie o braku podstaw do wykluczenia
- aktualny odpis z właściwego rejestru, jeżeli odrębne przepisy wymagają wpisu do rejestru, w celu wykazania braku podstaw do wykluczenia w oparciu o art. 24 ust. 1 pkt 2 ustawy, wystawiony nie wcześniej niż 6 miesięcy przed upływem terminu składania wniosków o dopuszczenie do udziału w postępowaniu o udzielenie zamówienia albo składania ofert, a w stosunku do osób fizycznych oświadczenie w zakresie art. 24 ust. 1 pkt 2 ustawy
- wykonawca powołujący się przy wykazywaniu spełniania warunków udziału w postępowaniu na potencjał innych podmiotów, które będą brały udział w realizacji części zamówienia, przedkłada także dokumenty dotyczące tego podmiotu w zakresie wymaganym dla wykonawcy, określonym w pkt III.4.2.
-
III.4.3) Dokumenty podmiotów zagranicznych
Jeżeli wykonawca ma siedzibę lub miejsce zamieszkania poza terytorium Rzeczypospolitej Polskiej, przedkłada:
III.4.3.1) dokument wystawiony w kraju, w którym ma siedzibę lub miejsce zamieszkania potwierdzający, że:
- nie otwarto jego likwidacji ani nie ogłoszono upadłości - wystawiony nie wcześniej niż 6 miesięcy przed upływem terminu składania wniosków o dopuszczenie do udziału w postępowaniu o udzielenie zamówienia albo składania ofert
III.5) INFORMACJA O DOKUMENTACH POTWIERDZAJĄCYCH, ŻE OFEROWANE DOSTAWY , USŁUGI LUB ROBOTY BUDOWLANE ODPOWIADAJĄ OKREŚLONYM WYMAGANIOM
W zakresie potwierdzenia, że oferowane dostawy, usługi lub roboty budowlane odpowiadają określonym wymaganiom należy przedłożyć:
inne dokumenty
Dokumenty ( np. prospekty, katalogi ) jednoznacznie potwierdzające, że w przypadku zaoferowania produktów równoważnych spełniają one wymagania określone przez Zamawiającego w niniejszej SIWZ. Zaleca się aby dokumenty były opisane z podaniem którego zadania dotyczą.
III.6) INNE DOKUMENTY
Inne dokumenty niewymienione w pkt III.4) albo w pkt III.5)
1. Jeżeli w miejscu zamieszkania osoby lub w kraju, którym Wykonawca ma siedzibę lub miejsce zamieszkania, nie wydaje się dokumentów, o których mowa w pkt. III.4.3.1, zastępuje się je dokumentem zawierającym oświadczenie złożone przed notariuszem, właściwym organem sądowym, administracyjnym albo organem samorządu zawodowego lub gospodarczego odpowiednio miejsca zamieszkania osoby lub kraju, w którym Wykonawca ma siedzibę lub miejsce zamieszkania. Zapis pkt. III.4.3.1. stosuje się odpowiednio. Dokument ten winien być wystawiony nie wcześniej niż 6 miesięcy przed upływem terminu składania ofert. 2. Jeżeli Wykonawca, polega na wiedzy i doświadczeniu, potencjale technicznym, osobach zdolnych do wykonania zamówienia lub zdolnościach finansowych innych podmiotów, to zobowiązany jest również przedłożyć: 2.1. Pisemne zobowiązanie tych podmiotów do oddania mu do dyspozycji niezbędnych zasobów na okres korzystania z nich przy wykonywaniu zamówienia; 2.2. Oświadczenie i dokumenty dotyczące tych podmiotów, wymienione w punkcie III.4.2.
III.7) Czy ogranicza się możliwość ubiegania się o zamówienie publiczne tylko dla wykonawców, u których ponad 50 % pracowników stanowią osoby niepełnosprawne:
nie
SEKCJA IV: PROCEDURA
IV.1) TRYB UDZIELENIA ZAMÓWIENIA
IV.1.1) Tryb udzielenia zamówienia:
przetarg nieograniczony.
IV.2) KRYTERIA OCENY OFERT
IV.2.1) Kryteria oceny ofert:
najniższa cena.
IV.2.2) Czy przeprowadzona będzie aukcja elektroniczna:
nie.
IV.3) ZMIANA UMOWY
Czy przewiduje się istotne zmiany postanowień zawartej umowy w stosunku do treści oferty, na podstawie której dokonano wyboru wykonawcy:
tak
Dopuszczalne zmiany postanowień umowy oraz określenie warunków zmian
1. Zmiana postanowień niniejszej umowy może nastąpić w formie pisemnego aneksu pod rygorem nieważności w następujących przypadkach: 1.1. aktualizacji rozwiązań ze względu na postęp technologiczny ( np. wycofanie z obrotu) zmiana nie może powodować zmiany ceny wynikającej oferty na podstawie której był dokonany wybór wykonawcy 1.2. zmiany obowiązujących przepisów, jeżeli konieczne będzie dostosowanie treści umowy do aktualnego stanu prawnego; 1.3. zmiany stawki podatku VAT. Cena brutto ulegnie zmniejszeniu w przypadku obniżenia stawki podatku od towarów i usług lub powiększeniu w przypadku podwyższenia stawki podatku od towarów i usług. 1.4. konieczności zmiany terminu realizacji przedmiotu umowy z przyczyn niezawinionych przez strony, zmiana nie może spowodować zmiany ceny wynikającej z oferty Wykonawcy; 1.5. konieczności zmiany osób przewidzianych do wzajemnego współdziałania, lub wykonania przedmiotu umowy; 1.6. wystąpienia zdarzeń siły wyższej jako zdarzenia zewnętrznego, niemożliwego do przewidzenia i niemożliwego do zapobieżenia; 1.7. wprowadzenia nowej technologii, lub innych okoliczności pozwalających na obniżenie ceny przedmiotu umowy, Wykonawca powinien ją odpowiednio obniżyć; 1.8. konieczności zastąpienia przedmiotem równoważnym lub o wyższych parametrach jakościowych 2. Inicjatorem zmian może być Zamawiający lub Wykonawca poprzez pisemne wystąpienie w okresie obowiązywania umowy zawierające uzasadnienie proponowanych zmian.
IV.4) INFORMACJE ADMINISTRACYJNE
IV.4.1)
Adres strony internetowej, na której jest dostępna specyfikacja istotnych warunków zamówienia:
www.umlub.pl
Specyfikację istotnych warunków zamówienia można uzyskać pod adresem:
1) Uniwersytet Medyczny w Lublinie; Al. Racławickie 1, kod 20-059 2) Agnieszka Czajka, e mail: agnieszka.czajka@umlub.pl, tel. (81) 528-89-67, fax. (81) 528-89-54;.
IV.4.4) Termin składania wniosków o dopuszczenie do udziału w postępowaniu lub ofert:
15.07.2011 godzina 09:30, miejsce: 20 - 059 Lublin; Al. Racławickie 1, pokój nr 22 (Kancelaria Ogólna).
IV.4.5) Termin związania ofertą:
okres w dniach: 30 (od ostatecznego terminu składania ofert).
IV.4.17) Czy przewiduje się unieważnienie postępowania o udzielenie zamówienia, w przypadku nieprzyznania środków pochodzących z budżetu Unii Europejskiej oraz niepodlegających zwrotowi środków z pomocy udzielonej przez państwa członkowskie Europejskiego Porozumienia o Wolnym Handlu (EFTA), które miały być przeznaczone na sfinansowanie całości lub części zamówienia:
nie
ZAŁĄCZNIK I - INFORMACJE DOTYCZĄCE OFERT CZĘŚCIOWYCH
CZĘŚĆ Nr:
1
NAZWA:
Dieta 4.0. wersja rozszerzona - producent: Zakład Żywności i Żywienia w Warszawie Zakład Epidemiologii i Żywienia - wieczysta licencja lub równoważny - 1 szt.
1) Krótki opis ze wskazaniem wielkości lub zakresu zamówienia:
1. Program komputerowy z 2009, z 2010 r lub 2011 r. - Dieta 4.0 opracowany w Zakładzie Epidemiologii i Norm Żywienia, Instytutu Żywności i Żywienia lub równoważny. 2. Wymagania dotyczące programu: Program komputerowy DIETA 4.0 ma służyć do wyliczania wartości odżywczej i składu spożywanej diety oraz do planowania diety. 3. Baza programu winna zawierać aktualne informacje pochodzące m. in. z : 3.1. Tabel składu i wartości odżywczych żywności: Kunachowicz H., Nadolna I., Przygoda B., Iwanow K, PZWL, 2005. 3.2. Dieta bezglutenowa - co wybrać? Wartość odżywcza produktów i potraw. Kunachowicz H. PZWL, 2001 3.3. Znowelizowanych Norm Żywienia Człowieka: Jarosz M., Bułhak-Jachymczyk B., PZWL, 2008, w których uwzględniono nowe poziomy zapotrzebowania uwzględniające poziom aktywności fizycznej oraz EAR, RDA, AI, UL . 4. Baza programu winna zawierać również: + ponad 1300 suplementów diet aktualnie zarejestrowanych preparatów + ponad 1700 potraw i produktów, w tym: - produkty wzbogacane - produkty bezglutenowe - wody mineralne - potrawy typu fast-food - odżywki dla dzieci - napoje energetyzujące i izotoniczne oraz + nowe receptury potraw 5. Program winien posiadać możliwość wielu obliczeń statystycznych z uwzględnieniem nowych sposobów wyliczenia realizacji norm (metodą prawdopodobieństwa i punktów odcięcia) - wersja rozszerzona. 6. Program winien posiadać możliwość eksportowania danych indywidualnego spożycia. 7. Program winien umożliwiać pracę również w najnowszych systemach operacyjnych, VISTA i WINDOWS 7. 8. Program co najmniej jednostanowiskowy (jeden program na jeden komputer). 9. Minimalne warunki konieczne dla oprogramowania aby mogło być wykorzystywane do prac dydaktyki oraz naukowych to: 9.1. Duża baza suplementów diety z możliwością aplikacyjną wykorzystania do oceny żywienia. 9.2. Aktualna krajowa baza danych produktów, potraw i produktów specjalnego przeznaczenia. 9.3. Możliwość eksportu danych np. do Excela, dBase itp. 9.4. Obliczenia z uwzględnieniem najnowszych norm (EAR, AI, RDA, UL) 9.5. Analiza danych metodą prawdopodobieństwa i punktów odcięcia. 10. Ponadto program winien umożliwiać obliczenie ilości składników odżywczych pochodzących : 10.1. tylko z produktów i potraw nie wzbogacanych, 10.2. tylko z produktów i potraw wzbogacanych 10.3. ze wszystkich produktów i potraw 10.4. z farmakologicznych preparatów witaminowych, mineralnych i mieszanych - witaminowo -mineralnych, 10.5. z produktów i potraw wzbogacanych oraz farmakologicznych preparatów witaminowych , mineralnych i mieszanych - witaminowo-mineralnych 10.6. pochodzących ze wszystkich źródeł łącznie. 11. Program komputerowy jest unikatowym programem komputerowym, winien służyć do oceny żywienia indywidualnego i grupowego, a także do planowania i bieżących analiz spożycia badanych grup ludności na tle norm żywienia. 12. Program winien umożliwiać obliczenia wartości energetycznej i odżywczej diet, a także wielkości spożycia produktów i potraw, porównanie obliczonej wartości odżywczej do norm z uwzględnieniem nowego podejścia do oceny dostateczności spożycia składników metodami prawdopodobieństwa i punktu odcięcia (6.1-6.5). 13. Program winien również do obliczania wartości odżywczej jadłospisów w żywieniu zbiorowym, projektowania i oceny stopnia realizacji modelowych diet, szacowania wartości odżywczej potraw bez uwzględniania, lub z uwzględnianiem wielkości strat technologicznych. 14. Dodatkowo program winien zapewnić: 14.1. standaryzację sposobu wprowadzanych danych o spożywanych produktach i potrawach (kolejność i dokładność określania rodzaju i składu potraw); 14.2. standaryzację receptur potraw; 14.3. standaryzację określania wielkości porcji (wybór wielkości porcji z zaproponowanych w programie); 14.4. Standaryzację sposobu obliczania (jednakowe wielkości redukcji) i uzyskiwanych wyników (liczba składników, porównanie z normami). 15. Programu winien w sposób wystandaryzowany przeprowadzić badanie sposobu żywienia w trakcie rozmowy z respondentem (osobą badaną), można również w wystandaryzowany sposób wprowadzić dane o spożyciu zebrane wcześniej metodą wywiadu lub zapisu spożycia oraz za pomocą innych metod, po dokonaniu odpowiednich transformacji. Program Dieta 4.0 umożliwia wprowadzenie nieograniczonej liczby wywiadów lub zapisów spożycia dla jednej osoby, nie limituje również liczebności badanych grup. 16. Program winien zawierać: 16.1. przeznaczenie i możliwości 16.2. początek pracy, użytkownicy i hasła dostępu 16.3. Tworzenie baz danych 16.4. Organizacja pracy z wieloma badaniami 16.5. Wprowadzanie wywiadów 16.6. Sposób wprowadzania danych o spożyciu i receptury potraw 16.7. Postępowanie w przypadku braku produktów lub potraw w bazie danych 16.8. Obliczanie ilości spożytych składników odżywczych w ciągu doby dla jednej osoby 16.9. Operacje na wynikach wywiadów zgromadzonych w bazach 16.10. Filtrowanie i tworzenie podzbioru 16.11. Analiza w grupach produktów 16.12. Eksport do EXCELA i dBase IV 16.13. Statystyka i wydruki 16.14. Analiza norm EAR, RDA, AI, UL 16.15. Analiza realizacji norm żywieniowych EAR, RDA, AI, UL w grupie 16.16. Bazy systemowe programu Dieta 4.0 16.17. Rozwiązania przyjęte w bazach systemowych 16.18. Baza fotografii produktów i potraw 16.19. Baza wartości odżywczej produktów, potraw i farmakologicznych preparatów witaminowo-mineralnych 16.20. Baza norm żywienia.
2) Wspólny Słownik Zamówień (CPV):
48.46.30.00-1, 48.46.40.00-7, 48.46.20.00-4.
3) Czas trwania lub termin wykonania:
Okres w dniach: 7.
4) Kryteria oceny ofert:
najniższa cena.
CZĘŚĆ Nr:
2
NAZWA:
ACD Structure Design Siute - producent: Advenced Chemistry Development, INC., (ACD/Labs) - wieczysta licencja lub równoważny - 1 szt..
1) Krótki opis ze wskazaniem wielkości lub zakresu zamówienia:
1. Program winien umożliwiać projektowanie struktury chemicznej związku pod kątem uzyskania pożądanych właściwości fizykochemicznych. 2. ACD/Structure Design Suite (SDS) będzie służyć jako narzędzie pozwalające na optymalizację właściwości fizykochemicznych substancji. 3. Program winien doradzać jakie podstawniki powinny być umieszczone w cząsteczce aby uzyskać pożądane właściwości fizykochemiczne. 4. SDS winien umożliwiać - badać wpływ poszczególnych podstawników i dopasować odpowiednio do potrzeb pKa, logP, logD rozpuszczalność w wodzie. Wszystkie sugerowane produkty są zapisywane i numerowane co ułatwia analizę uzyskanych wyników, na tak stworzonej bazie danych można przeprowadzać dodatkowe obliczenia. Funkcje + Zaawansowany kreator prowadzący użytkownika przez program SDS + Możliwość testowania wielu struktur z wykorzystaniem bazy podstawników (30 000 grup funkcyjnych) + Import do 1000 struktur + Przeprowadzenie obliczeń właściwości fizykochemicznych (LogP, LogD, pKa, rozpuszczalność) zaimportowanych struktur (z wykorzystaniem algorytmów ACD/Labs) + Przeprowadzenie obliczeń właściwości cząsteczkowych (m.in. gęstość, objętość molowa, naruszenie reguł Lipińskiego) zaimportowanych struktur + Graficzna analiza wyników + Możliwość trenowania algorytmów wykorzystywanych do przewidywania właściwości fizykochemicznych w celu poprawy trafności przewidywań + Integracja z programem ACD/ChemSketch + Automatyczne nazywanie uzyskanych za pośrednictwem programu cząsteczek Lista obsługiwanych formatów Dostawca Format pliku ACD/Labs *.sk2 Adobe Acrobat (tylko zapis) *.pdf Symyx *.mol, *.sdf, *.rxn ChemDraw *.chm, *.cdx ISIS Sketch *.skc InChI SMILES Chemical Markup Language (tylko zapis) *.cml GIF image format *.gif PNG image format *.png JPG image format (tylko odczyt) *.jpg Windows Bitmap *.bmp, *.dib Paintbrush (tylko zapis) *.pcx TIFF Bitmap (tylko zapis) *.tif HTML (tylko zapis) *.html Windows Metafile *.wmf ChemSketch 1.0 (tylko odczyt) *.mst, *.rtp.
2) Wspólny Słownik Zamówień (CPV):
48.46.30.00-1, 48.46.40.00-7, 48.46.20.00-4.
3) Czas trwania lub termin wykonania:
Okres w dniach: 7.
4) Kryteria oceny ofert:
najniższa cena.
CZĘŚĆ Nr:
3
NAZWA:
ImaGene Nexus do analizy statystycznej - producent BioDiscovery- licencja miesięczna lub równoważny - 1 szt.
1) Krótki opis ze wskazaniem wielkości lub zakresu zamówienia:
Kryteria równoważności dla programu ImaGene Nexus Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy ekspresyjnych miRNA 1. Oprogramowanie obsługujące miRCURY LNA microRNA Array. 2. Możliwość integracji z zewnętrznymi, publicznymi bazami danych dla miRNA w bazie miRBase and TargetScan. 3. Oprogramowanie pozwalające na analizę obrazów tif. pochodzących ze zeskanowanych macierzy miRCURY LNA MicroRNA. 4. Oprogramowanie pozwalające na ekstrakcję intensywności sygnału z mikromacierzy i równoczesną ich jakościową analizę statystyczną. 5. Oprogramowanie obliczające QC próbki. 6. Normalizacja i identyfikacja ulegających odmiennej ekspresji miRNA. 7. Oprogramowanie umożliwiające integrację danych fenotypowych z danymi klinicznymi. 8. Automatyczna identyfikacja regionów różniących się znacząco statystycznie pomiędzy populacjami próbek. 9. Analiza przeżywalności z wykreśleniem krzywych Kaplana- Meiera. 10. Analiza skupień - grupowanie próbek w oparciu o zmiany w ekspresji miRNA. 11. Identyfikacja zmian w genomie o cechach predykcyjnych, porównanie prób ze względu na cechy kliniczne analizowanej jednostki chorobowej, zmiany w ekspresji miRNA i czynniki wprowadzone bezpośrednio przez użytkownika, identyfikacja genów miRNA korelujących z DFS i czasem przeżycia. 12. Udzielona będzie licencja na 1 miesiąc użytkowania programu..
2) Wspólny Słownik Zamówień (CPV):
48.46.30.00-1, 48.46.40.00-7, 48.46.20.00-4.
3) Czas trwania lub termin wykonania:
Okres w dniach: 7.
4) Kryteria oceny ofert:
najniższa cena.
CZĘŚĆ Nr:
4
NAZWA:
Nexus 5 Copy Number 1 - producent BioDiscovery - roczna pełna licencja lub równoważny - 1 szt.
1) Krótki opis ze wskazaniem wielkości lub zakresu zamówienia:
Kryteria równoważności dla programu Nexus CopyNumber Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy aCGH Parametry wymagane 1. Oprogramowanie obsługujące wszystkie obecnie znane typy mikromacierzy aCGH: Affymetrix, Agilent, Roche Nimble Gene, Gene Pix, ImaGene, macierze samodzielnie nadrukowane i inne. 2. Oprogramowanie pozwalające na analizę wyników dla wszystkich organizmów. 3. Oprogramowanie pozwalające na stosowanie techniki dye-swap 4. Możliwość analizy tysięcy macierzy w pojedynczym projekcie. 5. Oprogramowanie obliczające QC próbki. 6. Możliwość integracji z zewnętrznymi, publicznymi bazami danych (NCBI, UCSC, Google, Ensemble, DECIPHER) i z bazami samodzielnie stworzonymi. 7. Oprogramowanie umożliwiające integrację danych fenotypowych z danymi klinicznymi. 8. Automatyczna identyfikacja regionów różniących się znacząco statystycznie pomiędzy populacjami próbek. 9. Analiza przeżywalności z wykreśleniem krzywych Kaplana- Meiera. 10. Grupowanie próbek w oparciu o zmiany w genomie. 11. Możliwość analizy i wizualizacji SNP (single nucleotide polymorphism), CNV (copy number variation), LOH (loss of heterozygosity) uzyskanych z macierzy SNP i aCGH. 12. Integracja wyników uzyskanych z wykorzystaniem technik mikromacierzowych aCGH, ekspresji genów, ekspresji miRNA oraz metylacji genomu. 13. Dostęp do publicznych baz danych udostępnianych przez grupy badawcze z różnych laboratoriów na całym świecie, zajmujących się podobną tematyką. Możliwość porównania własnych wyników z wynikami uzyskanymi przez inne laboratoria. 14. Roczna licencja, w trakcie trwania licencji wsparcie i pomoc merytoryczna producenta programu. 15. Możliwość wysyłania otrzymanych wyników do producenta oprogramowania i analiza wyników online. Pomoc w interpretacji wyników (ocena jakościowa przeprowadzonego eksperymentu, określenie statusu (obecność/brak zmian genomowych) w jednym, wielu genach/regionach, miRNA we wszystkich analizowanych próbach, identyfikacja powszechnie występujących aberracji w genomie badanych prób, identyfikacja prób niosących podobne zmiany, identyfikacja genów i dróg przekazywania sygnału podlegających statystycznie częściej zmianom w grupie badanej, identyfikacja jednostek chorobowych, w których dochodzi do identycznych zmian jak w grupie analizowanej, identyfikacja zmian w genomie o cechach predykcyjnych, porównanie prób ze względu na cechy kliniczne, zmiany w obrębie regionów i czynniki wprowadzone bezpośrednio przez użytkownika, identyfikacja aberracji w obrębie regionów korelujących z DFS i czasem przeżycia). 16. Konieczność integracji z utworzonym formatem bazy danych (dane pacjentów, cechy kliniczne choroby) oraz z wynikami uzyskanymi we wcześniejszych badaniach z zastosowaniem macierzy aCGH (np. zidentyfikowane już aberracje o znaczeniu predykcyjnym, zmiany klasyfikujące próby na podgrupy itp). 17. Udzielona będzie licencja na 1 rok użytkowania programu.
2) Wspólny Słownik Zamówień (CPV):
48.46.30.00-1, 48.46.40.00-7, 48.46.20.00-4.
3) Czas trwania lub termin wykonania:
Okres w dniach: 7.
4) Kryteria oceny ofert:
najniższa cena.
Numer ogłoszenia: 196284 - 2011; data zamieszczenia: 12.07.2011
OGŁOSZENIE O ZMIANIE OGŁOSZENIA
Ogłoszenie dotyczy:
Ogłoszenia o zamówieniu.
Informacje o zmienianym ogłoszeniu:
189748 - 2011 data 07.07.2011 r.
SEKCJA I: ZAMAWIAJĄCY
Uniwersytet Medyczny w Lublinie, Al. Racławickie 1, 20-059 Lublin, woj. lubelskie, tel. 81 528 88 88, fax. 81 528 89 18.
SEKCJA II: ZMIANY W OGŁOSZENIU
II.1) Tekst, który należy zmienić:
Miejsce, w którym znajduje się zmieniany tekst:
Zał.I.
W ogłoszeniu jest:
Część Nr: 4 Nazwa: Nexus 5 Copy Number 1 - producent BioDiscovery - roczna pełna licencja lub równowazny szt. 1 3) Czas trwania lub termin wykonania: Okres w dniach: 7.
W ogłoszeniu powinno być:
Część Nr: 4 Nazwa: Nexus 5 Copy Number 1 - producent BioDiscovery - roczna pełna licencja lub równowazny szt. 1 3) Czas trwania lub termin wykonania: Okres w dniach: 21.
Lublin: Dostawa komputerowych pakietów oprogramowania specjalistycznego cz. IV nr sprawy UM-ZP-262-77/11 w 4 zadaniach
Numer ogłoszenia: 281770 - 2011; data zamieszczenia: 09.09.2011
OGŁOSZENIE O UDZIELENIU ZAMÓWIENIA - Dostawy
Zamieszczanie ogłoszenia:
obowiązkowe.
Ogłoszenie dotyczy:
zamówienia publicznego.
Czy zamówienie było przedmiotem ogłoszenia w Biuletynie Zamówień Publicznych:
tak, numer ogłoszenia w BZP: 189748 - 2011r.
Czy w Biuletynie Zamówień Publicznych zostało zamieszczone ogłoszenie o zmianie ogłoszenia:
tak.
SEKCJA I: ZAMAWIAJĄCY
I. 1) NAZWA I ADRES:
Uniwersytet Medyczny w Lublinie, Al. Racławickie 1, 20-059 Lublin, woj. lubelskie, tel. 81 528 88 88, faks 81 528 89 18.
I. 2) RODZAJ ZAMAWIAJĄCEGO:
Uczelnia publiczna.
SEKCJA II: PRZEDMIOT ZAMÓWIENIA
II.1) Nazwa nadana zamówieniu przez zamawiającego:
Dostawa komputerowych pakietów oprogramowania specjalistycznego cz. IV nr sprawy UM-ZP-262-77/11 w 4 zadaniach.
II.2) Rodzaj zamówienia:
Dostawy.
II.3) Określenie przedmiotu zamówienia:
1. Przedmiotem zamówienia jest dostawa komputerowych pakietów oprogramowania specjalistycznego w czterech następujących zadaniach: Zadanie nr 1 -Dieta 4.0. wersja rozszerzona - producent: Zakład Żywności i Żywienia w Warszawie Zakład Epidemiologii i Żywienia - wieczysta licencja lub równoważny - 1 szt. Zadanie nr 2 - ACD Structure Design Siute - producent: Advenced Chemistry Development, INC., (ACD Labs) - wieczysta licencja lub równoważny - 1 szt. Zadanie nr 3 - ImaGene Nexus do analizy statystycznej - producent BioDiscovery- licencja miesięczna lub równoważny - 1 szt. Zadanie nr 4 - Nexus 5 Copy Number 1 - producent BioDiscovery - roczna pełna licencja lub równoważny - 1 szt. 2. Oferowany przez Wykonawcę przedmiot zamówienia ( oprogramowania ) musi spełniać parametry techniczne i użytkowe, możliwości zastosowania i funkcjonalności - zawarte w niniejszej SIWZ. 3. Zamawiający wymaga zaoferowania przedmiotu zamówienia nowego, kompletnego i gotowego do użycia ( tj. bez żadnych zbędnych i dodatkowych inwestycji). 4. Ilekroć w opisie przedmiotu zamówienia zawartym w SIWZ wskazane zostały normy , znaki towarowe, patenty lub pochodzenie, zamawiający dopuszcza rozwiązania równoważne. 5. Za ofertę równoważną Zamawiający uzna tę która spełnia wszystkie wymagania Zamawiającego określone w opisie przedmiotu zamówienia zawartym w rozdziale IV SIWZ 6. Ewentualne wskazanie przez Zamawiającego nazwy produktu lub nazwy producenta ma na celu, określenie klasy produktu będącego przedmiotem zamówienia i służy ustaleniu standardu; nie wskazują natomiast na konkretny wyrób lub konkretnego producenta. 7. Wykonawca który powoła się na rozwiązania równoważne jest zobowiązany wskazać że oferowany przez niego przedmiot zamówienia spełnia wymagania określone przez Zamawiającego. Szczegółowy opis przedmiotu zamówienia: Zadanie nr 1 - DIETA 4.0 wersja rozszerzona - producent: Zakład Żywności i Żywienia w Warszawie Zakład Epidemiologii i Żywienia lub równoważny 1. Program komputerowy z 2009, z 2010 r lub 2011 r. - Dieta 4.0 opracowany w Zakładzie Epidemiologii i Norm Żywienia, Instytutu Żywności i Żywienia lub równoważny. 2. Wymagania dotyczące programu: Program komputerowy DIETA 4.0 ma służyć do wyliczania wartości odżywczej i składu spożywanej diety oraz do planowania diety. 3. Baza programu winna zawierać aktualne informacje pochodzące m. in. z : 3.1. Tabel składu i wartości odżywczych żywności: Kunachowicz H., Nadolna I., Przygoda B., Iwanow K, PZWL, 2005. 3.2. Dieta bezglutenowa - co wybrać Wartość odżywcza produktów i potraw. Kunachowicz H. PZWL, 2001 3.3. Znowelizowanych Norm Żywienia Człowieka: Jarosz M., Bułhak-Jachymczyk B., PZWL, 2008, w których uwzględniono nowe poziomy zapotrzebowania uwzględniające poziom aktywności fizycznej oraz EAR, RDA, AI, UL . 4. Baza programu winna zawierać również: ponad 1300 suplementów diet aktualnie zarejestrowanych preparatów ponad 1700 potraw i produktów, w tym: - produkty wzbogacane - produkty bezglutenowe - wody mineralne - potrawy typu fast-food - odżywki dla dzieci - napoje energetyzujące i izotoniczne oraz nowe receptury potraw 5. Program winien posiadać możliwość wielu obliczeń statystycznych z uwzględnieniem nowych sposobów wyliczenia realizacji norm (metodą prawdopodobieństwa i punktów odcięcia) - wersja rozszerzona. 6. Program winien posiadać możliwość eksportowania danych indywidualnego spożycia. 7. Program winien umożliwiać pracę również w najnowszych systemach operacyjnych, VISTA i WINDOWS 7. 8. Program co najmniej jednostanowiskowy (jeden program na jeden komputer). 9. Minimalne warunki konieczne dla oprogramowania aby mogło być wykorzystywane do prac dydaktyki oraz naukowych to: 9. 1.Duża baza suplementów diety z możliwością aplikacyjną wykorzystania do oceny żywienia. 9. 2. Aktualna krajowa baza danych produktów, potraw i produktów specjalnego przeznaczenia. 9. 3. Możliwość eksportu danych np. do Excela, dBase itp. 9. 4.Obliczenia z uwzględnieniem najnowszych norm (EAR, AI, RDA, UL) 9. 5. Analiza danych metodą prawdopodobieństwa i punktów odcięcia. 10. Ponadto program winien umożliwiać obliczenie ilości składników odżywczych pochodzących : 10.1. tylko z produktów i potraw nie wzbogacanych, 10.2. tylko z produktów i potraw wzbogacanych 10.3. ze wszystkich produktów i potraw 10.4. z farmakologicznych preparatów witaminowych, mineralnych i mieszanych - witaminowo -mineralnych, 10.5. z produktów i potraw wzbogacanych oraz farmakologicznych preparatów witaminowych , mineralnych i mieszanych - witaminowo-mineralnych 10.6. pochodzących ze wszystkich źródeł łącznie. 11. Program komputerowy jest unikatowym programem komputerowym, winien służyć do oceny żywienia indywidualnego i grupowego, a także do planowania i bieżących analiz spożycia badanych grup ludności na tle norm żywienia. 12. Program winien umożliwiać obliczenia wartości energetycznej i odżywczej diet, a także wielkości spożycia produktów i potraw, porównanie obliczonej wartości odżywczej do norm z uwzględnieniem nowego podejścia do oceny dostateczności spożycia składników metodami prawdopodobieństwa i punktu odcięcia (6.1-6.5). 13. Program winien również do obliczania wartości odżywczej jadłospisów w żywieniu zbiorowym, projektowania i oceny stopnia realizacji modelowych diet, szacowania wartości odżywczej potraw bez uwzględniania, lub z uwzględnianiem wielkości strat technologicznych. 14.Dodatkowo program winien zapewnić: 14.1. standaryzację sposobu wprowadzanych danych o spożywanych produktach i potrawach (kolejność i dokładność określania rodzaju i składu potraw); 14.2. standaryzację receptur potraw; 14.3. standaryzację określania wielkości porcji (wybór wielkości porcji z zaproponowanych w programie); 14.4. Standaryzację sposobu obliczania (jednakowe wielkości redukcji) i uzyskiwanych wyników (liczba składników, porównanie z normami). 15. Programu winien w sposób wystandaryzowany przeprowadzić badanie sposobu żywienia w trakcie rozmowy z respondentem (osobą badaną), można również w wystandaryzowany sposób wprowadzić dane o spożyciu zebrane wcześniej metodą wywiadu lub zapisu spożycia oraz za pomocą innych metod, po dokonaniu odpowiednich transformacji. Program Dieta 4.0 umożliwia wprowadzenie nieograniczonej liczby wywiadów lub zapisów spożycia dla jednej osoby, nie limituje również liczebności badanych grup. 16. Program winien zawierać: 16.1. przeznaczenie i możliwości 16.2. początek pracy, użytkownicy i hasła dostępu 16.3. Tworzenie baz danych 16.4. Organizacja pracy z wieloma badaniami 16.5. Wprowadzanie wywiadów 16.6. Sposób wprowadzania danych o spożyciu i receptury potraw 16.7. Postępowanie w przypadku braku produktów lub potraw w bazie danych 16.8. Obliczanie ilości spożytych składników odżywczych w ciągu doby dla jednej osoby 16.9. Operacje na wynikach wywiadów zgromadzonych w bazach 16.10 Filtrowanie i tworzenie podzbioru 16.11.Analiza w grupach produktów 16.12.Eksport do EXCELA i dBase IV 16.13.Statystyka i wydruki 16.14.Analiza norm EAR, RDA, AI, UL 16.15.Analiza realizacji norm żywieniowych EAR, RDA, AI, UL w grupie 16.16.Bazy systemowe programu Dieta 4.0 16.17.rozwiązania przyjęte w bazach systemowych 16.18.Baza fotografii produktów i potraw 16.19.Baza wartości odżywczej produktów, potraw i farmakologicznych preparatów witaminowo-mineralnych 16.20. Baza norm żywienia Zadanie nr 2 -ACD/Structure Design Suite - producent: Advenced Chemistry Development, INC., (ACD Labs) lub równoważny 1.Program winien umożliwiać projektowanie struktury chemicznej związku pod kątem uzyskania pożądanych właściwości fizykochemicznych. 2.ACD/Structure Design Suite (SDS) będzie służyć jako narzędzie pozwalające na optymalizację właściwości fizykochemicznych substancji. 3.Program winien doradzać jakie podstawniki powinny być umieszczone w cząsteczce aby uzyskać pożądane właściwości fizykochemiczne. 4.SDS winien umożliwiać - badać wpływ poszczególnych podstawników i dopasować odpowiednio do potrzeb pKa, logP, logD rozpuszczalność w wodzie. Wszystkie sugerowane produkty są zapisywane i numerowane co ułatwia analizę uzyskanych wyników, na tak stworzonej bazie danych można przeprowadzać dodatkowe obliczenia. Funkcje Zaawansowany kreator prowadzący użytkownika przez program SDS Możliwość testowania wielu struktur z wykorzystaniem bazy podstawników (30 000 grup funkcyjnych) Import do 1000 struktur Przeprowadzenie obliczeń właściwości fizykochemicznych (LogP, LogD, pKa, rozpuszczalność) zaimportowanych struktur (z wykorzystaniem algorytmów ACD/Labs) Przeprowadzenie obliczeń właściwości cząsteczkowych (m.in. gęstość, objętość molowa, naruszenie reguł Lipińskiego) zaimportowanych struktur Graficzna analiza wyników Możliwość trenowania algorytmów wykorzystywanych do przewidywania właściwości fizykochemicznych w celu poprawy trafności przewidywań Integracja z programem ACD/ChemSketch Automatyczne nazywanie uzyskanych za pośrednictwem programu cząsteczek Lista obsługiwanych formatów Dostawca Format pliku ACD/Labs *.sk2 Adobe Acrobat (tylko zapis) *.pdf Symyx *.mol, *.sdf, *.rxn ChemDraw *.chm, *.cdx ISIS Sketch *.skc InChI SMILES Chemical Markup Language (tylko zapis) *.cml GIF image format *.gif PNG image format *.png JPG image format (tylko odczyt) *.jpg Windows Bitmap *.bmp, *.dib Paintbrush (tylko zapis) *.pcx TIFF Bitmap (tylko zapis) *.tif HTML (tylko zapis) *.html Windows Metafile *.wmf ChemSketch 1.0 (tylko odczyt) *.mst, *.rtp Zadanie nr 3 - ImaGene Nexus do analizy statystycznej - producent BioDiscovery lub równoważny Kryteria równoważności dla programu ImaGene Nexus Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy ekspresyjnych miRNA 1.Oprogramowanie obsługujące miRCURY LNA TM microRNA Array. 2.Możliwość integracji z zewnętrznymi, publicznymi bazami danych dla miRNA w bazie miRBase and TargetScan. 3.Oprogramowanie pozwalające na analizę obrazów tif. pochodzących ze zeskanowanych macierzy miRCURY LN TM MicroRNA. 4.Oprogramowanie pozwalające na ekstrakcję intensywności sygnału z mikromacierzy i równoczesną ich jakościową analizę statystyczną. 5.Oprogramowanie obliczające QC próbki. 6.Normalizacja i identyfikacja ulegających odmiennej ekspresji miRNA. 7.Oprogramowanie umożliwiające integrację danych fenotypowych z danymi klinicznymi. 8.Automatyczna identyfikacja regionów różniących się znacząco statystycznie pomiędzy populacjami próbek. 9.Analiza przeżywalności z wykreśleniem krzywych Kaplana- Meiera. 10.Analiza skupień - grupowanie próbek w oparciu o zmiany w ekspresji miRNA. 11.Identyfikacja zmian w genomie o cechach predykcyjnych, porównanie prób ze względu na cechy kliniczne analizowanej jednostki chorobowej, zmiany w ekspresji miRNA i czynniki wprowadzone bezpośrednio przez użytkownika, identyfikacja genów miRNA korelujących z DFS i czasem przeżycia. 12.Udzielona będzie licencja na 1 miesiąc użytkowania programu. Zadanie nr 4 - Nexus 5 Copy Number 1 - producent BioDiscovery - lub równoważny - 1 szt. Kryteria równoważności dla programu Nexus CopyNumber Specjalistyczne oprogramowanie do analizy mikromacierzy aCGH Parametry wymagane 1.Oprogramowanie obsługujące wszystkie obecnie znane typy mikromacierzy aCGH: Affymetrix, Agilent, Roche Nimble Gene, Gene Pix, ImaGene, macierze samodzielnie nadrukowane i inne. 2.Oprogramowanie pozwalające na analizę wyników dla wszystkich organizmów. 3.Oprogramowanie pozwalające na stosowanie techniki dye-swap 4.Możliwość analizy tysięcy macierzy w pojedynczym projekcie. 5.Oprogramowanie obliczające QC próbki. 6.Możliwość integracji z zewnętrznymi, publicznymi bazami danych (NCBI, UCSC, Google, Ensemble, DECIPHER) i z bazami samodzielnie stworzonymi. 7.Oprogramowanie umożliwiające integrację danych fenotypowych z danymi klinicznymi. 8.Automatyczna identyfikacja regionów różniących się znacząco statystycznie pomiędzy populacjami próbek. 9.Analiza przeżywalności z wykreśleniem krzywych Kaplana- Meiera. 10.Grupowanie próbek w oparciu o zmiany w genomie. 11.Możliwość analizy i wizualizacji SNP (single nucleotide polymorphism), CNV (copy number variation), LOH (loss of heterozygosity) uzyskanych z macierzy SNP i aCGH. 12.Integracja wyników uzyskanych z wykorzystaniem technik mikromacierzowych aCGH, ekspresji genów, ekspresji miRNA oraz metylacji genomu. 13.Dostęp do publicznych baz danych udostępnianych przez grupy badawcze z różnych laboratoriów na całym świecie, zajmujących się podobną tematyką. Możliwość porównania własnych wyników z wynikami uzyskanymi przez inne laboratoria. 14.Roczna licencja, w trakcie trwania licencji wsparcie i pomoc merytoryczna producenta programu. 15.Możliwość wysyłania otrzymanych wyników do producenta oprogramowania i analiza wyników online. Pomoc w interpretacji wyników (ocena jakościowa przeprowadzonego eksperymentu, określenie statusu (obecność/brak zmian genomowych) w jednym, wielu genach/regionach, miRNA we wszystkich analizowanych próbach, identyfikacja powszechnie występujących aberracji w genomie badanych prób, identyfikacja prób niosących podobne zmiany, identyfikacja genów i dróg przekazywania sygnału podlegających statystycznie częściej zmianom w grupie badanej, identyfikacja jednostek chorobowych, w których dochodzi do identycznych zmian jak w grupie analizowanej, identyfikacja zmian w genomie o cechach predykcyjnych, porównanie prób ze względu na cechy kliniczne, zmiany w obrębie regionów i czynniki wprowadzone bezpośrednio przez użytkownika, identyfikacja aberracji w obrębie regionów korelujących z DFS i czasem przeżycia). 16. Konieczność integracji z utworzonym formatem bazy danych (dane pacjentów, cechy kliniczne choroby) oraz z wynikami uzyskanymi we wcześniejszych badaniach z zastosowaniem macierzy aCGH (np. zidentyfikowane już aberracje o znaczeniu predykcyjnym, zmiany klasyfikujące próby na podgrupy itp). 17.Udzielona będzie licencja na 1 rok użytkowania programu.
II.4) Wspólny Słownik Zamówień (CPV):
48.46.30.00-1, 48.46.40.00-7, 48.46.20.00-4.
SEKCJA III: PROCEDURA
III.1) TRYB UDZIELENIA ZAMÓWIENIA:
Przetarg nieograniczony
III.2) INFORMACJE ADMINISTRACYJNE
Zamówienie dotyczy projektu/programu finansowanego ze środków Unii Europejskiej:
nie
SEKCJA IV: UDZIELENIE ZAMÓWIENIA
Część NR:
1
Nazwa:
ACD Structure Design Siute - producent: Advenced Chemistry Development, INC., (ACD/Labs) - wieczysta licencja lub równoważny - 1 szt.
IV.1) DATA UDZIELENIA ZAMÓWIENIA:
11.08.2011.
IV.2) LICZBA OTRZYMANYCH OFERT:
1.
IV.3) LICZBA ODRZUCONYCH OFERT:
0.
IV.4) NAZWA I ADRES WYKONAWCY, KTÓREMU UDZIELONO ZAMÓWIENIA:
- Makolab S. A., {Dane ukryte}, 93-430 Łódź, kraj/woj. łódzkie.
IV.5) Szacunkowa wartość zamówienia
(bez VAT): 5691,06 PLN.
IV.6) INFORMACJA O CENIE WYBRANEJ OFERTY ORAZ O OFERTACH Z NAJNIŻSZĄ I NAJWYŻSZĄ CENĄ
Cena wybranej oferty:
6628,72
Oferta z najniższą ceną:
6628,72
/ Oferta z najwyższą ceną:
6628,72
Waluta:
PLN.
Część NR:
2
Nazwa:
ImaGene Nexus do analizy statystycznej - producent BioDiscovery- licencja miesięczna lub równoważny - 1 szt
IV.1) DATA UDZIELENIA ZAMÓWIENIA:
11.08.2011.
IV.2) LICZBA OTRZYMANYCH OFERT:
1.
IV.3) LICZBA ODRZUCONYCH OFERT:
0.
IV.4) NAZWA I ADRES WYKONAWCY, KTÓREMU UDZIELONO ZAMÓWIENIA:
- Biomedica Poland Sp. z o.o., {Dane ukryte}, 05-500 Piaseczno, kraj/woj. mazowieckie.
IV.5) Szacunkowa wartość zamówienia
(bez VAT): 2182,11 PLN.
IV.6) INFORMACJA O CENIE WYBRANEJ OFERTY ORAZ O OFERTACH Z NAJNIŻSZĄ I NAJWYŻSZĄ CENĄ
Cena wybranej oferty:
2952,00
Oferta z najniższą ceną:
2952,00
/ Oferta z najwyższą ceną:
2952,00
Waluta:
PLN.
Część NR:
3
Nazwa:
Nexus 5 Copy Number 1 - producent BioDiscovery - roczna pełna licencja lub równoważny - 1 szt
IV.1) DATA UDZIELENIA ZAMÓWIENIA:
11.08.2011.
IV.2) LICZBA OTRZYMANYCH OFERT:
1.
IV.3) LICZBA ODRZUCONYCH OFERT:
0.
IV.4) NAZWA I ADRES WYKONAWCY, KTÓREMU UDZIELONO ZAMÓWIENIA:
- Syngen Biotech Sp. z o.o, {Dane ukryte}, 54-116 Wrocław, kraj/woj. dolnośląskie.
IV.5) Szacunkowa wartość zamówienia
(bez VAT): 34558,85 PLN.
IV.6) INFORMACJA O CENIE WYBRANEJ OFERTY ORAZ O OFERTACH Z NAJNIŻSZĄ I NAJWYŻSZĄ CENĄ
Cena wybranej oferty:
42250,50
Oferta z najniższą ceną:
42250,50
/ Oferta z najwyższą ceną:
42250,50
Waluta:
PLN.
Dane postępowania
ID postępowania BZP/TED: | 18974820110 |
---|---|
ID postępowania Zamawiającego: | |
Data publikacji zamówienia: | 2011-07-06 |
Rodzaj zamówienia: | dostawy |
Tryb& postępowania [PN]: | Przetarg nieograniczony |
Czas na realizację: | 7 dni |
Wadium: | - |
Oferty uzupełniające: | NIE |
Oferty częściowe: | TAK |
Oferty wariantowe: | NIE |
Przewidywana licyctacja: | NIE |
Ilość części: | 4 |
Kryterium ceny: | 0% |
WWW ogłoszenia: | www.am.lublin.pl |
Informacja dostępna pod: | 1) Uniwersytet Medyczny w Lublinie; Al. Racławickie 1, kod 20-059 2) Agnieszka Czajka, e mail: agnieszka.czajka@umlub.pl, tel. (81) 528-89-67, fax. (81) 528-89-54; |
Okres związania ofertą: | 30 dni |
Kody CPV
48462000-4 | Matematyczne lub prognozujące pakiety oprogramowania | |
48463000-1 | Pakiety oprogramowania statystycznego |
Wyniki
Nazwa części | Wykonawca | Data udzielenia | Wartość |
---|---|---|---|
ACD Structure Design Siute - producent: Advenced Chemistry Development, INC., (ACD/Labs) - wieczysta licencja lub równoważny - 1 szt. | Makolab S. A. Łódź | 2011-09-09 | 6 628,00 |
Barometr Ryzyka NadużyćRaport końcowy na temat potencjalnego ryzyka nadużyć dla wskazanej części wyniku postępowania przetargowego. Data udzielenia: 2011-09-09 Dotyczy cześci nr: 1 Kody CPV: 484630001 484640007 484620004 Ilość podmiotów składających się na wykonawcę: 1 Kwota oferty w PLN: 6 629,00 zł Minimalna złożona oferta: 6 629,00 zł Ilość złożonych ofert: 1 Ilość ofert odrzuconych przez zamawiającego: 0 Minimalna złożona oferta: 6 629,00 zł Maksymalna złożona oferta: 6 629,00 zł | |||
ImaGene Nexus do analizy statystycznej - producent BioDiscovery- licencja miesięczna lub równoważny - 1 szt | Biomedica Poland Sp. z o.o. Piaseczno | 2011-09-09 | 2 952,00 |
Barometr Ryzyka NadużyćRaport końcowy na temat potencjalnego ryzyka nadużyć dla wskazanej części wyniku postępowania przetargowego. Data udzielenia: 2011-09-09 Dotyczy cześci nr: 2 Kody CPV: 484630001 484640007 484620004 Ilość podmiotów składających się na wykonawcę: 1 Kwota oferty w PLN: 2 952,00 zł Minimalna złożona oferta: 2 952,00 zł Ilość złożonych ofert: 1 Ilość ofert odrzuconych przez zamawiającego: 0 Minimalna złożona oferta: 2 952,00 zł Maksymalna złożona oferta: 2 952,00 zł | |||
Nexus 5 Copy Number 1 - producent BioDiscovery - roczna pełna licencja lub równoważny - 1 szt | Syngen Biotech Sp. z o.o Wrocław | 2011-09-09 | 42 250,00 |
Barometr Ryzyka NadużyćRaport końcowy na temat potencjalnego ryzyka nadużyć dla wskazanej części wyniku postępowania przetargowego. Data udzielenia: 2011-09-09 Dotyczy cześci nr: 3 Kody CPV: 484630001 484640007 484620004 Ilość podmiotów składających się na wykonawcę: 1 Kwota oferty w PLN: 42 251,00 zł Minimalna złożona oferta: 42 251,00 zł Ilość złożonych ofert: 1 Ilość ofert odrzuconych przez zamawiającego: 0 Minimalna złożona oferta: 42 251,00 zł Maksymalna złożona oferta: 42 251,00 zł |